More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6371 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
241 aa  481  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.2 
 
 
313 aa  258  8e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00430281  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.79 
 
 
326 aa  251  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.79 
 
 
318 aa  247  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.09 
 
 
312 aa  232  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863347  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.72 
 
 
313 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.88 
 
 
310 aa  210  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.41 
 
 
340 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.0406215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.82 
 
 
336 aa  168  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.893798  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.53 
 
 
333 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.3 
 
 
328 aa  166  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165164  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.44 
 
 
324 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.58 
 
 
324 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.54 
 
 
322 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 
341 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.19 
 
 
341 aa  155  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  46.48 
 
 
320 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  46.48 
 
 
319 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.52 
 
 
341 aa  148  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  45.21 
 
 
324 aa  148  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  48.73 
 
 
300 aa  148  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  48.73 
 
 
300 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  48.73 
 
 
300 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.72 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  45.45 
 
 
329 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.71 
 
 
338 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.24 
 
 
301 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.06 
 
 
320 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.19 
 
 
343 aa  143  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
312 aa  142  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 
298 aa  142  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.78 
 
 
339 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  45.07 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.99 
 
 
325 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
315 aa  139  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
331 aa  138  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.97 
 
 
339 aa  138  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.72 
 
 
326 aa  137  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.67 
 
 
298 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
327 aa  136  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.96 
 
 
297 aa  135  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 
332 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.22 
 
 
326 aa  135  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  42.08 
 
 
316 aa  135  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  45.33 
 
 
321 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2559  Short-chain alcohol dehydrogenase  36.87 
 
 
339 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.5 
 
 
331 aa  134  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.72 
 
 
315 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  46.46 
 
 
300 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  44.61 
 
 
304 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.38 
 
 
323 aa  133  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
317 aa  131  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.54 
 
 
318 aa  131  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456891  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  42.72 
 
 
318 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.2 
 
 
312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11239  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.28 
 
 
304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  43.14 
 
 
303 aa  129  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  41.35 
 
 
317 aa  129  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 
311 aa  129  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
312 aa  128  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
307 aa  128  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.96 
 
 
289 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.96 
 
 
289 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.08 
 
 
298 aa  128  9.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.96 
 
 
289 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  47.31 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 
324 aa  126  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  43.84 
 
 
301 aa  126  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
307 aa  126  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.22 
 
 
290 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6184  oxidoreductase  42.72 
 
 
321 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.69376 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  43.5 
 
 
303 aa  124  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  44.12 
 
 
302 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.14 
 
 
314 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
305 aa  123  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  42.65 
 
 
305 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
326 aa  122  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4174  short chain dehydrogenase  42.65 
 
 
312 aa  122  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.865375  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.15 
 
 
331 aa  122  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.15 
 
 
331 aa  122  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.1 
 
 
310 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  40.98 
 
 
308 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1061  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 
320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  39.41 
 
 
301 aa  118  7.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
298 aa  118  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.66 
 
 
307 aa  118  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  43.24 
 
 
306 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
305 aa  118  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  hitchhiker  0.00451656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 
288 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.4 
 
 
328 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36252  predicted protein  37.75 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140786  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 
281 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.244285  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  42.41 
 
 
306 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  42.41 
 
 
306 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 
312 aa  115  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711865  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2983  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
291 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.888321  normal  0.289512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 
328 aa  115  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.63 
 
 
305 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.95 
 
 
297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.580908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>