More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3429 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 442 aa  890    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  52.37 
 
 		 451 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  41.35 
 
 		 449 aa  324  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2515  outer membrane protein  38.6 
 
 		 463 aa  317  3e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  35.9 
 
 		 455 aa  267  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  34.03 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  30.39 
 
 		 453 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  29.48 
 
 		 448 aa  197  4.0000000000000005e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  29.15 
 
 		 443 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  29.33 
 
 		 447 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  28.27 
 
 		 443 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01970  outer membrane efflux protein, putative  26.51 
 
 		 456 aa  167  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2362  outer membrane efflux protein  27.36 
 
 		 446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2560  outer membrane efflux protein  27.87 
 
 		 438 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2807  outer membrane efflux protein/ immunoreative antigen  26.14 
 
 		 441 aa  163  6e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2819  outer membrane efflux protein  27.25 
 
 		 438 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  26.37 
 
 		 454 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4492  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 455 aa  156  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685781 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  27.15 
 
 		 483 aa  156  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3719  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 444 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.633766  normal  0.0948534 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2647  outer membrane efflux protein  26.82 
 
 		 445 aa  151  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.910769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  25.35 
 
 		 496 aa  145  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2662  outer membrane efflux protein  27 
 
 		 445 aa  143  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  26.06 
 
 		 462 aa  136  9e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  24.51 
 
 		 463 aa  133  6.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  22.57 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  24.89 
 
 		 467 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  23.95 
 
 		 470 aa  123  8e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  23.28 
 
 		 535 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  26.48 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4543  outer membrane efflux protein  24.05 
 
 		 430 aa  106  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781416  normal  0.876595 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  27 
 
 		 419 aa  97.8  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 		 419 aa  97.1  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  24.26 
 
 		 471 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  21.5 
 
 		 448 aa  91.3  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  23.15 
 
 		 491 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  21.9 
 
 		 462 aa  90.1  7e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  23.19 
 
 		 451 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  23.86 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 408 aa  89  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  23.53 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  23.29 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  23.54 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  22.1 
 
 		 426 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  24.01 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  23.4 
 
 		 431 aa  76.3  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  23.77 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  20.57 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  20.87 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  26.16 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 429 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  20.87 
 
 		 435 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  20.87 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  22.45 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  20.87 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  23.05 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  23.34 
 
 		 449 aa  72.4  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  23.01 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1841  Outer membrane protein-like protein  23.02 
 
 		 438 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  22.6 
 
 		 501 aa  71.2  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  23.1 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  21.92 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  27.05 
 
 		 525 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  24.07 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  22.77 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  22.77 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0366  outer membrane efflux protein  22.89 
 
 		 437 aa  69.7  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 		 424 aa  69.7  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  22.13 
 
 		 435 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  22.73 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3332  outer membrane channel protein  20.59 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0563453  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  24.1 
 
 		 493 aa  67.8  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  22.87 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  24.77 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  23.02 
 
 		 1470 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  21.14 
 
 		 460 aa  67  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  21.74 
 
 		 495 aa  67.4  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 1496 aa  67  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  20.6 
 
 		 441 aa  66.6  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4942  outer membrane efflux protein  21.38 
 
 		 449 aa  66.6  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755187  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  25.1 
 
 		 471 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  25 
 
 		 472 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  22.04 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  26.01 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  21.46 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  22.44 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  21.74 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  22.99 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  23.03 
 
 		 731 aa  63.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  23.62 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  23.65 
 
 		 627 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1990  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.58 
 
 		 498 aa  62  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  25.41 
 
 		 500 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.98 
 
 		 491 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  22.12 
 
 		 497 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  23 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  23.12 
 
 		 576 aa  61.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1955  outer membrane efflux protein  22.91 
 
 		 476 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223795  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  22.54 
 
 		 485 aa  60.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>