More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0078 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  100 
 
 		 319 aa  665    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_63  site-specific recombinase, phage integrase family  46.08 
 
 		 332 aa  310  2e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0272  phage integrase family site specific recombinase  45.08 
 
 		 319 aa  288  1e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0295  phage integrase family site specific recombinase  45.08 
 
 		 319 aa  288  1e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0905  phage integrase family site specific recombinase  45.08 
 
 		 319 aa  288  1e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0056  phage integrase family protein  45.12 
 
 		 332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  31.33 
 
 		 304 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  32.42 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3501  integrase family protein  32.07 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.23 
 
 		 299 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1515  integrase family protein  30.1 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.52 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.52 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.52 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.52 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.23 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.88 
 
 		 299 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.88 
 
 		 299 aa  153  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.52 
 
 		 299 aa  152  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.81 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.87 
 
 		 300 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  35.21 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.74 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  34.59 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  32.36 
 
 		 296 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  31.76 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.45 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  30.66 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3738  prophage LambdaBa03, site-specific recombinase, phage integrase family  33.08 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000543556  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  32.97 
 
 		 295 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  29.97 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  32.48 
 
 		 295 aa  139  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  32.14 
 
 		 295 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0900  integrase  31.69 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000819417  hitchhiker  0.000000626468 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  33.33 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  31.64 
 
 		 296 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  32.95 
 
 		 293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  32.76 
 
 		 295 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  33.33 
 
 		 307 aa  135  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3993  tyrosine recombinase XerC  32.73 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0562  integrase/recombinase  30.21 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0843058  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  33.46 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1434  phage integrase family protein  31.34 
 
 		 322 aa  134  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  30.82 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  31.41 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  28.09 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  31.42 
 
 		 295 aa  132  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  32.3 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0447  tyrosine recombinase XerC  31.54 
 
 		 299 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  30.69 
 
 		 301 aa  132  9e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1360  integrase/recombinase  31.03 
 
 		 306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6099899999999998e-31 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4336  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.55 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  32.21 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  30.29 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  31.29 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  34.1 
 
 		 294 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  31.46 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.28 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3894  tyrosine recombinase XerC  32.36 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533729 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.28 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4229  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.55 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  32.5 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.28 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  31.03 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  30.86 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.67 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  31.21 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4277  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.5 
 
 		 300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4159  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.5 
 
 		 300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.937296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0196  integrase family protein  31.93 
 
 		 328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000565414 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  31.27 
 
 		 299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  30.59 
 
 		 299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0872  phage integrase family protein  29.83 
 
 		 324 aa  129  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  31.27 
 
 		 299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.57 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.55 
 
 		 300 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.225708  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4087  tyrosine recombinase XerC  32 
 
 		 306 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0169707 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.06 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  32.67 
 
 		 304 aa  129  8.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  29.89 
 
 		 296 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3981  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.01 
 
 		 300 aa  129  9.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105897  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  31.84 
 
 		 307 aa  129  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  28.72 
 
 		 310 aa  129  9.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  29.96 
 
 		 294 aa  129  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  31.23 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  32 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1095  phage integrase  33.03 
 
 		 242 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0967  phage integrase family protein  30.8 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  30.47 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  30.12 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  32.33 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2420  integrase family protein  34.02 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0132691 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.74 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  30.32 
 
 		 292 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.74 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.18 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  28.21 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  31.14 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>