250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46556 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_46556  predicted protein  100 
 
 
268 aa  544  1e-154  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000802712  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04990  predicted membrane protein, hemolysin III  48.43 
 
 
228 aa  187  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.900042  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2864  Hly-III family protein  46.02 
 
 
239 aa  187  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.107423  normal  0.018726 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  36.11 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  33.33 
 
 
217 aa  131  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  38.03 
 
 
216 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  36.24 
 
 
219 aa  118  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0049  hemolysin III  34.43 
 
 
215 aa  116  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0520  hemolysin like protein  36.4 
 
 
217 aa  116  5e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  34.98 
 
 
215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4986  hemolysin III family channel protein  35.27 
 
 
205 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0394739  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  33.99 
 
 
214 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  36.71 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4860  hemolysin III family channel protein  35.27 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  0.0154668 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  34.91 
 
 
216 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  36.97 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  36.36 
 
 
205 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0114  hemolysin III family channel protein  38.89 
 
 
227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0478  hemolysin III family channel protein  34.78 
 
 
205 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3103  channel protein, hemolysin III family  35.58 
 
 
205 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5036  hemolysin III family channel protein  34.78 
 
 
205 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406448  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  34.43 
 
 
215 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  34.43 
 
 
215 aa  112  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  34.43 
 
 
215 aa  112  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  34.43 
 
 
215 aa  112  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  35.71 
 
 
218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  37.14 
 
 
220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  34.53 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  34.29 
 
 
218 aa  110  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  33.33 
 
 
215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  32.52 
 
 
232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63900  putative hemolyin III  35.71 
 
 
205 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  36.62 
 
 
215 aa  109  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5077  hemolysin III  33.17 
 
 
204 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  33.8 
 
 
215 aa  109  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  35.47 
 
 
218 aa  109  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  35.71 
 
 
216 aa  108  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0099  hemolysin HylII family protein  33.81 
 
 
206 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  34.93 
 
 
206 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5552  putative lipoprotein  36.19 
 
 
205 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  35.24 
 
 
219 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  35.24 
 
 
219 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  35.24 
 
 
219 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  35.24 
 
 
219 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  35.24 
 
 
219 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  33.33 
 
 
215 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0452  HylII  32.21 
 
 
204 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  33.33 
 
 
215 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  33.33 
 
 
215 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  33.33 
 
 
215 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  34.43 
 
 
224 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5292  HylII  33.17 
 
 
205 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.976162  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3370  hemolysin III family channel protein  36.71 
 
 
205 aa  106  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339431  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  33.33 
 
 
215 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5210  HylII  35.58 
 
 
205 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611368  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  32.17 
 
 
257 aa  105  6e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2325  hemolysin III family channel protein  31.7 
 
 
227 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2738  channel protein, hemolysin III family  35.1 
 
 
205 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2021  channel protein, hemolysin III family  31.67 
 
 
227 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523934  hitchhiker  0.00605701 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  33.81 
 
 
219 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  33.81 
 
 
219 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  33.81 
 
 
219 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  33.81 
 
 
219 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5431  hemolysin III family channel protein  33.65 
 
 
206 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  33.81 
 
 
219 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  33.81 
 
 
219 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  33.81 
 
 
219 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4883  hemolysin III family channel protein  33.65 
 
 
206 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0623487  normal  0.221133 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  33.81 
 
 
219 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2325  hemolysin III family channel protein  31.67 
 
 
227 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.988522  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  33.81 
 
 
219 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2441  hemolysin III family channel protein  31.25 
 
 
227 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  33.49 
 
 
205 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  38.79 
 
 
366 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0157  HylII  37.5 
 
 
205 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002051  hypothetical protein  32.24 
 
 
217 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5624  Hemolysin III family protein, channel protein  33.65 
 
 
205 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5300  hemolysin III family channel protein  32.86 
 
 
206 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.503604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5560  hemolysin III family channel protein  32.86 
 
 
206 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4712  hemolysin III family channel protein  32.86 
 
 
206 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859483  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  32.11 
 
 
214 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  30.38 
 
 
270 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  35.47 
 
 
209 aa  103  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  29.87 
 
 
233 aa  102  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  32.71 
 
 
215 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  33.53 
 
 
273 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1862  hemolysin III family channel protein  31.43 
 
 
241 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  33.93 
 
 
305 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  32.38 
 
 
223 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1644  hemolysin III family channel protein  32.16 
 
 
218 aa  99.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000192122  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  31.66 
 
 
225 aa  99.4  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  35.07 
 
 
221 aa  99.4  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2479  putative hemolysin  34.68 
 
 
215 aa  99.4  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0662  hemolysin III  32.21 
 
 
206 aa  99  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.503531  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2390  hemolysin III  32.21 
 
 
206 aa  99  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0804  hemolysin III  32.21 
 
 
206 aa  99  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1179  hemolysin III  32.21 
 
 
206 aa  99  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1104  hemolysin III  32.21 
 
 
206 aa  99  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1768  hemolysin III  32.21 
 
 
206 aa  99  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0342  hemolysin III family channel protein  32.18 
 
 
219 aa  98.6  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.80447  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>