249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2594 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2594  hemolysin III family channel protein  100 
 
 		 226 aa  455  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2012  hemolysin III family channel protein  78.76 
 
 		 226 aa  365  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.203186 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2021  channel protein, hemolysin III family  69.6 
 
 		 227 aa  328  4e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523934  hitchhiker  0.00605701 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2325  hemolysin III family channel protein  69.6 
 
 		 227 aa  327  9e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.988522  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2325  hemolysin III family channel protein  69.6 
 
 		 227 aa  323  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2441  hemolysin III family channel protein  68.72 
 
 		 227 aa  322  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2098  hemolysin III family channel protein  67.37 
 
 		 236 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1920  hemolysin III family channel protein  65.35 
 
 		 227 aa  309  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1934  hemolysin III family channel protein  70.48 
 
 		 227 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.680237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1879  hemolysin III family channel protein  70.04 
 
 		 227 aa  300  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2099  hemolysin III family channel protein  68.72 
 
 		 227 aa  298  5e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0169079  normal  0.972179 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2385  hemolysin III family channel protein  69.44 
 
 		 249 aa  291  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.872491  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2447  hemolysin III family channel protein  71.03 
 
 		 217 aa  288  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1873  channel protein, hemolysin III family protein  67.58 
 
 		 227 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1862  hemolysin III family channel protein  57.73 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1768  hemolysin III family channel protein  57.33 
 
 		 235 aa  234  8e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000462203  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002051  hypothetical protein  49.29 
 
 		 217 aa  205  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  49.52 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  49.76 
 
 		 215 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  49.06 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  49.06 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  49.06 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  49.06 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  49.06 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  49.06 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  49.06 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  49.06 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  49.06 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  49.51 
 
 		 215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  48.53 
 
 		 215 aa  198  5e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  49.76 
 
 		 216 aa  198  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  48.11 
 
 		 219 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  48.11 
 
 		 219 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  48.11 
 
 		 219 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  48.11 
 
 		 219 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  48.11 
 
 		 219 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  48.31 
 
 		 218 aa  198  7e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0049  hemolysin III  47.62 
 
 		 215 aa  196  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  43.32 
 
 		 220 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  46.12 
 
 		 218 aa  190  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  44.91 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03143  putative hemolysin III  45.45 
 
 		 218 aa  187  9e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.902393  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3595  hemolysin III family channel protein  47.66 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2479  putative hemolysin  49.76 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  43.72 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  42.86 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1732  channel protein, hemolysin III family  45.93 
 
 		 214 aa  175  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.301086  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2066  hemolysin III family channel protein  43.15 
 
 		 218 aa  174  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000112411  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2171  hemolysin III  41.75 
 
 		 213 aa  174  8e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.255778  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2271  hemolysin III  43.15 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000142686  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2087  hemolysin III  43.15 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000145785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2027  hemolysin III  43.15 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000762716  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1644  hemolysin III family channel protein  43.15 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000192122  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2025  hemolysin III  43.15 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2268  hemolysin III  43.15 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03992e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2241  hemolysin III  43.15 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000273402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2224  hemolysin III  43.15 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000315085  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3100  hemolysin III  43.15 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147044  hitchhiker  5.80051e-16 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  42.31 
 
 		 214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2353  hemolysin III  43.15 
 
 		 218 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  41.26 
 
 		 216 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0870  hemolysin III family protein  44.65 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3838  hemolysin III family protein  44.65 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.69609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0873  hemolysin III family channel protein  46.36 
 
 		 233 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0720  hemolysin III  42.34 
 
 		 219 aa  169  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  40.49 
 
 		 209 aa  169  4e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  41.15 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0640  channel protein, hemolysin III family  43.15 
 
 		 205 aa  165  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  38.35 
 
 		 216 aa  164  9e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1550  channel protein, hemolysin III family  37.31 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561476  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  42.93 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  40.59 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  40.1 
 
 		 214 aa  158  8e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0342  hemolysin III family channel protein  39.52 
 
 		 219 aa  151  7e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.80447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0099  hemolysin HylII family protein  41.12 
 
 		 206 aa  151  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  37.56 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3326  hemolysin III family channel protein  40.48 
 
 		 219 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.605856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0246  channel protein, hemolysin III family  34.53 
 
 		 230 aa  149  5e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5300  hemolysin III family channel protein  40.1 
 
 		 206 aa  148  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.503604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5560  hemolysin III family channel protein  40.1 
 
 		 206 aa  148  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4712  hemolysin III family channel protein  40.1 
 
 		 206 aa  148  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  37.56 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0839  hemolysin III family channel protein  37.88 
 
 		 221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0114  hemolysin III family channel protein  35.87 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1076  hemolysin III family channel protein  40.69 
 
 		 208 aa  144  9e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4883  hemolysin III family channel protein  39.09 
 
 		 206 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0623487  normal  0.221133 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5431  hemolysin III family channel protein  39.09 
 
 		 206 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2707  hemolysin-like protein  37.67 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2317  hemolysin III  38.28 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.177004  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  33.04 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3247  hemolysin III family channel protein  37.56 
 
 		 206 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888973  normal  0.330902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5366  Hly-III family protein  37.74 
 
 		 230 aa  138  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0520  hemolysin like protein  35.51 
 
 		 217 aa  138  7.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3310  channel protein, hemolysin III family  36.55 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.837096 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  34.48 
 
 		 257 aa  135  4e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3907  channel protein, hemolysin III family  38.81 
 
 		 214 aa  135  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  36.63 
 
 		 208 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63900  putative hemolyin III  35.78 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0067  hemolysin III family channel protein  38.28 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  40.2 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>