More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0100 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0100  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 228 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 236 aa  115  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2962  response regulator receiver  34.65 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.96 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.95 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.05 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  35.61 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  33.95 
 
 		 242 aa  102  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  31.19 
 
 		 226 aa  102  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  31.31 
 
 		 215 aa  102  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  31.78 
 
 		 215 aa  101  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  31.78 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  33.01 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  30.84 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  31.78 
 
 		 215 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  31.78 
 
 		 215 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  31.78 
 
 		 215 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  31.78 
 
 		 215 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0541  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.08 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  31.78 
 
 		 215 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.24 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.07 
 
 		 227 aa  99  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  30.46 
 
 		 216 aa  99  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 222 aa  99  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.1 
 
 		 241 aa  99  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1686  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 240 aa  98.6  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.173725  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5409  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.29 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00220575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2445  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115114  normal  0.02149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.39 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.81 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.95 
 
 		 231 aa  95.5  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.2 
 
 		 223 aa  95.9  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6399  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.2 
 
 		 214 aa  95.9  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139442 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 207 aa  95.5  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3754  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.33 
 
 		 216 aa  95.5  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00290124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.81 
 
 		 225 aa  95.1  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 222 aa  95.5  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  30.59 
 
 		 227 aa  95.1  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  32.57 
 
 		 226 aa  95.1  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 219 aa  94.7  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.08 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  29.67 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.58 
 
 		 212 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1358  two component LuxR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 220 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.19 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.86 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.09 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1132  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.9 
 
 		 214 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.1 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.23 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.5 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  28.77 
 
 		 216 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4502  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.46 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2055  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.23 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0759  two component LuxR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  32.37 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2126  LuxR family DNA-binding response regulator  31.31 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118459  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  28.84 
 
 		 220 aa  93.2  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.19 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0424  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.96 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.85 
 
 		 211 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0433  two component LuxR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2464  two component LuxR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 221 aa  92.4  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 250 aa  92.4  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.96 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4012  transcriptional regulator NarL  33.33 
 
 		 214 aa  92  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 229 aa  92  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 209 aa  92  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 237 aa  91.7  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6192  two component LuxR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 231 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  0.0472092 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  29.15 
 
 		 215 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 238 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.23 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5717  two component LuxR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 220 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.21 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0209  two component LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.61 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.92 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.65 
 
 		 221 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 214 aa  90.9  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.13 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>