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for query gene EcDH1_0030 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03557  multidrug efflux system protein  100 
 
 		 394 aa  752    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0030  multidrug/H+ antiporter, major facilitator superfamily (MFS)  100 
 
 		 383 aa  753    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4245  multidrug resistance protein D  99.48 
 
 		 394 aa  748    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4024  multidrug resistance protein D  92.53 
 
 		 394 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4181  multidrug resistance protein D  100 
 
 		 394 aa  752    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4187  multidrug resistance protein D  92.31 
 
 		 394 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4079  multidrug resistance protein D  92.53 
 
 		 394 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3886  multidrug resistance protein D  100 
 
 		 394 aa  752    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4129  multidrug resistance protein D  92.57 
 
 		 386 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.771712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4039  multidrug resistance protein D  100 
 
 		 394 aa  752    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.679822 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03500  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  752    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0027  multidrug resistance protein D  100 
 
 		 394 aa  752    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4008  multidrug resistance protein D  92.31 
 
 		 386 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5105  multidrug resistance protein D  100 
 
 		 396 aa  753    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.336287 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0023  multidrug resistance protein D  85.87 
 
 		 394 aa  558  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4800  multidrug resistance protein D  73.11 
 
 		 394 aa  542  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0145  multidrug resistance protein D  43.36 
 
 		 400 aa  295  6e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  40.89 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2287  multidrug resistance protein D  42.7 
 
 		 408 aa  281  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.754315  hitchhiker  0.0000100188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2329  multidrug resistance protein D  42.13 
 
 		 408 aa  277  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000177786  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2085  multidrug resistance protein D  43.9 
 
 		 410 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.88065  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2078  multidrug resistance protein D  43.13 
 
 		 410 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.1442  hitchhiker  0.00000857713 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1989  multidrug resistance protein D  44 
 
 		 414 aa  276  6e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000209754 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2030  multidrug resistance protein D  43.05 
 
 		 422 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1936  multidrug resistance protein D  42.93 
 
 		 414 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117708 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2267  multidrug resistance protein D  43.13 
 
 		 410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0513916  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2040  multidrug resistance protein D  42.93 
 
 		 414 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2384  multidrug resistance protein D  42.86 
 
 		 410 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214025  hitchhiker  0.000132803 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06739  multidrug resistance protein D  41.15 
 
 		 401 aa  272  6e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1015  multidrug resistance protein D  41.8 
 
 		 414 aa  271  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2389  multidrug resistance protein D  43.47 
 
 		 414 aa  263  4e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.27 
 
 		 391 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  29 
 
 		 409 aa  166  6.9999999999999995e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.56 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  30.97 
 
 		 394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  28.61 
 
 		 397 aa  146  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06295  hypothetical protein  29.43 
 
 		 387 aa  143  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.43 
 
 		 394 aa  143  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  30.26 
 
 		 400 aa  142  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  29.75 
 
 		 400 aa  139  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0057  multidrug resistance protein D  29.08 
 
 		 403 aa  134  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  27.53 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010511  M446_5459  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.61 
 
 		 389 aa  131  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.243673  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1763  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.02 
 
 		 407 aa  129  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599795  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  27.27 
 
 		 407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0297  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.95 
 
 		 401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169159  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.83 
 
 		 412 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3494  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.23 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.61895  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3211  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.27 
 
 		 424 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.26 
 
 		 400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.21 
 
 		 393 aa  126  5e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0211544  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3375  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.16 
 
 		 405 aa  126  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0699824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.25 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.43 
 
 		 396 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.03 
 
 		 400 aa  124  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.662405 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.43 
 
 		 402 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0763382 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.76 
 
 		 395 aa  123  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.55 
 
 		 407 aa  123  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0196  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.43 
 
 		 402 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0196  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.43 
 
 		 402 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4138  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.43 
 
 		 402 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1144  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.69 
 
 		 395 aa  122  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0269  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.09 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3222  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.17 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.68 
 
 		 400 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5334  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.57 
 
 		 410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.85 
 
 		 465 aa  120  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.01 
 
 		 400 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  29.97 
 
 		 398 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1677  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.65 
 
 		 401 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.701434 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.89 
 
 		 409 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.53 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4089  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.88 
 
 		 412 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.95 
 
 		 411 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  31.95 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  31.95 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5152  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.66 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.600108 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.21 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.5 
 
 		 401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  27.79 
 
 		 420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.98 
 
 		 405 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.96 
 
 		 399 aa  117  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2456  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.46 
 
 		 418 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.202004  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.48 
 
 		 399 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.25 
 
 		 399 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3823  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.73 
 
 		 402 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5744  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.69 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_3808  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.28 
 
 		 434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4560  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.38 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  29.13 
 
 		 393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_3110  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.46 
 
 		 418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.21 
 
 		 436 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal  1 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_0325  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.74 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_1536  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.31 
 
 		 408 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.13 
 
 		 393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
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NC_008309  HS_1479  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.06 
 
 		 370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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