236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0767 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0767  hemolysin III-like membrane protein  100 
 
 
314 aa  640    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00245971  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1355  putative hemolysin III-like membrane protein  40.84 
 
 
285 aa  228  8e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.648452  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1888  Hly-III family protein  49.05 
 
 
274 aa  198  7.999999999999999e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2630  Hly-III family protein  50.72 
 
 
225 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.468291  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  44.64 
 
 
249 aa  189  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1055  Hly-III family protein  43.98 
 
 
254 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  44.78 
 
 
366 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05120  channel protein, hemolysin III family  48.17 
 
 
239 aa  182  9.000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.297417  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  44.02 
 
 
268 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  45.67 
 
 
262 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0945  Hly-III family protein  43.81 
 
 
250 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2335  Hly-III family protein  41.85 
 
 
243 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126816  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1172  Hly-III family protein  45.93 
 
 
243 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1243  Hly-III family protein  38.15 
 
 
246 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158656 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1104  Hly-III family protein  47.62 
 
 
246 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  42.44 
 
 
221 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23050  predicted membrane protein, hemolysin III  38.33 
 
 
276 aa  168  9e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  41.86 
 
 
224 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0439  Hly-III family protein  40.65 
 
 
218 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  33.45 
 
 
305 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  38.57 
 
 
273 aa  152  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  35.98 
 
 
270 aa  142  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  38.84 
 
 
225 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  39.62 
 
 
225 aa  135  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  37.44 
 
 
217 aa  132  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  40.74 
 
 
208 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  38.39 
 
 
232 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11103  hemolysin-like protein  34.6 
 
 
242 aa  123  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2817e-49  normal  0.398095 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  40.21 
 
 
218 aa  122  9e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  38.74 
 
 
195 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0713  channel protein, hemolysin III family  35.65 
 
 
225 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4663  hemolysin III family channel protein  33.18 
 
 
243 aa  119  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  38.22 
 
 
195 aa  117  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1283  channel protein, hemolysin III family  39.34 
 
 
219 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1153  hemolysin III family channel protein  40 
 
 
219 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2054  hemolysin III family channel protein  34.26 
 
 
250 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1213  channel protein, hemolysin III family  38.89 
 
 
219 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4658  hemolysin III family channel protein  38.29 
 
 
270 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.096872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4746  hemolysin III family channel protein  38.29 
 
 
270 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1200  hemolysin III family channel protein  41.63 
 
 
217 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5041  hemolysin III family channel protein  38.29 
 
 
270 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.45647  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  36.92 
 
 
192 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3062  hemolysin III family channel protein  36.49 
 
 
216 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1656  channel protein, hemolysin III family  39.39 
 
 
224 aa  112  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4138  hemolysin III family channel protein  31.05 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4213  hemolysin III family channel protein  31.05 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370881  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4369  hemolysin III family channel protein  31.05 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  36.99 
 
 
213 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1523  hemolysin III family channel protein  38.86 
 
 
200 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  37.88 
 
 
216 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1532  channel protein, hemolysin III family  34.84 
 
 
218 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104876  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4414  channel protein, hemolysin III family  32.44 
 
 
225 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  36.27 
 
 
215 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  37.13 
 
 
216 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  38.1 
 
 
214 aa  102  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  40.11 
 
 
215 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31590  channel protein, hemolysin III family  37.74 
 
 
229 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5336  channel protein, hemolysin III family  37.24 
 
 
235 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  32.86 
 
 
215 aa  92.4  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  33.02 
 
 
215 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  33.14 
 
 
223 aa  90.9  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04990  predicted membrane protein, hemolysin III  33.17 
 
 
228 aa  87.8  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.900042  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2864  Hly-III family protein  30.88 
 
 
239 aa  88.2  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.107423  normal  0.018726 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  32.2 
 
 
215 aa  85.9  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  32.2 
 
 
215 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  32.2 
 
 
215 aa  85.9  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  32.2 
 
 
215 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  31.92 
 
 
214 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  31.07 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  31.07 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  30.51 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  29.94 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  30.51 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  29.38 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46556  predicted protein  28.44 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000802712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3595  hemolysin III family channel protein  30.09 
 
 
216 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  26.87 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  31.07 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  29.47 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  33 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1319  hemolysin III, putative  33.33 
 
 
214 aa  71.6  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  32.37 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  32.37 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  29.13 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0042  channel protein, hemolysin III family  26.47 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  32.02 
 
 
214 aa  68.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  31.73 
 
 
216 aa  68.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  30.64 
 
 
218 aa  68.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  28.22 
 
 
208 aa  68.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  29.82 
 
 
219 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0640  channel protein, hemolysin III family  31.95 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03334  hemolysin III  29.13 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  31.63 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  30.54 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  30.49 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1223  hemolysin III family channel protein  29.54 
 
 
518 aa  66.6  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743924  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  29.26 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0618  hemolysin III-like protein  31.03 
 
 
225 aa  65.5  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.160524  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3370  hemolysin III family channel protein  31.71 
 
 
205 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339431  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  29.68 
 
 
216 aa  63.5  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>