249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_23050 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_23050  predicted membrane protein, hemolysin III  100 
 
 
276 aa  548  1e-155  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  60.19 
 
 
262 aa  251  7e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  60.78 
 
 
249 aa  249  4e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1888  Hly-III family protein  51.79 
 
 
274 aa  244  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1104  Hly-III family protein  60.78 
 
 
246 aa  232  5e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2630  Hly-III family protein  59.31 
 
 
225 aa  229  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.468291  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0945  Hly-III family protein  61.08 
 
 
250 aa  224  9e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  50.22 
 
 
221 aa  219  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2335  Hly-III family protein  52.4 
 
 
243 aa  216  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126816  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1055  Hly-III family protein  52.36 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1243  Hly-III family protein  47.58 
 
 
246 aa  210  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158656 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1172  Hly-III family protein  50.97 
 
 
243 aa  203  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  50 
 
 
268 aa  202  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  54.85 
 
 
224 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  43.57 
 
 
273 aa  199  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  47.37 
 
 
305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  47.39 
 
 
366 aa  196  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0439  Hly-III family protein  50 
 
 
218 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  46.48 
 
 
225 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  45.28 
 
 
225 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05120  channel protein, hemolysin III family  46.63 
 
 
239 aa  175  6e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.297417  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1532  channel protein, hemolysin III family  45.83 
 
 
218 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104876  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4663  hemolysin III family channel protein  43.28 
 
 
243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  46.15 
 
 
270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0767  hemolysin III-like membrane protein  35.87 
 
 
314 aa  172  5e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00245971  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2054  hemolysin III family channel protein  39.76 
 
 
250 aa  169  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4138  hemolysin III family channel protein  39.59 
 
 
247 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4213  hemolysin III family channel protein  39.59 
 
 
247 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370881  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4369  hemolysin III family channel protein  39.59 
 
 
247 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0713  channel protein, hemolysin III family  44.5 
 
 
225 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4414  channel protein, hemolysin III family  45.37 
 
 
225 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31590  channel protein, hemolysin III family  39.73 
 
 
229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1355  putative hemolysin III-like membrane protein  39.22 
 
 
285 aa  142  4e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.648452  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4658  hemolysin III family channel protein  39.42 
 
 
270 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.096872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4746  hemolysin III family channel protein  39.42 
 
 
270 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5041  hemolysin III family channel protein  39.42 
 
 
270 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.45647  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11103  hemolysin-like protein  36.71 
 
 
242 aa  141  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2817e-49  normal  0.398095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5336  channel protein, hemolysin III family  47.92 
 
 
235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1200  hemolysin III family channel protein  42.23 
 
 
217 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1523  hemolysin III family channel protein  45.57 
 
 
200 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3062  hemolysin III family channel protein  45.15 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  41.57 
 
 
195 aa  129  6e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  41.57 
 
 
195 aa  129  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1656  channel protein, hemolysin III family  45.51 
 
 
224 aa  129  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  41.01 
 
 
192 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1213  channel protein, hemolysin III family  41.29 
 
 
219 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1283  channel protein, hemolysin III family  41.29 
 
 
219 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1153  hemolysin III family channel protein  40 
 
 
219 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  42.07 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  36.9 
 
 
216 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  40.36 
 
 
216 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  36.53 
 
 
223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  40.12 
 
 
232 aa  109  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  42.62 
 
 
208 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  37.02 
 
 
217 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  38.25 
 
 
213 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  35.63 
 
 
215 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  35.63 
 
 
215 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  35.63 
 
 
215 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  35.75 
 
 
215 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  34.48 
 
 
215 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  34.48 
 
 
215 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  34.48 
 
 
215 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  34.48 
 
 
215 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  40.44 
 
 
214 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  34.48 
 
 
215 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  33.91 
 
 
215 aa  102  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  40 
 
 
215 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  37.57 
 
 
215 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  31.25 
 
 
208 aa  96.3  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  39.29 
 
 
215 aa  95.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  31.55 
 
 
215 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  31.55 
 
 
215 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  29.71 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  32.24 
 
 
214 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1319  hemolysin III, putative  33.33 
 
 
214 aa  92.4  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1773  Hly-III family protein  35.29 
 
 
231 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0618  hemolysin III-like protein  32.03 
 
 
225 aa  90.9  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.160524  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  32.6 
 
 
257 aa  89.4  5e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2864  Hly-III family protein  31.48 
 
 
239 aa  88.6  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.107423  normal  0.018726 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0246  channel protein, hemolysin III family  32.54 
 
 
230 aa  87.8  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  32.29 
 
 
218 aa  85.9  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4657  Hly-III family protein  35.63 
 
 
229 aa  85.5  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.883194  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  37.44 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3701  Hly-III related proteins  34.47 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  35.38 
 
 
214 aa  84  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  35.06 
 
 
220 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2239  hemolysin III family channel protein  29.82 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000410283  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2201  hemolysin III family channel protein  29.82 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000726691  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  33.82 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  34.15 
 
 
215 aa  81.6  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3940  Hly-III related proteins  33.5 
 
 
232 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0178087  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  35.79 
 
 
224 aa  81.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  35.64 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1769  hemolysin III, putative  27.74 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.664722  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  35.45 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0067  hemolysin III family channel protein  33.53 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  35.45 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  35.64 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  35.64 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>