More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1426 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1426  NLP/P60 protein  100 
 
 
165 aa  328  1e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  61.9 
 
 
384 aa  171  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04820  hypothetical protein  39.25 
 
 
186 aa  129  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  45.65 
 
 
302 aa  125  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4179  NLP/P60 protein  36.88 
 
 
168 aa  122  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0481386  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1158  NLP/P60 protein  42.14 
 
 
181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  39.47 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  39.47 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  39.47 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  39.47 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  39.47 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  39.47 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  39.47 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  39.47 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  39.47 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  35.23 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  35.23 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  35.23 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  40.69 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  40.69 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  36.57 
 
 
189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  37.72 
 
 
162 aa  105  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  38.58 
 
 
205 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1387  putative lipoprotein  40.12 
 
 
162 aa  100  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0376898  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  34.86 
 
 
208 aa  99.4  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0057  lipoprotein  34.12 
 
 
174 aa  99.4  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438446  hitchhiker  0.00939156 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3275  NLP/P60 protein  35.43 
 
 
181 aa  98.6  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0670  NLP/P60 protein  35.71 
 
 
207 aa  98.6  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.160252 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  32.72 
 
 
214 aa  97.8  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  35.42 
 
 
260 aa  97.4  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  40 
 
 
424 aa  97.4  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  31.48 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  33.54 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  32.5 
 
 
154 aa  94.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  32.5 
 
 
154 aa  94.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  32.5 
 
 
154 aa  94.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  32.5 
 
 
154 aa  94.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  32.5 
 
 
154 aa  94.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  33.75 
 
 
154 aa  94.7  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  35.58 
 
 
207 aa  94.7  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  33.75 
 
 
154 aa  94.7  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  33.75 
 
 
154 aa  94.7  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  36.67 
 
 
191 aa  94.4  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1142  lipoprotein NlpC  37.2 
 
 
166 aa  94.4  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0142689  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  34.16 
 
 
154 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  34.55 
 
 
154 aa  94  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  34.55 
 
 
154 aa  94  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  36.91 
 
 
257 aa  94  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  32.12 
 
 
333 aa  93.6  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  32.32 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
232 aa  92.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  36.69 
 
 
191 aa  92.8  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  41.74 
 
 
231 aa  92.4  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  32.32 
 
 
154 aa  92  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1912  lipoprotein, NlpC/P60 family  33.12 
 
 
154 aa  92  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  32.95 
 
 
191 aa  92  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  32.08 
 
 
162 aa  91.7  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  36.69 
 
 
194 aa  92  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  37.41 
 
 
193 aa  91.3  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  31.87 
 
 
157 aa  91.3  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  40.48 
 
 
341 aa  90.9  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  39.68 
 
 
221 aa  90.5  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
265 aa  90.5  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  35.25 
 
 
154 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  35.25 
 
 
154 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  37.7 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  35.25 
 
 
154 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  35.25 
 
 
154 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  40.18 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0199  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
191 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4872  NLP/P60 protein  33.55 
 
 
183 aa  88.2  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  37.21 
 
 
349 aa  88.2  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  34.15 
 
 
167 aa  88.2  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0069  NLP/P60 family lipoprotein  31.85 
 
 
148 aa  88.2  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  33.87 
 
 
193 aa  87.8  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  30.77 
 
 
173 aa  87.4  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0062  NLP/P60 protein  33.54 
 
 
154 aa  87.4  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2028  NLP/P60 protein  31.9 
 
 
233 aa  87  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  39.52 
 
 
342 aa  87  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2940  NLP/P60 protein  33.57 
 
 
217 aa  86.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.284799  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0058  NLP/P60 protein  39.34 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  34.06 
 
 
216 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1592  NLP/P60  34.29 
 
 
171 aa  86.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.098676  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  33.54 
 
 
164 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  36.72 
 
 
210 aa  87  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4296  NLP/P60 protein  39.34 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0941  NLP/P60 family protein  33.73 
 
 
159 aa  86.3  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33367  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  41.13 
 
 
196 aa  86.3  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000856339  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  34.92 
 
 
207 aa  85.5  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  32.12 
 
 
188 aa  85.5  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  38.17 
 
 
207 aa  85.1  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  37.7 
 
 
154 aa  84.3  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0428  NLP/P60 protein  28.57 
 
 
173 aa  84.3  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  35.82 
 
 
183 aa  84  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  38.94 
 
 
194 aa  84  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  38.94 
 
 
194 aa  84  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  38.94 
 
 
172 aa  84  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0021  NLP/P60 protein  33.06 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2819  NLP/P60 protein  34.4 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  34.31 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>