More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1177 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  100 
 
 
427 aa  868    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  30.19 
 
 
419 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  31.84 
 
 
419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  32.15 
 
 
419 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  29.88 
 
 
419 aa  156  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  29.14 
 
 
461 aa  143  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  23.74 
 
 
441 aa  136  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.18 
 
 
452 aa  134  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  26.83 
 
 
424 aa  131  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  25.62 
 
 
449 aa  126  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  24.22 
 
 
470 aa  123  5e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  26.1 
 
 
1496 aa  123  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 
447 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  27.71 
 
 
447 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  23.37 
 
 
467 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  26.21 
 
 
433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  27.43 
 
 
445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 
463 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  27.18 
 
 
440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  24.21 
 
 
441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 
453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  25.24 
 
 
482 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.3 
 
 
461 aa  113  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  24.48 
 
 
496 aa  112  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  25.98 
 
 
436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  26.38 
 
 
462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  24.42 
 
 
439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  23.43 
 
 
420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4153  outer membrane efflux protein  27.71 
 
 
447 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  27.92 
 
 
443 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  26.1 
 
 
491 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  25.12 
 
 
455 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1698  outer membrane efflux protein  28.88 
 
 
433 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572085  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 
476 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  22.73 
 
 
460 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  22.62 
 
 
426 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4294  outer membrane efflux protein  25.49 
 
 
448 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0190007  normal  0.396606 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  25.56 
 
 
464 aa  107  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  25.35 
 
 
435 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  24.94 
 
 
470 aa  104  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  22.69 
 
 
462 aa  104  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  23.77 
 
 
435 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  26.39 
 
 
453 aa  103  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  22.79 
 
 
463 aa  102  9e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 
565 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 
441 aa  101  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  26.11 
 
 
576 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  25.25 
 
 
1470 aa  100  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0313  outer membrane channel protein  25.74 
 
 
463 aa  100  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  25.5 
 
 
483 aa  100  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  24.2 
 
 
424 aa  97.1  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  26.12 
 
 
635 aa  96.7  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  25.51 
 
 
738 aa  96.7  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.65 
 
 
471 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.65 
 
 
479 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.65 
 
 
482 aa  94.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.65 
 
 
471 aa  94.4  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.65 
 
 
482 aa  94.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.65 
 
 
482 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.65 
 
 
479 aa  93.6  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  23.97 
 
 
470 aa  93.2  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0323  outer membrane channel protein  24.75 
 
 
463 aa  92.8  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000673159  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.35 
 
 
479 aa  92.8  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  21.98 
 
 
443 aa  92.8  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  24.42 
 
 
972 aa  92  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.08 
 
 
477 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  22.49 
 
 
471 aa  90.9  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.93 
 
 
452 aa  90.5  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  24.21 
 
 
436 aa  90.1  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0791  outer membrane efflux protein  24.13 
 
 
454 aa  90.5  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.670065  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 
523 aa  90.1  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  24.21 
 
 
469 aa  89.4  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  25.84 
 
 
627 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.78 
 
 
489 aa  89  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 
525 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  25.32 
 
 
497 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  22.94 
 
 
497 aa  87.4  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  23.81 
 
 
442 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  22.91 
 
 
472 aa  87.8  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  22.82 
 
 
446 aa  86.7  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  23.29 
 
 
451 aa  86.7  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.16 
 
 
494 aa  86.3  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  24.57 
 
 
443 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  22.72 
 
 
445 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  23.34 
 
 
459 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.54 
 
 
477 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.54 
 
 
477 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4942  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 
449 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755187  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.46 
 
 
479 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  23.74 
 
 
444 aa  84.3  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0710  Outer membrane protein-like  24.16 
 
 
445 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000572058  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  22.46 
 
 
435 aa  84  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  24.07 
 
 
465 aa  84.3  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  23.28 
 
 
498 aa  84  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  23.57 
 
 
464 aa  83.6  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  23.82 
 
 
436 aa  83.6  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1955  outer membrane efflux protein  22.81 
 
 
476 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223795  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  23.57 
 
 
464 aa  83.6  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  20.66 
 
 
471 aa  83.6  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  21.32 
 
 
471 aa  83.2  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.387043 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>