250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0549 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  100 
 
 		 213 aa  412  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  50.76 
 
 		 218 aa  167  8e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  44.12 
 
 		 214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  46.89 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  41.15 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  41.75 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  45.15 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  39.07 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  40 
 
 		 215 aa  152  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  40 
 
 		 215 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  40 
 
 		 215 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  38.6 
 
 		 215 aa  151  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  38.6 
 
 		 215 aa  150  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  40.09 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  38.68 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  39.62 
 
 		 215 aa  148  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  42.29 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  39.61 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  45.13 
 
 		 208 aa  145  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  44.44 
 
 		 216 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  40 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2335  Hly-III family protein  50 
 
 		 243 aa  142  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126816  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  45.59 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  44.44 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  43.55 
 
 		 366 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  45.1 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  42.94 
 
 		 192 aa  134  9e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  42.94 
 
 		 195 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  42.94 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  46.43 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0945  Hly-III family protein  42.01 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  40.24 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  37 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  44.5 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  39.05 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  43.82 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  43.79 
 
 		 225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  40.94 
 
 		 221 aa  118  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  35.41 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  40 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0640  channel protein, hemolysin III family  43.41 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  46.24 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  42.01 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  37.68 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3907  channel protein, hemolysin III family  36.45 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2630  Hly-III family protein  41.57 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.468291  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  37.62 
 
 		 218 aa  114  8.999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0439  Hly-III family protein  40.91 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  42.57 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  38.81 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3370  hemolysin III family channel protein  43.21 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339431  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  36.19 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  36.19 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  36.19 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  36.19 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  36.19 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  36.19 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  36.19 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  36.19 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3310  channel protein, hemolysin III family  41.54 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.837096 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  36.06 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  36.19 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0839  hemolysin III family channel protein  38.65 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  38.31 
 
 		 224 aa  111  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0649  putative hemolysin HylII  41.54 
 
 		 206 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.426321 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  37.62 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  37.62 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0662  hemolysin III  41.03 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.503531  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  39.05 
 
 		 205 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2390  hemolysin III  41.03 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  37.62 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  39.11 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0767  hemolysin III-like membrane protein  36.99 
 
 		 314 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00245971  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1223  hemolysin III family channel protein  40.78 
 
 		 518 aa  110  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743924  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2171  hemolysin III  33.17 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.255778  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  36.63 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  37.62 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  37.62 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0804  hemolysin III  41.03 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1179  hemolysin III  41.03 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1104  hemolysin III  41.03 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1768  hemolysin III  41.03 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5077  hemolysin III  38.05 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1597  hemolysin III  40.51 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4712  hemolysin III family channel protein  41.03 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5300  hemolysin III family channel protein  41.03 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.503604  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2864  Hly-III family protein  35.92 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.107423  normal  0.018726 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4883  hemolysin III family channel protein  41.41 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0623487  normal  0.221133 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5560  hemolysin III family channel protein  41.03 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2012  hemolysin III family channel protein  34.63 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.203186 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  38.97 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3247  hemolysin III family channel protein  41.54 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888973  normal  0.330902 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5431  hemolysin III family channel protein  41.41 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2098  hemolysin III family channel protein  36.82 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0720  hemolysin III  34.63 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5292  HylII  37.44 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.976162  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0452  HylII  36.97 
 
 		 204 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1532  channel protein, hemolysin III family  40.24 
 
 		 218 aa  108  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104876  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1644  hemolysin III family channel protein  38.94 
 
 		 218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000192122  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1200  hemolysin III family channel protein  44.17 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>