251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0949 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  100 
 
 		 270 aa  543  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  60.38 
 
 		 225 aa  261  6.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  60.85 
 
 		 225 aa  261  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31590  channel protein, hemolysin III family  64.02 
 
 		 229 aa  251  8.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2054  hemolysin III family channel protein  56.19 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4663  hemolysin III family channel protein  51.85 
 
 		 243 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  56.48 
 
 		 305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  55.35 
 
 		 273 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4138  hemolysin III family channel protein  55.19 
 
 		 247 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4213  hemolysin III family channel protein  55.19 
 
 		 247 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4369  hemolysin III family channel protein  55.19 
 
 		 247 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11103  hemolysin-like protein  55.87 
 
 		 242 aa  229  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2817e-49  normal  0.398095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0713  channel protein, hemolysin III family  55.56 
 
 		 225 aa  226  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1532  channel protein, hemolysin III family  55.66 
 
 		 218 aa  225  7e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104876  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4414  channel protein, hemolysin III family  53.27 
 
 		 225 aa  206  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  50 
 
 		 224 aa  195  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1055  Hly-III family protein  42.62 
 
 		 254 aa  192  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4658  hemolysin III family channel protein  47.79 
 
 		 270 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.096872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4746  hemolysin III family channel protein  47.79 
 
 		 270 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2335  Hly-III family protein  48.1 
 
 		 243 aa  191  8e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126816  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5041  hemolysin III family channel protein  45.69 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.45647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1656  channel protein, hemolysin III family  51.66 
 
 		 224 aa  189  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  47.57 
 
 		 221 aa  188  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  44.76 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  45.27 
 
 		 366 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  45.89 
 
 		 262 aa  179  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1888  Hly-III family protein  46.38 
 
 		 274 aa  178  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1523  hemolysin III family channel protein  56.17 
 
 		 200 aa  176  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2630  Hly-III family protein  46.63 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.468291  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23050  predicted membrane protein, hemolysin III  46.15 
 
 		 276 aa  171  9e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1104  Hly-III family protein  49.28 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1172  Hly-III family protein  43.75 
 
 		 243 aa  169  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  44.23 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0439  Hly-III family protein  41.31 
 
 		 218 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0945  Hly-III family protein  45.37 
 
 		 250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1243  Hly-III family protein  37.7 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158656 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1153  hemolysin III family channel protein  49.53 
 
 		 219 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1283  channel protein, hemolysin III family  48.57 
 
 		 219 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1213  channel protein, hemolysin III family  48.57 
 
 		 219 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0767  hemolysin III-like membrane protein  35.98 
 
 		 314 aa  142  4e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00245971  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5336  channel protein, hemolysin III family  47.02 
 
 		 235 aa  142  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05120  channel protein, hemolysin III family  39.06 
 
 		 239 aa  137  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.297417  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  36.89 
 
 		 217 aa  135  9e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3062  hemolysin III family channel protein  42.16 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1200  hemolysin III family channel protein  47.34 
 
 		 217 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  39.18 
 
 		 215 aa  131  9e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  41.52 
 
 		 195 aa  125  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  41.52 
 
 		 195 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  36.76 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04990  predicted membrane protein, hemolysin III  35.91 
 
 		 228 aa  123  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.900042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1355  putative hemolysin III-like membrane protein  37.95 
 
 		 285 aa  122  8e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.648452  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  36.75 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  36.72 
 
 		 232 aa  119  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  37.87 
 
 		 215 aa  119  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  30.66 
 
 		 215 aa  119  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  39.18 
 
 		 192 aa  119  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2864  Hly-III family protein  35.32 
 
 		 239 aa  118  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.107423  normal  0.018726 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  30.66 
 
 		 215 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  42.68 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  33.72 
 
 		 223 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  33.93 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  33.93 
 
 		 215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  33.93 
 
 		 215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  33.93 
 
 		 215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  32.74 
 
 		 215 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  32.74 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  33.93 
 
 		 215 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  32.74 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  32.14 
 
 		 215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3940  Hly-III related proteins  33.19 
 
 		 232 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0178087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  33.72 
 
 		 214 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1773  Hly-III family protein  33.19 
 
 		 231 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  36.6 
 
 		 214 aa  112  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  32.14 
 
 		 215 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3701  Hly-III related proteins  32.3 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  38.97 
 
 		 213 aa  110  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  38.27 
 
 		 208 aa  109  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  32.54 
 
 		 218 aa  105  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3388  Hly-III related proteins  31.31 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0217913  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46556  predicted protein  30.38 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000802712  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  34.36 
 
 		 259 aa  102  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2710  Hly-III family protein  36.1 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0918513 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  34.02 
 
 		 215 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  33.51 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  33.33 
 
 		 219 aa  99.4  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0246  channel protein, hemolysin III family  35.54 
 
 		 230 aa  99  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  34.5 
 
 		 220 aa  98.6  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  30.05 
 
 		 208 aa  98.2  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0049  hemolysin III  31.95 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  33.93 
 
 		 209 aa  96.3  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1631  Hly-III family protein  34.27 
 
 		 226 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1608  Hly-III family protein  33.8 
 
 		 226 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.60621  normal  0.167379 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1889  Hly-III family protein  33.8 
 
 		 226 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  0.582334 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  31.25 
 
 		 219 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  31.25 
 
 		 219 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  31.25 
 
 		 219 aa  95.1  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  31.25 
 
 		 219 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  31.07 
 
 		 205 aa  95.1  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  31.25 
 
 		 219 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  30.37 
 
 		 216 aa  94.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>