247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4658 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4658  hemolysin III family channel protein  100 
 
 
270 aa  530  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.096872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4746  hemolysin III family channel protein  100 
 
 
270 aa  530  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5041  hemolysin III family channel protein  97.41 
 
 
270 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.45647  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1523  hemolysin III family channel protein  77.35 
 
 
200 aa  267  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2054  hemolysin III family channel protein  56.14 
 
 
250 aa  263  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4138  hemolysin III family channel protein  54.88 
 
 
247 aa  262  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4213  hemolysin III family channel protein  54.88 
 
 
247 aa  262  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370881  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4369  hemolysin III family channel protein  54.88 
 
 
247 aa  262  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4663  hemolysin III family channel protein  55.65 
 
 
243 aa  255  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11103  hemolysin-like protein  56.42 
 
 
242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2817e-49  normal  0.398095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0713  channel protein, hemolysin III family  54.09 
 
 
225 aa  225  7e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1532  channel protein, hemolysin III family  55.92 
 
 
218 aa  221  9e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104876  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  47.18 
 
 
270 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31590  channel protein, hemolysin III family  53.36 
 
 
229 aa  204  9e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  48.2 
 
 
225 aa  196  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4414  channel protein, hemolysin III family  53.81 
 
 
225 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  47.3 
 
 
225 aa  192  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  43.83 
 
 
305 aa  187  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  43.05 
 
 
273 aa  178  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1656  channel protein, hemolysin III family  50.23 
 
 
224 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  44.55 
 
 
268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0439  Hly-III family protein  45.24 
 
 
218 aa  172  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2335  Hly-III family protein  43.86 
 
 
243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126816  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2630  Hly-III family protein  42.41 
 
 
225 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.468291  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23050  predicted membrane protein, hemolysin III  39.42 
 
 
276 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1888  Hly-III family protein  42.51 
 
 
274 aa  151  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0945  Hly-III family protein  43.67 
 
 
250 aa  150  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  39.71 
 
 
221 aa  148  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  40.39 
 
 
366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1104  Hly-III family protein  43.16 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1055  Hly-III family protein  38.14 
 
 
254 aa  145  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  42.51 
 
 
262 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1243  Hly-III family protein  40 
 
 
246 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  44.08 
 
 
224 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  37.39 
 
 
249 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05120  channel protein, hemolysin III family  41.4 
 
 
239 aa  137  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.297417  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1172  Hly-III family protein  36.63 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1283  channel protein, hemolysin III family  42.65 
 
 
219 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1213  channel protein, hemolysin III family  42.65 
 
 
219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3062  hemolysin III family channel protein  43.4 
 
 
216 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1153  hemolysin III family channel protein  42.18 
 
 
219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0767  hemolysin III-like membrane protein  35.62 
 
 
314 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00245971  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5336  channel protein, hemolysin III family  38.79 
 
 
235 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1200  hemolysin III family channel protein  45.93 
 
 
217 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  34.02 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  34.26 
 
 
218 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1355  putative hemolysin III-like membrane protein  34.67 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.648452  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  32.51 
 
 
217 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  30.66 
 
 
215 aa  105  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  34.32 
 
 
215 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  33.64 
 
 
216 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  30.19 
 
 
215 aa  102  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  33.64 
 
 
215 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  29.33 
 
 
215 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  28.77 
 
 
215 aa  102  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  29.33 
 
 
215 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  28.77 
 
 
215 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  28.77 
 
 
215 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  29.33 
 
 
215 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  29.33 
 
 
215 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  28.77 
 
 
215 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  32.88 
 
 
216 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  35.67 
 
 
192 aa  99  8e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  35.67 
 
 
195 aa  98.6  9e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  34.36 
 
 
195 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1631  Hly-III family protein  34.29 
 
 
226 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  33.64 
 
 
213 aa  97.4  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  33.17 
 
 
208 aa  97.4  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  34.78 
 
 
259 aa  96.3  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3595  hemolysin III family channel protein  33.64 
 
 
216 aa  95.1  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1889  Hly-III family protein  33.81 
 
 
226 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  0.582334 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  32.69 
 
 
214 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0605  Hly-III family protein  36.1 
 
 
220 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0246  channel protein, hemolysin III family  34.68 
 
 
230 aa  93.6  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002051  hypothetical protein  28.85 
 
 
217 aa  92.8  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1608  Hly-III family protein  33.33 
 
 
226 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.60621  normal  0.167379 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  28.37 
 
 
233 aa  92.8  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  30.19 
 
 
257 aa  92  9e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  28.77 
 
 
208 aa  91.3  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1773  Hly-III family protein  34.95 
 
 
231 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2710  Hly-III family protein  31.71 
 
 
227 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0918513 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2864  Hly-III family protein  29.17 
 
 
239 aa  89.7  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.107423  normal  0.018726 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  23.53 
 
 
223 aa  89.7  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  28.37 
 
 
215 aa  89.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  26.05 
 
 
215 aa  89.4  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  28.37 
 
 
215 aa  89.4  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2594  hemolysin III family channel protein  34.1 
 
 
226 aa  89  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  33.33 
 
 
214 aa  89  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03334  hemolysin III  32.54 
 
 
220 aa  88.2  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  26.79 
 
 
215 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2479  putative hemolysin  31.18 
 
 
215 aa  87.8  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3940  Hly-III related proteins  32.52 
 
 
232 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0178087  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0114  hemolysin III family channel protein  30.96 
 
 
227 aa  85.9  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  27.48 
 
 
215 aa  85.9  7e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5366  Hly-III family protein  32.2 
 
 
230 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  29.6 
 
 
219 aa  85.5  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  29.21 
 
 
219 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3701  Hly-III related proteins  32.52 
 
 
232 aa  85.5  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  29.68 
 
 
214 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3388  Hly-III related proteins  30.43 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0217913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>