251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0223 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  100 
 
 
195 aa  384  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  99.49 
 
 
195 aa  380  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  94.79 
 
 
192 aa  362  3e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  44.69 
 
 
218 aa  143  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0945  Hly-III family protein  43.37 
 
 
250 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  40.31 
 
 
262 aa  141  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  38.38 
 
 
214 aa  138  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2630  Hly-III family protein  41.62 
 
 
225 aa  136  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.468291  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  42.86 
 
 
249 aa  135  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  42.68 
 
 
215 aa  135  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  42.93 
 
 
268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  42.94 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1888  Hly-III family protein  39.89 
 
 
274 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2335  Hly-III family protein  40.12 
 
 
243 aa  130  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126816  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0439  Hly-III family protein  40.1 
 
 
218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23050  predicted membrane protein, hemolysin III  41.57 
 
 
276 aa  129  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  39.18 
 
 
232 aa  129  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  42.6 
 
 
215 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  42.04 
 
 
217 aa  125  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  40.99 
 
 
366 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  41.52 
 
 
270 aa  125  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  43.23 
 
 
208 aa  123  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  36.9 
 
 
221 aa  123  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1104  Hly-III family protein  40.35 
 
 
246 aa  122  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  40.37 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  38.41 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  40 
 
 
224 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1055  Hly-III family protein  37.31 
 
 
254 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  41.53 
 
 
214 aa  119  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  39.55 
 
 
225 aa  118  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  36.7 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0767  hemolysin III-like membrane protein  38.22 
 
 
314 aa  117  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00245971  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2864  Hly-III family protein  36.9 
 
 
239 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.107423  normal  0.018726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  35.67 
 
 
273 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  41.36 
 
 
216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  36.84 
 
 
305 aa  114  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0713  channel protein, hemolysin III family  37.43 
 
 
225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1243  Hly-III family protein  37.57 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158656 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1200  hemolysin III family channel protein  38.6 
 
 
217 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  35.79 
 
 
215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  35.79 
 
 
215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1153  hemolysin III family channel protein  37.7 
 
 
219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  34.22 
 
 
215 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  35.79 
 
 
215 aa  108  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  34.22 
 
 
215 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  34.22 
 
 
215 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  33.17 
 
 
215 aa  108  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  34.74 
 
 
215 aa  108  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  33.17 
 
 
215 aa  108  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  34.22 
 
 
215 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04990  predicted membrane protein, hemolysin III  35.2 
 
 
228 aa  107  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.900042  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  35.79 
 
 
215 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1283  channel protein, hemolysin III family  39.29 
 
 
219 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1213  channel protein, hemolysin III family  39.29 
 
 
219 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4414  channel protein, hemolysin III family  39.77 
 
 
225 aa  105  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  35.26 
 
 
215 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5336  channel protein, hemolysin III family  35.06 
 
 
235 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1172  Hly-III family protein  35.45 
 
 
243 aa  102  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  36.32 
 
 
259 aa  100  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  32.98 
 
 
216 aa  99.8  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1532  channel protein, hemolysin III family  36.59 
 
 
218 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104876  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0342  hemolysin III family channel protein  38.3 
 
 
219 aa  100  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.80447  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1523  hemolysin III family channel protein  35.48 
 
 
200 aa  99  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4138  hemolysin III family channel protein  34.54 
 
 
247 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4213  hemolysin III family channel protein  34.54 
 
 
247 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370881  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4663  hemolysin III family channel protein  34.02 
 
 
243 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4369  hemolysin III family channel protein  34.54 
 
 
247 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1076  hemolysin III family channel protein  36.97 
 
 
208 aa  98.2  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  36.08 
 
 
218 aa  97.1  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  32.14 
 
 
206 aa  97.1  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4658  hemolysin III family channel protein  35.09 
 
 
270 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.096872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4746  hemolysin III family channel protein  35.09 
 
 
270 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2054  hemolysin III family channel protein  33.69 
 
 
250 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0720  hemolysin III  37.16 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  31.89 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46556  predicted protein  34.21 
 
 
268 aa  96.3  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000802712  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  32.99 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0640  channel protein, hemolysin III family  35.8 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5041  hemolysin III family channel protein  34.5 
 
 
270 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.45647  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  36.79 
 
 
215 aa  95.9  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2479  putative hemolysin  37.13 
 
 
215 aa  95.1  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  31.44 
 
 
220 aa  95.1  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  33.16 
 
 
215 aa  94.7  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  35.05 
 
 
219 aa  94  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  35.05 
 
 
219 aa  94  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  35.05 
 
 
219 aa  94  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  35.05 
 
 
219 aa  94  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  35.05 
 
 
219 aa  94  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  35.05 
 
 
219 aa  94  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  31.91 
 
 
214 aa  94  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  35.05 
 
 
219 aa  94  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  32.82 
 
 
214 aa  94  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  35.05 
 
 
219 aa  94  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1656  channel protein, hemolysin III family  34.91 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  35.05 
 
 
219 aa  94  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11103  hemolysin-like protein  34.27 
 
 
242 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2817e-49  normal  0.398095 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  33.16 
 
 
215 aa  93.2  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  32.98 
 
 
257 aa  91.3  8e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  34.55 
 
 
233 aa  91.3  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002051  hypothetical protein  32.09 
 
 
217 aa  90.9  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>