More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3507 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4734  extracellular solute-binding protein  61.32 
 
 		 521 aa  641    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3630  extracellular solute-binding protein family 5  86.96 
 
 		 514 aa  943    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3507  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 510 aa  1056    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3824  extracellular solute-binding protein  55.1 
 
 		 524 aa  596  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4381  extracellular solute-binding protein  59.71 
 
 		 510 aa  597  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.582693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  57.92 
 
 		 513 aa  580  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  57.29 
 
 		 530 aa  581  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  54.69 
 
 		 506 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2267  extracellular solute-binding protein  55.85 
 
 		 506 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3603  extracellular solute-binding protein  45.42 
 
 		 507 aa  461  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3112  extracellular solute-binding protein  34.16 
 
 		 505 aa  296  7e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.817588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 505 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  30.37 
 
 		 497 aa  172  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 		 509 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.91 
 
 		 532 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  30.26 
 
 		 520 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.47 
 
 		 525 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.51 
 
 		 535 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.94 
 
 		 534 aa  158  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  29.8 
 
 		 524 aa  157  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  27.49 
 
 		 531 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  30.14 
 
 		 532 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 		 520 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  29.15 
 
 		 529 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  29.38 
 
 		 527 aa  154  4e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0504  ABC transporter substrate-binding protein  31.94 
 
 		 531 aa  153  7e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.325614  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  31.67 
 
 		 520 aa  153  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  24.19 
 
 		 521 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.19 
 
 		 521 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  24.19 
 
 		 521 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  24.19 
 
 		 521 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 		 521 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3787  extracellular solute-binding protein  31.34 
 
 		 531 aa  150  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.216169  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  27.6 
 
 		 526 aa  150  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  27.84 
 
 		 528 aa  149  9e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  29.43 
 
 		 522 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 510 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 		 530 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  28.01 
 
 		 526 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  28.47 
 
 		 528 aa  147  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  27.35 
 
 		 520 aa  147  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  26.48 
 
 		 527 aa  146  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.22 
 
 		 542 aa  146  8.000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 545 aa  146  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.5 
 
 		 520 aa  146  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 		 522 aa  146  9e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 526 aa  146  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.54 
 
 		 504 aa  146  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 514 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  29.6 
 
 		 520 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  28.07 
 
 		 514 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  27.33 
 
 		 527 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 520 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 526 aa  144  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 		 530 aa  144  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  30.03 
 
 		 528 aa  143  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  29.57 
 
 		 520 aa  143  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  30.79 
 
 		 505 aa  143  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 		 538 aa  143  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3775  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.98 
 
 		 556 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  29.49 
 
 		 524 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  27.95 
 
 		 520 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  27.78 
 
 		 532 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  26.12 
 
 		 565 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 512 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  29.59 
 
 		 531 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  29.37 
 
 		 514 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 531 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 538 aa  141  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5265  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  27.63 
 
 		 515 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154423  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  25.55 
 
 		 525 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 		 528 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  26.81 
 
 		 527 aa  140  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  27.14 
 
 		 531 aa  140  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 528 aa  140  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  31.41 
 
 		 530 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  27 
 
 		 540 aa  138  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 522 aa  138  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 		 526 aa  138  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  29.51 
 
 		 520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  28.6 
 
 		 540 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  28.61 
 
 		 532 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.51 
 
 		 520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  29.51 
 
 		 520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  29.51 
 
 		 520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2758  extracellular solute-binding protein family 5  25.44 
 
 		 524 aa  138  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  29.51 
 
 		 520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  25.62 
 
 		 528 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  29.51 
 
 		 520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  32.05 
 
 		 533 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  29.51 
 
 		 520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  29.79 
 
 		 535 aa  137  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2914  extracellular solute-binding protein  31.5 
 
 		 543 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.43 
 
 		 510 aa  137  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0399  extracellular solute-binding protein family 5  27.75 
 
 		 546 aa  137  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 527 aa  136  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.11 
 
 		 505 aa  137  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  31.34 
 
 		 514 aa  136  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 495 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>