247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4657 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4657  Hly-III family protein  100 
 
 
229 aa  448  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.883194  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03334  hemolysin III  47.83 
 
 
220 aa  176  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1773  Hly-III family protein  42.29 
 
 
231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0605  Hly-III family protein  43.59 
 
 
220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3940  Hly-III related proteins  41.29 
 
 
232 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0178087  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3701  Hly-III related proteins  41.79 
 
 
232 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3388  Hly-III related proteins  40.8 
 
 
224 aa  138  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0217913  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4269  Hly-III related proteins  41.26 
 
 
236 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.673544  normal  0.633803 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0995  Hly-III family protein  39.32 
 
 
222 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0867  Hly-III family protein  38.83 
 
 
222 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.296032  normal  0.935947 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5366  Hly-III family protein  40.26 
 
 
230 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1271  Hemolysin III  36.36 
 
 
216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0661  Hly-III related proteins  39.34 
 
 
212 aa  128  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0067  hemolysin III family channel protein  40.39 
 
 
218 aa  126  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0068  hemolysin III family channel protein  40.39 
 
 
218 aa  126  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5862  Hly-III family protein  44 
 
 
234 aa  125  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2710  Hly-III family protein  41.55 
 
 
227 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0918513 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1889  Hly-III family protein  40.19 
 
 
226 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  0.582334 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1608  Hly-III family protein  39.91 
 
 
226 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.60621  normal  0.167379 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0078  Hly-III family protein  39.9 
 
 
218 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0904  Hly-III family protein  40.76 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  36.36 
 
 
214 aa  119  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6673  hemolysin III  39.59 
 
 
231 aa  118  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.63047  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  35.07 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5077  hemolysin III  34.57 
 
 
204 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1631  Hly-III family protein  37.91 
 
 
226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  34.86 
 
 
221 aa  115  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0342  hemolysin III family channel protein  34.76 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.80447  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  38.54 
 
 
214 aa  113  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  35.53 
 
 
205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0452  HylII  34.04 
 
 
204 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5292  HylII  34.74 
 
 
205 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.976162  normal  0.43061 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  36.68 
 
 
219 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  36.68 
 
 
219 aa  112  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  36.68 
 
 
219 aa  112  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  36.68 
 
 
219 aa  112  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  36.68 
 
 
219 aa  112  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  36.68 
 
 
219 aa  112  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  36.68 
 
 
219 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  36.68 
 
 
219 aa  112  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  36.68 
 
 
219 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1862  hemolysin III family channel protein  33.47 
 
 
241 aa  109  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2594  hemolysin III family channel protein  38.04 
 
 
226 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  37.65 
 
 
215 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  32.47 
 
 
219 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  34.17 
 
 
219 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  34.17 
 
 
219 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  34.17 
 
 
219 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  34.17 
 
 
219 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  36.36 
 
 
233 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  34.17 
 
 
219 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5552  putative lipoprotein  35.98 
 
 
205 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  32.86 
 
 
216 aa  105  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  35.82 
 
 
215 aa  105  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  32.99 
 
 
205 aa  105  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  33.49 
 
 
224 aa  105  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  34.17 
 
 
215 aa  105  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0478  hemolysin III family channel protein  33.33 
 
 
205 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  34.17 
 
 
220 aa  105  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1076  hemolysin III family channel protein  31.34 
 
 
208 aa  104  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3595  hemolysin III family channel protein  30.88 
 
 
216 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5036  hemolysin III family channel protein  32.8 
 
 
205 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406448  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  30.33 
 
 
218 aa  104  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002051  hypothetical protein  31.92 
 
 
217 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  34.34 
 
 
206 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  29.77 
 
 
215 aa  103  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63900  putative hemolyin III  35.45 
 
 
205 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2325  hemolysin III family channel protein  31.65 
 
 
227 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2707  hemolysin-like protein  35.35 
 
 
218 aa  103  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0547  Hly-III related proteins  33.95 
 
 
219 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  31.88 
 
 
220 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2325  hemolysin III family channel protein  33.73 
 
 
227 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.988522  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  34.95 
 
 
214 aa  102  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  34.17 
 
 
216 aa  102  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4986  hemolysin III family channel protein  34.21 
 
 
205 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0394739  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1223  hemolysin III family channel protein  32.66 
 
 
518 aa  102  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743924  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1262  Hly-III family protein  34.27 
 
 
219 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254618  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  34.95 
 
 
214 aa  102  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2021  channel protein, hemolysin III family  33.93 
 
 
227 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523934  hitchhiker  0.00605701 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2479  putative hemolysin  34.94 
 
 
215 aa  101  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1920  hemolysin III family channel protein  33.33 
 
 
227 aa  101  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4860  hemolysin III family channel protein  34.21 
 
 
205 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  0.0154668 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2012  hemolysin III family channel protein  33.17 
 
 
226 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.203186 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0525  hypothetical protein  34.25 
 
 
219 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  32.66 
 
 
218 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2441  hemolysin III family channel protein  33.93 
 
 
227 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  31.96 
 
 
205 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2177  Hly-III family protein  34.25 
 
 
219 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00438954  normal  0.0630884 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2385  hemolysin III family channel protein  35.09 
 
 
249 aa  99  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.872491  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1873  channel protein, hemolysin III family protein  34.31 
 
 
227 aa  99  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0839  hemolysin III family channel protein  32.37 
 
 
221 aa  97.8  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5300  hemolysin III family channel protein  32.99 
 
 
206 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.503604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5560  hemolysin III family channel protein  32.99 
 
 
206 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4712  hemolysin III family channel protein  32.99 
 
 
206 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859483  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2390  hemolysin III  31.96 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0649  putative hemolysin HylII  30.93 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.426321 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1179  hemolysin III  31.96 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1104  hemolysin III  31.96 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1768  hemolysin III  31.96 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3247  hemolysin III family channel protein  32.47 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888973  normal  0.330902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>