More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0595 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
390 aa  815    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  66.12 
 
 
373 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  43.72 
 
 
382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  43.32 
 
 
381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  42.4 
 
 
382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  41.42 
 
 
383 aa  295  1e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  38.46 
 
 
388 aa  268  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  35.81 
 
 
395 aa  267  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  34.66 
 
 
500 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  34.39 
 
 
500 aa  262  8e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 
496 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  36.01 
 
 
385 aa  259  6e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  36.99 
 
 
386 aa  256  6e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  39.94 
 
 
385 aa  255  8e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 
492 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 
385 aa  249  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  36.91 
 
 
385 aa  249  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  36.98 
 
 
392 aa  222  9e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 
385 aa  222  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  35.73 
 
 
378 aa  220  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2104  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 
413 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  32.97 
 
 
376 aa  195  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2494  FAD dependent oxidoreductase  32.64 
 
 
413 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.207468  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3472  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 
413 aa  195  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 
413 aa  193  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2452  sarcosine oxidase, beta subunit  31.82 
 
 
413 aa  193  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00527323  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2224  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 
413 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175364  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0452  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 
413 aa  191  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000226129  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 
394 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 
385 aa  186  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 
383 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 
378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 
395 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0512  sarcosine oxidase beta subunit family protein  31.09 
 
 
423 aa  182  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 
823 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 
389 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 
389 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 
394 aa  179  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1351  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 
413 aa  177  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 
385 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 
376 aa  177  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 
389 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 
394 aa  176  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  32.16 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  30.63 
 
 
384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1694  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 
412 aa  173  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5048  sarcosine oxidase, beta subunit family  31.36 
 
 
414 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.275422  normal  0.249273 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 
816 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 
383 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 
383 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 
394 aa  170  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 
376 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0969  sarcosine oxidase beta subunit family protein  30.45 
 
 
431 aa  169  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1877  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.78 
 
 
415 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294016  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2686  putative sarcosine oxidase beta subunit  29.78 
 
 
415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0604356  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1344  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.78 
 
 
415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0947006  normal  0.025984 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 
378 aa  167  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 
378 aa  166  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2183  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.97 
 
 
414 aa  166  5.9999999999999996e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.409819  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 
816 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0046  sarcosine oxidase subunit beta  31.07 
 
 
414 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.570395 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 
375 aa  166  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 
392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0996  sarcosine oxidase, beta subunit, putative  31.36 
 
 
414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1600  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  31.07 
 
 
414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.323345  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 
391 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1101  sarcosine oxidase subunit beta  31.07 
 
 
414 aa  164  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.163088 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1862  glycine/D-amino acid oxidases  31.07 
 
 
414 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4830  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  31.36 
 
 
414 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0395  sarcosine oxidase, beta subunit  31.07 
 
 
414 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5151  sarcosine oxidase beta subunit family protein  31.07 
 
 
421 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 
812 aa  164  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1954  sarcosine oxidase beta subunit  31.07 
 
 
414 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3504  sarcosine oxidase beta subunit family protein  31.36 
 
 
414 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3216  sarcosine oxidase beta subunit family protein  31.07 
 
 
421 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0868127  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5128  sarcosine oxidase beta subunit family protein  31.07 
 
 
414 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68928  normal  0.839713 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0486  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  31.07 
 
 
414 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 
806 aa  163  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5069  sarcosine oxidase beta subunit family protein  31.07 
 
 
414 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4546  sarcosine oxidase beta subunit family protein  31.07 
 
 
414 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4131  sarcosine oxidase beta subunit family protein  30.34 
 
 
416 aa  162  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 
394 aa  162  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3333  sarcosine oxidase beta subunit family protein  30.47 
 
 
414 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156184  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  29.7 
 
 
380 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 
397 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 
376 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 
815 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 
382 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 
389 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 
377 aa  160  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2636  sarcosine oxidase, beta subunit family  29.54 
 
 
416 aa  159  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  25.66 
 
 
799 aa  159  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2478  sarcosine oxidase, beta subunit  31.64 
 
 
416 aa  159  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4032  sarcosine oxidase, beta subunit  31.64 
 
 
416 aa  159  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 
374 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 
382 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 
826 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 
378 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 
378 aa  157  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4909  sarcosine oxidase beta subunit family protein  30.13 
 
 
416 aa  156  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.315195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>