250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31590 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_31590  channel protein, hemolysin III family  100 
 
 		 229 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  64.02 
 
 		 270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0713  channel protein, hemolysin III family  65.4 
 
 		 225 aa  262  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4663  hemolysin III family channel protein  58.33 
 
 		 243 aa  255  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2054  hemolysin III family channel protein  56.41 
 
 		 250 aa  254  6e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  52.42 
 
 		 225 aa  247  9e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4138  hemolysin III family channel protein  52.74 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  52.42 
 
 		 225 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4213  hemolysin III family channel protein  52.74 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4369  hemolysin III family channel protein  52.74 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11103  hemolysin-like protein  58.69 
 
 		 242 aa  241  5e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2817e-49  normal  0.398095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  54.82 
 
 		 273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4414  channel protein, hemolysin III family  60.48 
 
 		 225 aa  229  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  55.76 
 
 		 305 aa  227  9e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1532  channel protein, hemolysin III family  55.56 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104876  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1656  channel protein, hemolysin III family  57.94 
 
 		 224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5041  hemolysin III family channel protein  53.18 
 
 		 270 aa  204  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.45647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4658  hemolysin III family channel protein  52.91 
 
 		 270 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.096872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4746  hemolysin III family channel protein  52.91 
 
 		 270 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  44.95 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1055  Hly-III family protein  46.4 
 
 		 254 aa  187  9e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  41.77 
 
 		 268 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2335  Hly-III family protein  42.06 
 
 		 243 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126816  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1523  hemolysin III family channel protein  55.68 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  46.63 
 
 		 262 aa  179  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  50.48 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0439  Hly-III family protein  45.54 
 
 		 218 aa  175  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1104  Hly-III family protein  49.08 
 
 		 246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1888  Hly-III family protein  43.86 
 
 		 274 aa  172  5e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1172  Hly-III family protein  45.79 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2630  Hly-III family protein  45 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.468291  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  43.56 
 
 		 366 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  43.72 
 
 		 249 aa  165  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1243  Hly-III family protein  43.46 
 
 		 246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158656 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23050  predicted membrane protein, hemolysin III  39.73 
 
 		 276 aa  159  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0945  Hly-III family protein  39.01 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5336  channel protein, hemolysin III family  44.93 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1283  channel protein, hemolysin III family  44.91 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1213  channel protein, hemolysin III family  44.91 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1153  hemolysin III family channel protein  44.59 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1200  hemolysin III family channel protein  48.52 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  37.44 
 
 		 216 aa  135  8e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  33.51 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  33.51 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  33.51 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  33.51 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  34.98 
 
 		 217 aa  128  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  31.94 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  32.73 
 
 		 232 aa  128  9.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  35.89 
 
 		 215 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  31.94 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05120  channel protein, hemolysin III family  43.27 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.297417  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  31.94 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  31.41 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3062  hemolysin III family channel protein  42.79 
 
 		 216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  31.41 
 
 		 215 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  33.65 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  41.46 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  31.41 
 
 		 215 aa  121  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  38.92 
 
 		 215 aa  121  9e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0767  hemolysin III-like membrane protein  37.74 
 
 		 314 aa  120  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00245971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  33.67 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  41.42 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  33.92 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  36.22 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  30.14 
 
 		 215 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  30.14 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  39.57 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1355  putative hemolysin III-like membrane protein  36.28 
 
 		 285 aa  112  7.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.648452  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  38.22 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  35.42 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  35.14 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  34.2 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  29.59 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0246  channel protein, hemolysin III family  35.08 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  31.61 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  36.56 
 
 		 214 aa  102  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  31.09 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  30.93 
 
 		 218 aa  101  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  31.53 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002051  hypothetical protein  32.64 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5552  putative lipoprotein  33.82 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  31.61 
 
 		 216 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  34.02 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  32.43 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  32.43 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  32.43 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  32.43 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  33.02 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  32.43 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  29.22 
 
 		 219 aa  99  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  29.22 
 
 		 219 aa  99  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  29.22 
 
 		 219 aa  99  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  31.63 
 
 		 214 aa  99  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  29.22 
 
 		 219 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  29.22 
 
 		 219 aa  99  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  29.22 
 
 		 219 aa  99  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  29.22 
 
 		 219 aa  99  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  29.22 
 
 		 219 aa  99  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  29.22 
 
 		 219 aa  99  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>