106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0033 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  46.35 
 
 		 1349 aa  1088    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  37.52 
 
 		 1375 aa  802    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  100 
 
 		 1332 aa  2709    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  38.84 
 
 		 1022 aa  625  1e-177  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  34.23 
 
 		 1098 aa  547  1e-154  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1612 aa  244  7e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  30.76 
 
 		 1432 aa  243  2.9999999999999997e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  22.74 
 
 		 1250 aa  233  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1250 aa  231  1e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  28.39 
 
 		 1426 aa  214  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  22.94 
 
 		 1343 aa  200  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  26.4 
 
 		 1339 aa  188  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  27.2 
 
 		 1442 aa  184  9.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  26.87 
 
 		 1712 aa  183  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  25.97 
 
 		 1338 aa  181  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1338 aa  181  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  23.95 
 
 		 1354 aa  172  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  23.68 
 
 		 1277 aa  171  6e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  25.82 
 
 		 1318 aa  171  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  23.31 
 
 		 1321 aa  166  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  23.4 
 
 		 1278 aa  165  5.0000000000000005e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  25.03 
 
 		 1422 aa  161  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  24.66 
 
 		 1306 aa  160  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  27.63 
 
 		 1219 aa  160  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  26.05 
 
 		 1055 aa  161  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  24.98 
 
 		 1322 aa  158  6e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  28.07 
 
 		 1336 aa  158  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  24 
 
 		 1322 aa  158  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  26.36 
 
 		 1355 aa  152  5e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1581 aa  150  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  23.45 
 
 		 1358 aa  149  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  26.37 
 
 		 1331 aa  140  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1373 aa  140  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  22.5 
 
 		 1298 aa  138  6.0000000000000005e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  26.46 
 
 		 1282 aa  127  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  25.58 
 
 		 1290 aa  126  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1333 aa  121  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  30.96 
 
 		 1346 aa  121  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  27.74 
 
 		 1459 aa  121  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  24.61 
 
 		 1321 aa  117  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  31.06 
 
 		 1363 aa  115  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1441 aa  113  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  28.08 
 
 		 1452 aa  112  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1342 aa  112  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  29.08 
 
 		 1319 aa  111  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1461 aa  111  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1709 aa  110  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1347 aa  107  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1243 aa  103  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  23.99 
 
 		 1409 aa  96.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1575 aa  96.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  28.76 
 
 		 1440 aa  93.6  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  28.36 
 
 		 846 aa  94  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  26.22 
 
 		 1751 aa  90.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1353 aa  89.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1339 aa  89  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1339 aa  89  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  27.58 
 
 		 1572 aa  87.8  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  26.18 
 
 		 974 aa  83.2  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1365 aa  80.9  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  30.11 
 
 		 1347 aa  81.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  26.34 
 
 		 1366 aa  78.6  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  25.78 
 
 		 1581 aa  76.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  22.18 
 
 		 1642 aa  74.7  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  22.13 
 
 		 1640 aa  72.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  22.38 
 
 		 1644 aa  72.8  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1039 aa  72  0.00000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  23.95 
 
 		 1573 aa  72  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  22.18 
 
 		 1640 aa  71.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  24.26 
 
 		 1546 aa  71.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1579 aa  69.7  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  21.47 
 
 		 1177 aa  70.1  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  23.34 
 
 		 1557 aa  69.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  23.61 
 
 		 1154 aa  68.6  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  22.45 
 
 		 1120 aa  68.6  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  22.72 
 
 		 1104 aa  66.2  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  22.88 
 
 		 1058 aa  65.5  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  19.57 
 
 		 1252 aa  63.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  20.94 
 
 		 1041 aa  62.8  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1209 aa  62.8  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  21.58 
 
 		 1159 aa  62.4  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  25.2 
 
 		 926 aa  62.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1338 aa  61.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  26.19 
 
 		 1020 aa  60.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  22.42 
 
 		 1194 aa  60.1  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  20 
 
 		 1244 aa  59.3  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  20.71 
 
 		 1257 aa  59.3  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0584  hypothetical protein  21.8 
 
 		 826 aa  58.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1088 aa  56.6  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  23.66 
 
 		 1178 aa  54.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  22.79 
 
 		 1186 aa  54.3  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1299 aa  53.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  22.6 
 
 		 1188 aa  52  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  23.61 
 
 		 1256 aa  50.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  22.44 
 
 		 995 aa  50.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  22.95 
 
 		 1170 aa  49.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  24.44 
 
 		 882 aa  48.5  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  20.57 
 
 		 1089 aa  48.5  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  27.04 
 
 		 869 aa  48.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  24.82 
 
 		 950 aa  48.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>