73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4886 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  657    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  76.09 
 
 		 303 aa  451  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  62.26 
 
 		 295 aa  321  9.000000000000001e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  57.45 
 
 		 311 aa  317  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  55.37 
 
 		 351 aa  316  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  57.71 
 
 		 286 aa  315  7e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  58.78 
 
 		 299 aa  305  7e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  59.77 
 
 		 297 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  59.54 
 
 		 294 aa  286  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  55.73 
 
 		 333 aa  280  4e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  56.06 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  54.71 
 
 		 284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  50.82 
 
 		 313 aa  273  2.0000000000000002e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  57.75 
 
 		 322 aa  273  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  55.48 
 
 		 302 aa  272  5.000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  54.41 
 
 		 273 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  53.85 
 
 		 267 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  53.31 
 
 		 297 aa  265  8e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  54.51 
 
 		 303 aa  264  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  50.55 
 
 		 280 aa  262  6e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  52.08 
 
 		 266 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  52.01 
 
 		 278 aa  253  3e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  51.04 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  52.09 
 
 		 291 aa  248  7e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  49.64 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  51.66 
 
 		 277 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  51 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  51.66 
 
 		 277 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  51.66 
 
 		 277 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  45.08 
 
 		 298 aa  202  4e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  34.98 
 
 		 259 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39374  predicted protein  28.96 
 
 		 366 aa  87.4  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2712  hypothetical protein  29.84 
 
 		 543 aa  79.7  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000442298  hitchhiker  0.0000400817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  29.24 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  27.97 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  23.92 
 
 		 1019 aa  73.2  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  32.32 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  29.24 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  31.58 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4397  hypothetical protein  23.37 
 
 		 615 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.272271 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  23.18 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  27.74 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  25.93 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  27.62 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  26.97 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  24.05 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  26.13 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  25.78 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  26.67 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  25.7 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  29.96 
 
 		 958 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  25.81 
 
 		 1066 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  26.85 
 
 		 387 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  26.6 
 
 		 781 aa  57  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  25.7 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  25.7 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  28.25 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  27.14 
 
 		 1038 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  30.27 
 
 		 1052 aa  52.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  25.68 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  30.17 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  26.34 
 
 		 780 aa  50.4  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1039 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  23.3 
 
 		 1016 aa  49.7  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  26.57 
 
 		 1038 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  33 
 
 		 988 aa  49.3  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  28.3 
 
 		 1048 aa  49.3  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  25 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1737  phage NTP-binding protein  22.38 
 
 		 530 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1775  ATP-dependent nuclease subunit B  35.11 
 
 		 1149 aa  43.5  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  26.22 
 
 		 1051 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  26.22 
 
 		 1051 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  31.67 
 
 		 284 aa  42.7  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>