247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1104 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1104  Hly-III family protein  100 
 
 		 246 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  63.11 
 
 		 262 aa  258  8e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0945  Hly-III family protein  61.88 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  56.1 
 
 		 249 aa  257  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2630  Hly-III family protein  62.67 
 
 		 225 aa  256  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.468291  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1888  Hly-III family protein  54.12 
 
 		 274 aa  254  6e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1055  Hly-III family protein  55.56 
 
 		 254 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  53.88 
 
 		 221 aa  243  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23050  predicted membrane protein, hemolysin III  60.78 
 
 		 276 aa  242  3.9999999999999997e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2335  Hly-III family protein  53.81 
 
 		 243 aa  237  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126816  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  49.79 
 
 		 268 aa  225  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1243  Hly-III family protein  51.25 
 
 		 246 aa  221  8e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158656 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  55.84 
 
 		 366 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  54.3 
 
 		 224 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1172  Hly-III family protein  52.89 
 
 		 243 aa  218  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  48.93 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  50.89 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  50.92 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05120  channel protein, hemolysin III family  52.61 
 
 		 239 aa  195  6e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.297417  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  49.08 
 
 		 225 aa  195  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0439  Hly-III family protein  49.27 
 
 		 218 aa  195  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2054  hemolysin III family channel protein  42.86 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0767  hemolysin III-like membrane protein  47.62 
 
 		 314 aa  187  9e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00245971  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4663  hemolysin III family channel protein  44.92 
 
 		 243 aa  187  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  49.28 
 
 		 270 aa  184  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4138  hemolysin III family channel protein  40.32 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4213  hemolysin III family channel protein  40.32 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4369  hemolysin III family channel protein  40.32 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31590  channel protein, hemolysin III family  49.31 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1355  putative hemolysin III-like membrane protein  45.33 
 
 		 285 aa  167  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.648452  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0713  channel protein, hemolysin III family  47.71 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1532  channel protein, hemolysin III family  45.71 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104876  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11103  hemolysin-like protein  43.41 
 
 		 242 aa  161  7e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2817e-49  normal  0.398095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4414  channel protein, hemolysin III family  46.19 
 
 		 225 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4658  hemolysin III family channel protein  44.02 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.096872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4746  hemolysin III family channel protein  44.02 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5041  hemolysin III family channel protein  42.74 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.45647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1656  channel protein, hemolysin III family  48.43 
 
 		 224 aa  142  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1523  hemolysin III family channel protein  46.11 
 
 		 200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3062  hemolysin III family channel protein  44.44 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5336  channel protein, hemolysin III family  43.88 
 
 		 235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1213  channel protein, hemolysin III family  45.19 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1283  channel protein, hemolysin III family  45.19 
 
 		 219 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  36.78 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  35.63 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  36.78 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  36.78 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1153  hemolysin III family channel protein  45.67 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1200  hemolysin III family channel protein  46.19 
 
 		 217 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  35.63 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  33.17 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  36.87 
 
 		 215 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  35.63 
 
 		 215 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  35.06 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  40 
 
 		 195 aa  122  4e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  48.1 
 
 		 218 aa  122  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  34.48 
 
 		 215 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  40 
 
 		 195 aa  122  6e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  38.95 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  43.48 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  40.12 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  41.46 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  44.72 
 
 		 215 aa  111  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  35.68 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  38.04 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  31.55 
 
 		 215 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  31.55 
 
 		 215 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  43.9 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2864  Hly-III family protein  32.48 
 
 		 239 aa  99  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.107423  normal  0.018726 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  41.1 
 
 		 214 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  29.52 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  39.53 
 
 		 215 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  29.11 
 
 		 214 aa  95.1  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04990  predicted membrane protein, hemolysin III  32.16 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.900042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2594  hemolysin III family channel protein  33.55 
 
 		 226 aa  89  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0720  hemolysin III  30.93 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2385  hemolysin III family channel protein  36.73 
 
 		 249 aa  86.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.872491  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  37.17 
 
 		 214 aa  85.9  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  33.85 
 
 		 259 aa  85.5  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  36.65 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  36.08 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  32.41 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1920  hemolysin III family channel protein  34.46 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  33.73 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  35.42 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  30 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2441  hemolysin III family channel protein  34.78 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  35.42 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  35.42 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  35.42 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  35.42 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  35.42 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  35.42 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2021  channel protein, hemolysin III family  34.78 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523934  hitchhiker  0.00605701 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2325  hemolysin III family channel protein  34.78 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.988522  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  35.42 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0067  hemolysin III family channel protein  39.08 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  35.42 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2325  hemolysin III family channel protein  34.78 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  34.57 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>