More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0073 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  100 
 
 
772 aa  1587    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  27.32 
 
 
752 aa  263  8.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  25.98 
 
 
769 aa  258  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.14 
 
 
752 aa  256  8e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  25.95 
 
 
913 aa  256  8e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.41 
 
 
808 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.81 
 
 
802 aa  246  8e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  26.35 
 
 
888 aa  235  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  24.78 
 
 
765 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.99 
 
 
892 aa  231  3e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2334  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.94 
 
 
763 aa  228  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0117402 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.44 
 
 
895 aa  221  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  24.03 
 
 
751 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  27.43 
 
 
893 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  26.28 
 
 
896 aa  213  7e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  24.97 
 
 
763 aa  209  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  23.87 
 
 
767 aa  208  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.44 
 
 
920 aa  206  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.46 
 
 
895 aa  204  6e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.65 
 
 
831 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000452148  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  22.75 
 
 
763 aa  202  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0397  surface antigen (D15)  23.29 
 
 
830 aa  197  7e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00277353  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1751  surface antigen family protein  23.48 
 
 
820 aa  196  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  24.87 
 
 
798 aa  195  2e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  22.85 
 
 
777 aa  191  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  23.39 
 
 
820 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  23.08 
 
 
806 aa  189  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  22.77 
 
 
778 aa  188  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2601  surface antigen, putative  24.63 
 
 
818 aa  187  5e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.38 
 
 
848 aa  187  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1750  surface antigen (D15):surface antigen variable number  23.76 
 
 
761 aa  187  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.330816  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.08 
 
 
793 aa  187  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  25.13 
 
 
788 aa  187  8e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.95 
 
 
793 aa  185  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  23.31 
 
 
770 aa  183  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.08 
 
 
770 aa  183  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  23.65 
 
 
791 aa  183  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  23.95 
 
 
784 aa  182  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0400  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.78 
 
 
827 aa  182  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000108596  unclonable  0.0000045929 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0463  surface antigen family protein  24.36 
 
 
858 aa  181  4.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  22.82 
 
 
785 aa  179  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.54 
 
 
784 aa  179  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0636  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.68 
 
 
775 aa  179  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0791016  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.93 
 
 
770 aa  177  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.7 
 
 
769 aa  177  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.84 
 
 
768 aa  177  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  22.58 
 
 
905 aa  176  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  22.7 
 
 
769 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  22.57 
 
 
768 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  22.7 
 
 
769 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.1 
 
 
803 aa  176  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  23.37 
 
 
767 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23 
 
 
821 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000592139  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  22.31 
 
 
769 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  22.44 
 
 
769 aa  175  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  23.96 
 
 
781 aa  174  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  22.31 
 
 
768 aa  174  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  22.31 
 
 
768 aa  174  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  22.31 
 
 
768 aa  174  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0432  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.34 
 
 
834 aa  174  5.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  23.78 
 
 
785 aa  173  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1808  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.57 
 
 
868 aa  173  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  24.56 
 
 
760 aa  172  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  25.77 
 
 
553 aa  172  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1446  surface antigen (D15)  22.91 
 
 
765 aa  172  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.332057 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  21.92 
 
 
769 aa  172  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  22.18 
 
 
768 aa  172  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  21.92 
 
 
769 aa  172  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  22.56 
 
 
790 aa  172  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.41 
 
 
769 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  21.92 
 
 
768 aa  171  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  23.62 
 
 
765 aa  170  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.88 
 
 
765 aa  170  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.8 
 
 
769 aa  170  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2687  surface antigen (D15)  22.19 
 
 
784 aa  169  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.379638  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0512  outer membrane protein, putative  22.93 
 
 
792 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1796  surface antigen (D15)  22.13 
 
 
818 aa  168  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00389709  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  24.03 
 
 
766 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.19 
 
 
765 aa  168  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2842  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.29 
 
 
770 aa  167  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.22 
 
 
758 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.58 
 
 
781 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  21.58 
 
 
781 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  22.33 
 
 
781 aa  166  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.98 
 
 
800 aa  166  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.3 
 
 
750 aa  164  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.45 
 
 
787 aa  164  8.000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0357  outer membrane antigen  22.52 
 
 
784 aa  163  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.433119  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1766  surface antigen (D15)  22.52 
 
 
766 aa  163  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0726033  normal  0.0207518 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1971  putative outer membrane signal peptide protein  23.51 
 
 
781 aa  163  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.208049  normal  0.130084 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1489  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.5 
 
 
780 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0322  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.52 
 
 
784 aa  162  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1053  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.89 
 
 
807 aa  161  3e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1574  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.78 
 
 
786 aa  160  9e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2607  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.99 
 
 
811 aa  160  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.745531  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  22.61 
 
 
788 aa  158  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  22.12 
 
 
785 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.4 
 
 
781 aa  157  8e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  21.81 
 
 
887 aa  156  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  21.61 
 
 
765 aa  155  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>