249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1862 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1862  hemolysin III family channel protein  100 
 
 		 241 aa  481  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2385  hemolysin III family channel protein  61.23 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.872491  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2098  hemolysin III family channel protein  55.88 
 
 		 236 aa  258  8e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2325  hemolysin III family channel protein  55.17 
 
 		 227 aa  258  9e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2012  hemolysin III family channel protein  56 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.203186 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2441  hemolysin III family channel protein  56.95 
 
 		 227 aa  255  5e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2021  channel protein, hemolysin III family  59.24 
 
 		 227 aa  254  6e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523934  hitchhiker  0.00605701 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2325  hemolysin III family channel protein  56.95 
 
 		 227 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.988522  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1920  hemolysin III family channel protein  53.81 
 
 		 227 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2594  hemolysin III family channel protein  57.73 
 
 		 226 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1873  channel protein, hemolysin III family protein  57.08 
 
 		 227 aa  229  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2447  hemolysin III family channel protein  59.05 
 
 		 217 aa  219  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2099  hemolysin III family channel protein  55.84 
 
 		 227 aa  218  7e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0169079  normal  0.972179 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1934  hemolysin III family channel protein  55.84 
 
 		 227 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.680237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1879  hemolysin III family channel protein  55.84 
 
 		 227 aa  217  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1768  hemolysin III family channel protein  50.64 
 
 		 235 aa  208  8e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000462203  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  47.14 
 
 		 233 aa  201  9e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  50 
 
 		 215 aa  200  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  49.53 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  50.47 
 
 		 215 aa  198  7e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002051  hypothetical protein  49.52 
 
 		 217 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  50.94 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0049  hemolysin III  46.01 
 
 		 215 aa  191  7e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  51.46 
 
 		 219 aa  191  9e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  51.46 
 
 		 219 aa  191  9e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  51.46 
 
 		 219 aa  191  9e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  51.46 
 
 		 219 aa  191  9e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  51.46 
 
 		 219 aa  191  9e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  51.46 
 
 		 219 aa  191  9e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  51.46 
 
 		 219 aa  191  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  51.46 
 
 		 219 aa  191  9e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  50.72 
 
 		 219 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  50.72 
 
 		 219 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  50.72 
 
 		 219 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  50.72 
 
 		 219 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  51.46 
 
 		 219 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  50.72 
 
 		 219 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  51.94 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  48.58 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2066  hemolysin III family channel protein  45.37 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000112411  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1644  hemolysin III family channel protein  44.88 
 
 		 218 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000192122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2353  hemolysin III  44.88 
 
 		 218 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3838  hemolysin III family protein  48.26 
 
 		 233 aa  177  9e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.69609 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0870  hemolysin III family protein  48.26 
 
 		 233 aa  177  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2271  hemolysin III  44.88 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000142686  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2087  hemolysin III  44.88 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000145785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2027  hemolysin III  44.88 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000762716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2025  hemolysin III  44.88 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478415  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  42.79 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3100  hemolysin III  44.88 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147044  hitchhiker  5.80051e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2241  hemolysin III  44.88 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000273402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2224  hemolysin III  44.88 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000315085  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2268  hemolysin III  44.88 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03992e-35 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  42.59 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0873  hemolysin III family channel protein  47.83 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  44.61 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0720  hemolysin III  45.21 
 
 		 219 aa  175  7e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2479  putative hemolysin  48.34 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0114  hemolysin III family channel protein  43.75 
 
 		 227 aa  171  7.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  42.18 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03143  putative hemolysin III  42.59 
 
 		 218 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.902393  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  40.28 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2171  hemolysin III  40.2 
 
 		 213 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.255778  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1732  channel protein, hemolysin III family  44.71 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.301086  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  40.58 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  41.31 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3595  hemolysin III family channel protein  43.81 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  40.69 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0342  hemolysin III family channel protein  41.51 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.80447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  40.89 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  38.65 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  35.8 
 
 		 257 aa  151  8e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  42.13 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  41.67 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0640  channel protein, hemolysin III family  43.65 
 
 		 205 aa  148  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0246  channel protein, hemolysin III family  36.61 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1076  hemolysin III family channel protein  42.29 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  39.71 
 
 		 220 aa  143  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3326  hemolysin III family channel protein  42.21 
 
 		 219 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.605856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1550  channel protein, hemolysin III family  36.87 
 
 		 211 aa  139  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561476  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  35.27 
 
 		 259 aa  139  6e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  36.67 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2707  hemolysin-like protein  39.39 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0839  hemolysin III family channel protein  38.31 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5366  Hly-III family protein  40.57 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1223  hemolysin III family channel protein  37.39 
 
 		 518 aa  136  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743924  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2317  hemolysin III  38.1 
 
 		 217 aa  135  8e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.177004  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3907  channel protein, hemolysin III family  39.7 
 
 		 214 aa  132  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03334  hemolysin III  37.93 
 
 		 220 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  36.14 
 
 		 205 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0068  hemolysin III family channel protein  41.67 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0067  hemolysin III family channel protein  41.67 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0099  hemolysin HylII family protein  39.11 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0867  Hly-III family protein  39.63 
 
 		 222 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.296032  normal  0.935947 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3388  Hly-III related proteins  36.28 
 
 		 224 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0217913  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0078  Hly-III family protein  41.18 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2710  Hly-III family protein  39.51 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0918513 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63900  putative hemolyin III  38.42 
 
 		 205 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  36.18 
 
 		 208 aa  126  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5431  hemolysin III family channel protein  37.68 
 
 		 206 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>