249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1172 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1172  Hly-III family protein  100 
 
 		 243 aa  481  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1243  Hly-III family protein  79.66 
 
 		 246 aa  386  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158656 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1888  Hly-III family protein  56.11 
 
 		 274 aa  229  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1055  Hly-III family protein  50.93 
 
 		 254 aa  218  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05120  channel protein, hemolysin III family  63.41 
 
 		 239 aa  218  7e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.297417  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  51.21 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  48.31 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  46.18 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1104  Hly-III family protein  52.89 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2630  Hly-III family protein  51.58 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.468291  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23050  predicted membrane protein, hemolysin III  50.97 
 
 		 276 aa  202  3e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  47.34 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0945  Hly-III family protein  47.7 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  50.92 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2335  Hly-III family protein  43.16 
 
 		 243 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126816  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  48.24 
 
 		 366 aa  186  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  42.61 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0767  hemolysin III-like membrane protein  45.93 
 
 		 314 aa  177  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00245971  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  42.99 
 
 		 305 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0439  Hly-III family protein  44.93 
 
 		 218 aa  172  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  43.75 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2054  hemolysin III family channel protein  42.86 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4663  hemolysin III family channel protein  42.61 
 
 		 243 aa  162  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4138  hemolysin III family channel protein  41.96 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4213  hemolysin III family channel protein  41.96 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4369  hemolysin III family channel protein  41.96 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0713  channel protein, hemolysin III family  42.92 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  42.38 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  40.81 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1355  putative hemolysin III-like membrane protein  43 
 
 		 285 aa  152  4e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.648452  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31590  channel protein, hemolysin III family  45.79 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1532  channel protein, hemolysin III family  43.33 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104876  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4414  channel protein, hemolysin III family  43.9 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11103  hemolysin-like protein  38.21 
 
 		 242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2817e-49  normal  0.398095 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1213  channel protein, hemolysin III family  41.83 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1283  channel protein, hemolysin III family  41.83 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1153  hemolysin III family channel protein  42.31 
 
 		 219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5041  hemolysin III family channel protein  36.21 
 
 		 270 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.45647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4658  hemolysin III family channel protein  35.8 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.096872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4746  hemolysin III family channel protein  35.8 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1200  hemolysin III family channel protein  39.61 
 
 		 217 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1656  channel protein, hemolysin III family  42.33 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5336  channel protein, hemolysin III family  39.7 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1523  hemolysin III family channel protein  39.52 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  32.56 
 
 		 215 aa  106  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  34.68 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  38.07 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  33.81 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  32.09 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  32.09 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  32.09 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3062  hemolysin III family channel protein  37.62 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  35.45 
 
 		 195 aa  102  6e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  35.45 
 
 		 195 aa  102  6e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  36.08 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  31.16 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  33.53 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  35.68 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  33.14 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  33.53 
 
 		 215 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  33.14 
 
 		 215 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  32.57 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  33.14 
 
 		 215 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  35.53 
 
 		 208 aa  99  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  36.14 
 
 		 216 aa  99  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  30.7 
 
 		 215 aa  98.2  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  35.11 
 
 		 192 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  35.68 
 
 		 214 aa  95.9  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  39.51 
 
 		 213 aa  95.9  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  30.85 
 
 		 214 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  33.33 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  33.93 
 
 		 215 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  30.64 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  36.17 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  36.7 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  36.7 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  36.9 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  36.7 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  36.7 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  36.7 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  36.7 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  36.7 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  36.7 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  32.53 
 
 		 216 aa  86.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  35.6 
 
 		 216 aa  85.5  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  36.13 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  36.13 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  36.13 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  36.13 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  35.29 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  36.13 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  36.13 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2710  Hly-III family protein  35 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0918513 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2441  hemolysin III family channel protein  32.21 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2325  hemolysin III family channel protein  33.15 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.988522  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  35.6 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2021  channel protein, hemolysin III family  32.21 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523934  hitchhiker  0.00605701 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2325  hemolysin III family channel protein  32.21 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  35.08 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2594  hemolysin III family channel protein  34.32 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.268239 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>