250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2054 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2054  hemolysin III family channel protein  100 
 
 
250 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4663  hemolysin III family channel protein  92.59 
 
 
243 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4138  hemolysin III family channel protein  84.87 
 
 
247 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4213  hemolysin III family channel protein  84.87 
 
 
247 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370881  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4369  hemolysin III family channel protein  84.87 
 
 
247 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11103  hemolysin-like protein  69.26 
 
 
242 aa  334  5.999999999999999e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2817e-49  normal  0.398095 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  56.6 
 
 
225 aa  244  9e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0713  channel protein, hemolysin III family  56.19 
 
 
225 aa  244  9e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  54.72 
 
 
225 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5041  hemolysin III family channel protein  56.58 
 
 
270 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.45647  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4658  hemolysin III family channel protein  56.14 
 
 
270 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.096872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4746  hemolysin III family channel protein  56.14 
 
 
270 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1532  channel protein, hemolysin III family  59.9 
 
 
218 aa  236  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104876  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  56.19 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  50.22 
 
 
305 aa  229  4e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31590  channel protein, hemolysin III family  56.41 
 
 
229 aa  228  7e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  48.76 
 
 
273 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1523  hemolysin III family channel protein  60.66 
 
 
200 aa  219  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1656  channel protein, hemolysin III family  56.19 
 
 
224 aa  215  5.9999999999999996e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4414  channel protein, hemolysin III family  54.76 
 
 
225 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  45.78 
 
 
268 aa  193  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0439  Hly-III family protein  48.02 
 
 
218 aa  185  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  41.83 
 
 
249 aa  179  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1055  Hly-III family protein  44.12 
 
 
254 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1104  Hly-III family protein  42.08 
 
 
246 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2630  Hly-III family protein  44.84 
 
 
225 aa  174  8e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.468291  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2335  Hly-III family protein  44.29 
 
 
243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126816  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1888  Hly-III family protein  39.06 
 
 
274 aa  172  5.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23050  predicted membrane protein, hemolysin III  39.76 
 
 
276 aa  169  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  44.76 
 
 
262 aa  169  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  43.35 
 
 
366 aa  168  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  41.89 
 
 
221 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1172  Hly-III family protein  42.86 
 
 
243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1243  Hly-III family protein  40 
 
 
246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  44 
 
 
224 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0945  Hly-III family protein  42.41 
 
 
250 aa  153  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5336  channel protein, hemolysin III family  41.59 
 
 
235 aa  142  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05120  channel protein, hemolysin III family  42.38 
 
 
239 aa  137  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.297417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1213  channel protein, hemolysin III family  44.33 
 
 
219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1283  channel protein, hemolysin III family  44.33 
 
 
219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1200  hemolysin III family channel protein  45.05 
 
 
217 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1153  hemolysin III family channel protein  43.84 
 
 
219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  31.88 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  32.85 
 
 
215 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  32.85 
 
 
215 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  32.85 
 
 
215 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  32.85 
 
 
215 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3062  hemolysin III family channel protein  41.87 
 
 
216 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  32.37 
 
 
215 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  31.4 
 
 
215 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  32.78 
 
 
259 aa  122  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  30.92 
 
 
215 aa  122  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  30.92 
 
 
215 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  30.43 
 
 
215 aa  122  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  30.49 
 
 
223 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  31.53 
 
 
232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  33.33 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0767  hemolysin III-like membrane protein  34.26 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00245971  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  30.7 
 
 
215 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  30.7 
 
 
215 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  34.45 
 
 
215 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  36.59 
 
 
218 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  36.09 
 
 
215 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  30.62 
 
 
208 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0246  channel protein, hemolysin III family  37.79 
 
 
230 aa  107  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  34.04 
 
 
216 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  36.82 
 
 
214 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1355  putative hemolysin III-like membrane protein  33.65 
 
 
285 aa  103  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.648452  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  39.16 
 
 
213 aa  103  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  38.65 
 
 
257 aa  102  4e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  34.52 
 
 
208 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  32.52 
 
 
216 aa  98.6  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0042  channel protein, hemolysin III family  33.53 
 
 
230 aa  98.2  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  29.67 
 
 
205 aa  97.4  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  33.69 
 
 
195 aa  96.3  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  33.69 
 
 
195 aa  96.3  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  30.48 
 
 
214 aa  95.1  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  34.22 
 
 
192 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3595  hemolysin III family channel protein  34.87 
 
 
216 aa  93.2  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  28.09 
 
 
233 aa  92.8  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0661  Hly-III related proteins  34 
 
 
212 aa  91.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1773  Hly-III family protein  31.22 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5292  HylII  30.48 
 
 
205 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.976162  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2864  Hly-III family protein  28.1 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.107423  normal  0.018726 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  27.59 
 
 
209 aa  90.1  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  26.18 
 
 
215 aa  89.7  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5552  putative lipoprotein  31.55 
 
 
205 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63900  putative hemolyin III  32.23 
 
 
205 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5036  hemolysin III family channel protein  29.44 
 
 
205 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406448  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  28.71 
 
 
205 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  28.83 
 
 
220 aa  88.2  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  30.24 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0478  hemolysin III family channel protein  29.27 
 
 
205 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002051  hypothetical protein  26.36 
 
 
217 aa  87  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04990  predicted membrane protein, hemolysin III  29.11 
 
 
228 aa  87.4  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.900042  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46556  predicted protein  28 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000802712  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  27.19 
 
 
215 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0452  HylII  28.04 
 
 
204 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2710  Hly-III family protein  33 
 
 
227 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0918513 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4860  hemolysin III family channel protein  28.97 
 
 
205 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  0.0154668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>