More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1893 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  100 
 
 
325 aa  667    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  57.54 
 
 
325 aa  413  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  59.38 
 
 
324 aa  403  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  42.77 
 
 
323 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  43.46 
 
 
286 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  33.63 
 
 
323 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  44.51 
 
 
321 aa  149  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  31.13 
 
 
308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  38.02 
 
 
223 aa  142  7e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  53.85 
 
 
442 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  44.23 
 
 
229 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  54.7 
 
 
569 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  52.14 
 
 
446 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  52.14 
 
 
447 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  52.14 
 
 
447 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  46.76 
 
 
233 aa  132  6.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  29.43 
 
 
301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  41.67 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  35.42 
 
 
305 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  34.57 
 
 
445 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  35.42 
 
 
305 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  32.17 
 
 
317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  35 
 
 
305 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  39.89 
 
 
317 aa  129  8.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  48.74 
 
 
524 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  34.85 
 
 
337 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  47.01 
 
 
317 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  49.62 
 
 
415 aa  126  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  29.33 
 
 
300 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  29.62 
 
 
343 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  34.96 
 
 
305 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  52.17 
 
 
443 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  35.53 
 
 
454 aa  124  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  39.31 
 
 
238 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  41.1 
 
 
300 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  41.4 
 
 
414 aa  123  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  43.33 
 
 
298 aa  123  4e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  43.51 
 
 
248 aa  123  5e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  34.17 
 
 
305 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  45.67 
 
 
417 aa  122  6e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  36.96 
 
 
387 aa  122  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  38.37 
 
 
334 aa  122  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  40.74 
 
 
314 aa  122  8e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1891  peptidase M23B  35.8 
 
 
314 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  43.41 
 
 
430 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  40.15 
 
 
333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  44.88 
 
 
399 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0251  M23 peptidase domain protein  40.69 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  39.75 
 
 
363 aa  120  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  46.38 
 
 
453 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1544  peptidase M23B  43.04 
 
 
336 aa  120  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.216338  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  39.72 
 
 
302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  47.86 
 
 
465 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  37.23 
 
 
313 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0470  M24/M37 family peptidase  38.17 
 
 
268 aa  119  6e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  47.41 
 
 
411 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  41.61 
 
 
391 aa  119  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  46.77 
 
 
533 aa  119  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  37.79 
 
 
303 aa  119  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  42.86 
 
 
340 aa  119  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  29.29 
 
 
300 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  50 
 
 
379 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  47.37 
 
 
455 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  44.09 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  36.41 
 
 
247 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  35.04 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  45.76 
 
 
377 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  37.28 
 
 
288 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  40.62 
 
 
392 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  41.25 
 
 
392 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  46.1 
 
 
456 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  39.74 
 
 
319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  49.59 
 
 
490 aa  116  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  42.11 
 
 
414 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  33.98 
 
 
374 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  38.36 
 
 
321 aa  116  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  44.44 
 
 
377 aa  116  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  31.56 
 
 
301 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  46.15 
 
 
288 aa  115  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  35.03 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  41.5 
 
 
262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  42.04 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6698  Peptidase M23  40.22 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  43.41 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  44.68 
 
 
457 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  43.97 
 
 
455 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  40.82 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  40.52 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  46.4 
 
 
646 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  46.15 
 
 
382 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  47.37 
 
 
646 aa  114  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  41.01 
 
 
460 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  45.59 
 
 
460 aa  114  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  47.46 
 
 
375 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  42.76 
 
 
345 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  33.33 
 
 
374 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  35.39 
 
 
491 aa  113  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  41.03 
 
 
379 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  28.72 
 
 
310 aa  113  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  43.65 
 
 
690 aa  113  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>