More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1239 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  51.87 
 
 
740 aa  672    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  49.13 
 
 
759 aa  657    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  100 
 
 
762 aa  1517    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.63 
 
 
849 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.82 
 
 
848 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.77 
 
 
856 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.86 
 
 
844 aa  401  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.63 
 
 
845 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.76 
 
 
839 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.77 
 
 
856 aa  388  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  33.55 
 
 
735 aa  386  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.63 
 
 
844 aa  385  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.06 
 
 
853 aa  382  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.63 
 
 
844 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  33.86 
 
 
843 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  34.34 
 
 
761 aa  362  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.81 
 
 
834 aa  362  2e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  32.33 
 
 
849 aa  357  5.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.33 
 
 
759 aa  342  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  34.97 
 
 
1029 aa  342  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.53 
 
 
846 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.14 
 
 
785 aa  338  2.9999999999999997e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.14 
 
 
785 aa  338  2.9999999999999997e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.43 
 
 
754 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.28 
 
 
754 aa  331  3e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.15 
 
 
754 aa  331  3e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.28 
 
 
754 aa  331  3e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.15 
 
 
754 aa  331  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.28 
 
 
754 aa  330  4e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.07 
 
 
846 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.28 
 
 
754 aa  330  6e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.28 
 
 
754 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  34.38 
 
 
748 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.15 
 
 
754 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.77 
 
 
752 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.99 
 
 
755 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.85 
 
 
756 aa  326  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  34.71 
 
 
989 aa  323  9.999999999999999e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.08 
 
 
1055 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.88 
 
 
996 aa  321  3.9999999999999996e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.4 
 
 
995 aa  320  9e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  35.03 
 
 
1001 aa  317  5e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.72 
 
 
750 aa  314  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.33 
 
 
991 aa  310  5e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.23 
 
 
981 aa  307  4.0000000000000004e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1501  protein-export membrane protein SecD  31.56 
 
 
793 aa  306  9.000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.365573  normal  0.0601553 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.85 
 
 
990 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.22 
 
 
995 aa  305  3.0000000000000004e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.09 
 
 
750 aa  304  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  29.64 
 
 
855 aa  293  7e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1073  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.62 
 
 
753 aa  288  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0361267  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.39 
 
 
763 aa  288  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.65 
 
 
759 aa  288  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.65 
 
 
759 aa  288  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2256  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.61 
 
 
991 aa  280  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1174  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.66 
 
 
858 aa  272  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149804  normal  0.102864 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4072  protein-export membrane protein SecD  30.08 
 
 
885 aa  265  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  41.24 
 
 
554 aa  258  3e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_002620  TC0733  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.73 
 
 
1400 aa  256  9e-67  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  41.14 
 
 
535 aa  256  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  38.35 
 
 
537 aa  256  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  36.64 
 
 
416 aa  254  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  26.66 
 
 
977 aa  253  1e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  41.76 
 
 
554 aa  249  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  35.63 
 
 
473 aa  249  1e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  38.21 
 
 
594 aa  248  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  41.29 
 
 
530 aa  248  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  38.21 
 
 
594 aa  248  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0716  SecD/SecF family protein-export membrane protein  27.4 
 
 
734 aa  247  4.9999999999999997e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  39.33 
 
 
554 aa  246  8e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  36.05 
 
 
535 aa  243  9e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  38.3 
 
 
531 aa  243  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  35.59 
 
 
533 aa  242  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  38.18 
 
 
556 aa  242  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  39.41 
 
 
532 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  37.17 
 
 
530 aa  241  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  37.2 
 
 
532 aa  240  5.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  36.96 
 
 
533 aa  240  8e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  39.14 
 
 
532 aa  240  9e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  35.97 
 
 
531 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  37.2 
 
 
533 aa  239  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  37.37 
 
 
554 aa  239  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  38.44 
 
 
526 aa  238  3e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  36.54 
 
 
533 aa  238  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  39.5 
 
 
554 aa  238  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  39.5 
 
 
554 aa  238  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  39.33 
 
 
530 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  38.04 
 
 
533 aa  237  6e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  39.07 
 
 
531 aa  237  7e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  34.33 
 
 
526 aa  236  1.0000000000000001e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  36.9 
 
 
410 aa  236  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  37.77 
 
 
533 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  38.22 
 
 
399 aa  235  3e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  36.92 
 
 
529 aa  234  3e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  38.04 
 
 
533 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  38.96 
 
 
532 aa  234  5e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  37.09 
 
 
533 aa  234  6e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  37.09 
 
 
533 aa  234  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  39.79 
 
 
533 aa  234  7.000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  38.8 
 
 
532 aa  233  8.000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>