248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03334 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03334  hemolysin III  100 
 
 		 220 aa  437  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4657  Hly-III family protein  47.34 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.883194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2012  hemolysin III family channel protein  37.38 
 
 		 226 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.203186 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  37.85 
 
 		 215 aa  132  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  38.92 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  38.92 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  38.92 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  38.92 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  38.92 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  38.92 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1862  hemolysin III family channel protein  37.93 
 
 		 241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  38.92 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  38.92 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  38.92 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  37.85 
 
 		 215 aa  131  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3388  Hly-III related proteins  37.63 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0217913  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002051  hypothetical protein  35.94 
 
 		 217 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1608  Hly-III family protein  40.82 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.60621  normal  0.167379 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  37.38 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1889  Hly-III family protein  40.82 
 
 		 226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  0.582334 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  37.44 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  37.44 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2710  Hly-III family protein  38 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0918513 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  37.44 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  37.44 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  37.44 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1631  Hly-III family protein  40.31 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  35.58 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  36.45 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2594  hemolysin III family channel protein  38.82 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3940  Hly-III related proteins  37.11 
 
 		 232 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0178087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0605  Hly-III family protein  37.88 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  36.45 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4269  Hly-III related proteins  37.11 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.673544  normal  0.633803 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3701  Hly-III related proteins  37.11 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1773  Hly-III family protein  37.63 
 
 		 231 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5366  Hly-III family protein  38.65 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2325  hemolysin III family channel protein  33.66 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.988522  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  38.39 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1920  hemolysin III family channel protein  32.56 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2441  hemolysin III family channel protein  32.55 
 
 		 227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  34.91 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0995  Hly-III family protein  35.86 
 
 		 222 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2021  channel protein, hemolysin III family  33.17 
 
 		 227 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523934  hitchhiker  0.00605701 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2385  hemolysin III family channel protein  37.43 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.872491  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0049  hemolysin III  30.56 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2479  putative hemolysin  38.29 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2325  hemolysin III family channel protein  33.17 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2098  hemolysin III family channel protein  33.33 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  35.21 
 
 		 214 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  36.55 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0867  Hly-III family protein  35.35 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.296032  normal  0.935947 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  35.47 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0078  Hly-III family protein  35.81 
 
 		 218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0068  hemolysin III family channel protein  34.42 
 
 		 218 aa  112  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  33.01 
 
 		 218 aa  112  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6673  hemolysin III  38.66 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.63047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0661  Hly-III related proteins  38.42 
 
 		 212 aa  112  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0720  hemolysin III  30.29 
 
 		 219 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03143  putative hemolysin III  35.71 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.902393  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5292  HylII  35.45 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.976162  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3838  hemolysin III family protein  37.06 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.69609 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3595  hemolysin III family channel protein  37.57 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0870  hemolysin III family protein  37.06 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0873  hemolysin III family channel protein  37.06 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1271  Hemolysin III  35.05 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0067  hemolysin III family channel protein  33.95 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5077  hemolysin III  34.57 
 
 		 204 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1873  channel protein, hemolysin III family protein  33.67 
 
 		 227 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0452  HylII  34.04 
 
 		 204 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  33.84 
 
 		 205 aa  108  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  32.69 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  32.28 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0478  hemolysin III family channel protein  33.17 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0342  hemolysin III family channel protein  36.42 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.80447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63900  putative hemolyin III  32.83 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5552  putative lipoprotein  32.83 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  31.1 
 
 		 214 aa  106  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  33 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  30.62 
 
 		 214 aa  104  8e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2171  hemolysin III  28.37 
 
 		 213 aa  104  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.255778  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4986  hemolysin III family channel protein  32.67 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0394739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4860  hemolysin III family channel protein  32.18 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  0.0154668 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  34.17 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5862  Hly-III family protein  39.29 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1768  hemolysin III family channel protein  31.84 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000462203  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  33.5 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  29.35 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5036  hemolysin III family channel protein  32.18 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0114  hemolysin III family channel protein  36.88 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  29.21 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  33.51 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3326  hemolysin III family channel protein  32.37 
 
 		 219 aa  102  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.605856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0525  hypothetical protein  36.63 
 
 		 219 aa  101  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2177  Hly-III family protein  36.63 
 
 		 219 aa  101  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00438954  normal  0.0630884 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1076  hemolysin III family channel protein  31.5 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3247  hemolysin III family channel protein  32.32 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888973  normal  0.330902 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0904  Hly-III family protein  38.75 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3907  channel protein, hemolysin III family  33.66 
 
 		 214 aa  99  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5624  Hemolysin III family protein, channel protein  30.96 
 
 		 205 aa  98.6  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>