249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5624 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_5624  Hemolysin III family protein, channel protein  100 
 
 
205 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3103  channel protein, hemolysin III family  84.88 
 
 
205 aa  354  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2738  channel protein, hemolysin III family  84.88 
 
 
205 aa  332  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5210  HylII  85.85 
 
 
205 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611368  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4712  hemolysin III family channel protein  66.34 
 
 
206 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859483  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5300  hemolysin III family channel protein  66.34 
 
 
206 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.503604  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5431  hemolysin III family channel protein  66.5 
 
 
206 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4883  hemolysin III family channel protein  66.5 
 
 
206 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0623487  normal  0.221133 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5560  hemolysin III family channel protein  66.34 
 
 
206 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0662  hemolysin III  67.32 
 
 
206 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.503531  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2390  hemolysin III  67.32 
 
 
206 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0804  hemolysin III  67.32 
 
 
206 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1179  hemolysin III  67.32 
 
 
206 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1104  hemolysin III  67.32 
 
 
206 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1768  hemolysin III  67.32 
 
 
206 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3247  hemolysin III family channel protein  65.85 
 
 
206 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888973  normal  0.330902 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0099  hemolysin HylII family protein  65.85 
 
 
206 aa  269  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1597  hemolysin III  65.85 
 
 
206 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0649  putative hemolysin HylII  64.88 
 
 
206 aa  266  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.426321 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3310  channel protein, hemolysin III family  64.88 
 
 
206 aa  266  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.837096 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0427  hemolysin III family channel protein  64.39 
 
 
206 aa  260  8e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.622641 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  61.27 
 
 
205 aa  251  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  59.02 
 
 
206 aa  248  5e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4860  hemolysin III family channel protein  58.33 
 
 
205 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  0.0154668 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0452  HylII  58.33 
 
 
204 aa  242  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3370  hemolysin III family channel protein  61.27 
 
 
205 aa  242  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339431  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5036  hemolysin III family channel protein  58.33 
 
 
205 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406448  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4986  hemolysin III family channel protein  57.84 
 
 
205 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0394739  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5077  hemolysin III  57.84 
 
 
204 aa  240  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0478  hemolysin III family channel protein  56.86 
 
 
205 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63900  putative hemolyin III  57.35 
 
 
205 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  57.84 
 
 
205 aa  235  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5552  putative lipoprotein  56.37 
 
 
205 aa  234  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  55.88 
 
 
205 aa  234  9e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5292  HylII  55.39 
 
 
205 aa  231  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.976162  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  53.69 
 
 
221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1076  hemolysin III family channel protein  49.28 
 
 
208 aa  197  7e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  50.75 
 
 
214 aa  194  8.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  50.25 
 
 
214 aa  193  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  47.6 
 
 
208 aa  191  8e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  46.8 
 
 
214 aa  190  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0157  HylII  54.41 
 
 
205 aa  185  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  48.48 
 
 
220 aa  181  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  45.32 
 
 
214 aa  179  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  47.76 
 
 
215 aa  178  4.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1223  hemolysin III family channel protein  49.25 
 
 
518 aa  174  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743924  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3228  channel protein, hemolysin III family  50.24 
 
 
206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  44.22 
 
 
219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4053  channel protein, hemolysin III family  48 
 
 
220 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.324319  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2707  hemolysin-like protein  46 
 
 
218 aa  171  5.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  44.95 
 
 
215 aa  169  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  45.05 
 
 
220 aa  168  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2271  hemolysin III  46.31 
 
 
239 aa  166  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000142686  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2087  hemolysin III  46.31 
 
 
218 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000145785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2027  hemolysin III  46.31 
 
 
218 aa  166  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000762716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2025  hemolysin III  46.31 
 
 
218 aa  166  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2241  hemolysin III  46.31 
 
 
218 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000273402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2224  hemolysin III  46.31 
 
 
218 aa  166  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000315085  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2268  hemolysin III  46.31 
 
 
218 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03992e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2353  hemolysin III  46.8 
 
 
218 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3100  hemolysin III  46.31 
 
 
218 aa  166  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147044  hitchhiker  5.80051e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0342  hemolysin III family channel protein  41.58 
 
 
219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.80447  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1644  hemolysin III family channel protein  44.83 
 
 
218 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000192122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2066  hemolysin III family channel protein  45.81 
 
 
218 aa  164  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000112411  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3907  channel protein, hemolysin III family  41.09 
 
 
214 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  43.28 
 
 
218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0114  hemolysin III family channel protein  48.74 
 
 
227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  42.21 
 
 
216 aa  154  7e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0839  hemolysin III family channel protein  41.5 
 
 
221 aa  152  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3552  hemolysin III family channel protein  47.73 
 
 
214 aa  152  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2317  hemolysin III  43.07 
 
 
217 aa  151  5.9999999999999996e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.177004  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  42.23 
 
 
215 aa  150  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0747  Hly-III family protein  41.95 
 
 
220 aa  150  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.720334  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0049  hemolysin III  42.65 
 
 
215 aa  149  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1993  channel protein, hemolysin III family  44.06 
 
 
225 aa  147  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0837698  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2360  channel protein, hemolysin III family  44.06 
 
 
217 aa  147  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3992  channel protein, hemolysin III family  41.09 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000238096 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3326  hemolysin III family channel protein  43 
 
 
219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.605856  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  41.29 
 
 
259 aa  144  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  40.58 
 
 
232 aa  143  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0720  hemolysin III  40.3 
 
 
219 aa  143  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  41.06 
 
 
215 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1732  channel protein, hemolysin III family  44.95 
 
 
214 aa  142  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.301086  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  41.87 
 
 
218 aa  142  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  40.87 
 
 
216 aa  140  9e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  40.89 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  40.89 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  40.89 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  40.89 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  40.89 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  40.89 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  40.89 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  40.89 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  41.87 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  40.89 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  40.1 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  42.08 
 
 
224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  41.09 
 
 
215 aa  138  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  40 
 
 
215 aa  138  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  38.54 
 
 
216 aa  137  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>