295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1769 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1769  cobalamin B12-binding domain-containing protein  100 
 
 		 134 aa  274  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00734137  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1910  cobalamin B12-binding domain protein  89.55 
 
 		 134 aa  252  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.374857  normal  0.0962097 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1578  B12-binding protein  66.42 
 
 		 134 aa  193  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.432317  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1574  methylmalonyl-CoA mutase-like  65.67 
 
 		 134 aa  192  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000332572  normal  0.305791 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2026  cobalamin B12-binding domain-containing protein  62.69 
 
 		 134 aa  187  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113125  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  64.18 
 
 		 134 aa  186  7e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000031654  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1548  cobalamin B12-binding domain protein  62.69 
 
 		 134 aa  184  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166361 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2691  cobalamin B12-binding domain protein  61.94 
 
 		 134 aa  183  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0118523  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1832  methylmalonyl-CoA mutase  63.36 
 
 		 140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436511  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1854  cobalamin B12-binding domain-containing protein  64.12 
 
 		 137 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2028  cobalamin B12-binding domain protein  62.6 
 
 		 140 aa  181  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2098  cobalamin B12-binding domain protein  62.6 
 
 		 140 aa  180  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3482  cobalamin B12-binding domain-containing protein  62.41 
 
 		 134 aa  179  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1673  cobalamin B12-binding domain protein  62.99 
 
 		 153 aa  174  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1487  cobalamin B12-binding domain protein  62.1 
 
 		 135 aa  172  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.40083  normal  0.12756 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1989  cobalamin B12-binding domain-containing protein  59.54 
 
 		 139 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3774  cobalamin B12-binding domain protein  59.54 
 
 		 157 aa  169  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137195  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1242  methylmalonyl-CoA mutase  60.61 
 
 		 135 aa  169  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3814  cobalamin B12-binding domain-containing protein  63.49 
 
 		 134 aa  168  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4204  cobalamin B12-binding domain-containing protein  63.49 
 
 		 134 aa  169  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1574  cobalamin B12-binding domain-containing protein  60.77 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0630027 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1541  methylmalonyl-CoA mutase, alpha subunit  59.4 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0770461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2692  cobalamin B12-binding domain protein  58.46 
 
 		 140 aa  165  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1432  methylmalonyl-CoA mutase  58.14 
 
 		 140 aa  165  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.329321 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6220  cobalamin B12-binding domain-containing protein  64.57 
 
 		 134 aa  164  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1715  cobalamin B12-binding domain protein  58.46 
 
 		 139 aa  163  8e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0457  cobalamin B12-binding domain-containing protein  56.35 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.364165 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0377  methylmalonyl-CoA mutase-like  59.23 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.99713  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0059  cobalamin B12-binding domain protein  59.52 
 
 		 136 aa  160  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107152 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0289  cobalamin B12-binding domain protein  56.15 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0587  cobalamin B12-binding domain protein  57.03 
 
 		 135 aa  158  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.901029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7994  cobalamin B12-binding domain protein  59.2 
 
 		 135 aa  157  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4240  cobalamin B12-binding domain protein  57.03 
 
 		 139 aa  157  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0550  cobalamin B12-binding domain-containing protein  61.79 
 
 		 133 aa  154  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0241  cobalamin B12-binding domain protein  56.45 
 
 		 139 aa  152  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0081  cobalamin B12-binding domain protein  52.76 
 
 		 141 aa  151  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2998  cobalamin B12-binding domain-containing protein  56.06 
 
 		 134 aa  150  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.651513  normal  0.0337584 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2369  methylmalonyl-CoA mutase-like protein  53.54 
 
 		 133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.308524  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3591  cobalamin B12-binding domain-containing protein  59.84 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0900  cobalamin B12-binding domain protein  54.26 
 
 		 138 aa  149  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4360  cobalamin B12-binding domain protein  55.04 
 
 		 138 aa  148  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.36975  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0318  cobalamin B12-binding domain protein  52.67 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2472  cobalamin B12-binding domain protein  54.2 
 
 		 152 aa  146  8e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2024  cobalamin B12-binding domain-containing protein  53.79 
 
 		 134 aa  146  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000794891 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2805  cobalamin B12-binding domain protein  53.44 
 
 		 142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.069341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3836  cobalamin B12-binding domain protein  53.44 
 
 		 138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.692162  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3987  cobalamin B12-binding domain-containing protein  53.91 
 
 		 137 aa  144  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195294  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5018  cobalamin B12-binding domain-containing protein  51.56 
 
 		 135 aa  142  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1359  cobalamin B12-binding domain protein  56.35 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000160657  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.33 
 
 		 140 aa  142  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0044288 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1263  cobalamin B12-binding domain protein  62.81 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.728671  normal  0.8637 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0510  cobalamin B12-binding domain protein  52.24 
 
 		 139 aa  141  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  0.90311 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0582  cobalamin B12-binding domain-containing protein  53.91 
 
 		 133 aa  141  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1322  cobalamin B12-binding domain-containing protein  56.49 
 
 		 136 aa  140  6e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2055  cobalamin B12-binding domain-containing protein  50 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4641  cobalamin B12-binding domain protein  55.04 
 
 		 143 aa  137  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5088  cobalamin B12-binding domain-containing protein  52.34 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0538  methylmalonyl-CoA mutase C-terminal domain-containing protein  47.66 
 
 		 136 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000893241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3825  methylmalonyl-CoA mutase C-terminal domain-containing protein  57.02 
 
 		 132 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438631  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3899  cobalamin B12-binding domain-containing protein  57.02 
 
 		 132 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3811  cobalamin B12-binding domain-containing protein  57.02 
 
 		 132 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0469463  normal  0.0948206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4260  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.92 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4006  methylmalonyl-CoA mutase  53.85 
 
 		 716 aa  131  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.55 
 
 		 133 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.698998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1702  methylmalonyl-CoA mutase  55.17 
 
 		 718 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321557 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3654  cobalamin B12-binding domain-containing protein  43.41 
 
 		 135 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.136466 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  51.72 
 
 		 722 aa  125  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4309  cobalamin B12-binding domain-containing protein  52.71 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2127  methylmalonyl-CoA mutase  48.48 
 
 		 720 aa  124  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.063815  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0875  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  52.59 
 
 		 1081 aa  124  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.036821 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2300  methylmalonyl-CoA mutase  51.22 
 
 		 709 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2294  methylmalonyl-CoA mutase  47.69 
 
 		 731 aa  124  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.895743  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2192  methylmalonyl-CoA mutase  51.22 
 
 		 709 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172259  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2697  methylmalonyl-CoA mutase  47.41 
 
 		 720 aa  123  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.20812 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0867  methylmalonyl-CoA mutase  51.22 
 
 		 709 aa  123  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2805  methylmalonyl-CoA mutase  50.86 
 
 		 719 aa  122  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2161  methylmalonyl-CoA mutase  50.86 
 
 		 723 aa  122  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385791  normal  0.481947 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0932  methylmalonyl-CoA mutase  46.62 
 
 		 724 aa  122  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1865  methylmalonyl-CoA mutase  51.22 
 
 		 661 aa  122  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3681  methylmalonyl-CoA mutase  52.54 
 
 		 714 aa  121  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0910  methylmalonyl-CoA mutase  45.86 
 
 		 739 aa  121  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.736612  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  50 
 
 		 738 aa  120  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  50 
 
 		 720 aa  121  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6511  methylmalonyl-CoA mutase  49.14 
 
 		 712 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5804  methylmalonyl-CoA mutase  51.72 
 
 		 972 aa  121  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.256305  normal  0.17905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4193  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  53.57 
 
 		 670 aa  121  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.669168  normal  0.90036 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  50 
 
 		 720 aa  121  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1014  methylmalonyl-CoA mutase  49.14 
 
 		 719 aa  120  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.856859 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1173  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  50 
 
 		 1106 aa  120  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00593374 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1292  methylmalonyl-CoA mutase  50.86 
 
 		 714 aa  120  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0279  methylmalonyl-CoA mutase  49.23 
 
 		 731 aa  120  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1772  methylmalonyl-CoA mutase  55.86 
 
 		 680 aa  120  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.292142  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2479  methylmalonyl-CoA mutase  50.86 
 
 		 732 aa  120  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1320  methylmalonyl-CoA mutase  51.72 
 
 		 722 aa  120  7e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1223  methylmalonyl-CoA mutase  47.41 
 
 		 712 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6640  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  50.86 
 
 		 724 aa  119  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.70273 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2128  cobalamin B12-binding domain-containing protein  48.78 
 
 		 172 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2383  methylmalonyl-CoA mutase  49.14 
 
 		 718 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3260  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  53.98 
 
 		 713 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0811  methylmalonyl-CoA mutase  51.72 
 
 		 714 aa  119  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>