250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3776 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  100 
 
 
223 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  42.65 
 
 
215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  41.82 
 
 
232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  40.38 
 
 
215 aa  159  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  40.38 
 
 
215 aa  159  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  40.38 
 
 
215 aa  159  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  40.38 
 
 
215 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  40.38 
 
 
215 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  40.38 
 
 
215 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  40.38 
 
 
215 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  40.38 
 
 
215 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  46.07 
 
 
215 aa  158  5e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  40.38 
 
 
215 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  39.9 
 
 
215 aa  156  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  36.97 
 
 
217 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  39.52 
 
 
216 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  41.43 
 
 
215 aa  148  6e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  41.43 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  41.06 
 
 
214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  40 
 
 
213 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  37.56 
 
 
214 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  37.98 
 
 
216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  35.61 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2630  Hly-III family protein  33.02 
 
 
225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.468291  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  38.83 
 
 
205 aa  126  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1888  Hly-III family protein  37.71 
 
 
274 aa  126  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  34.54 
 
 
225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  34.36 
 
 
262 aa  125  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  38.68 
 
 
205 aa  125  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  37.87 
 
 
249 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4138  hemolysin III family channel protein  30.49 
 
 
247 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4213  hemolysin III family channel protein  30.49 
 
 
247 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370881  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4369  hemolysin III family channel protein  30.49 
 
 
247 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0042  channel protein, hemolysin III family  33.99 
 
 
230 aa  123  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4663  hemolysin III family channel protein  30.49 
 
 
243 aa  123  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  35.03 
 
 
225 aa  121  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  37.42 
 
 
195 aa  121  7e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2054  hemolysin III family channel protein  30.49 
 
 
250 aa  121  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5077  hemolysin III  35.61 
 
 
204 aa  121  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5292  HylII  34.95 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.976162  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  38.41 
 
 
195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1076  hemolysin III family channel protein  34.15 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  35.71 
 
 
366 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0945  Hly-III family protein  37.95 
 
 
250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0452  HylII  35.12 
 
 
204 aa  118  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  37.42 
 
 
192 aa  118  6e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  35.94 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2012  hemolysin III family channel protein  34.93 
 
 
226 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.203186 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  32 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  31.43 
 
 
305 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63900  putative hemolyin III  35.44 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  33.33 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  33.72 
 
 
270 aa  116  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5552  putative lipoprotein  40.74 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4860  hemolysin III family channel protein  34.95 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  0.0154668 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  32.14 
 
 
219 aa  115  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4986  hemolysin III family channel protein  35.5 
 
 
205 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0394739  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  35.68 
 
 
205 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0246  channel protein, hemolysin III family  29.95 
 
 
230 aa  115  7.999999999999999e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1055  Hly-III family protein  34.66 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  33.97 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0478  hemolysin III family channel protein  36 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5036  hemolysin III family channel protein  33.65 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406448  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2441  hemolysin III family channel protein  35.24 
 
 
227 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2021  channel protein, hemolysin III family  35.24 
 
 
227 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523934  hitchhiker  0.00605701 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  33.48 
 
 
215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3907  channel protein, hemolysin III family  35.35 
 
 
214 aa  112  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  30.99 
 
 
273 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  34.46 
 
 
215 aa  112  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2325  hemolysin III family channel protein  35.24 
 
 
227 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2594  hemolysin III family channel protein  32.16 
 
 
226 aa  111  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2325  hemolysin III family channel protein  34.76 
 
 
227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.988522  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2098  hemolysin III family channel protein  34.43 
 
 
236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2707  hemolysin-like protein  33.8 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  35.75 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  33.82 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  34.1 
 
 
214 aa  109  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  33.65 
 
 
215 aa  109  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23050  predicted membrane protein, hemolysin III  36.53 
 
 
276 aa  109  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1920  hemolysin III family channel protein  32.75 
 
 
227 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1532  channel protein, hemolysin III family  32.75 
 
 
218 aa  108  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104876  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2385  hemolysin III family channel protein  32.58 
 
 
249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.872491  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2171  hemolysin III  32.09 
 
 
213 aa  108  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.255778  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1862  hemolysin III family channel protein  34.55 
 
 
241 aa  108  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3370  hemolysin III family channel protein  36.1 
 
 
205 aa  108  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339431  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0839  hemolysin III family channel protein  33.02 
 
 
221 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0117  membrane protein  35.85 
 
 
233 aa  108  9.000000000000001e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5336  channel protein, hemolysin III family  38.82 
 
 
235 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  30.18 
 
 
257 aa  106  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5624  Hemolysin III family protein, channel protein  33.5 
 
 
205 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  30 
 
 
259 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  33.5 
 
 
206 aa  106  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  34.26 
 
 
214 aa  106  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002051  hypothetical protein  33.65 
 
 
217 aa  105  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  33.8 
 
 
214 aa  105  7e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1243  Hly-III family protein  36.94 
 
 
246 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158656 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  31.37 
 
 
208 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  33.03 
 
 
224 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  31.51 
 
 
233 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  34.62 
 
 
215 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>