More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2750 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2750  ribosomal protein S4  100 
 
 		 208 aa  429  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  73.56 
 
 		 208 aa  334  7e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2232  30S ribosomal protein S4  72.6 
 
 		 208 aa  327  6e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0017217  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0104  30S ribosomal protein S4  68.75 
 
 		 208 aa  315  3e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166577 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  68.27 
 
 		 208 aa  314  6e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  67.79 
 
 		 208 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1740  30S ribosomal protein S4  69.71 
 
 		 208 aa  311  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0408943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  68.27 
 
 		 208 aa  310  6.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0685  30S ribosomal protein S4  68.27 
 
 		 208 aa  310  7.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  65.38 
 
 		 208 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2832  30S ribosomal protein S4  63.94 
 
 		 208 aa  295  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80203  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  63.46 
 
 		 208 aa  292  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0652  30S ribosomal protein S4  63.46 
 
 		 208 aa  292  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000063481 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  62.02 
 
 		 208 aa  276  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2044  30S ribosomal protein S4  62.02 
 
 		 208 aa  275  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0881453  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1959  30S ribosomal protein S4  62.02 
 
 		 208 aa  275  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1920  30S ribosomal protein S4  62.02 
 
 		 208 aa  275  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1937  30S ribosomal protein S4  61.06 
 
 		 208 aa  273  9e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0732  RNA-binding S4 domain-containing protein  60.58 
 
 		 208 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130119  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1581  ribosomal protein S4  59.13 
 
 		 208 aa  273  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.075327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0727  30S ribosomal protein S4  60.77 
 
 		 209 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  62.02 
 
 		 208 aa  270  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  59.62 
 
 		 208 aa  267  7e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  60.58 
 
 		 208 aa  266  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  59.62 
 
 		 206 aa  265  5e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  56.25 
 
 		 208 aa  264  8e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  57.89 
 
 		 209 aa  263  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  60.1 
 
 		 208 aa  263  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  57.21 
 
 		 208 aa  260  8e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0429  30S ribosomal protein S4  56.94 
 
 		 209 aa  255  4e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.857828  normal  0.0845292 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  56.94 
 
 		 206 aa  254  5e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0791  30S ribosomal protein S4  56.25 
 
 		 208 aa  254  8e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.068053  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  55.29 
 
 		 208 aa  254  9e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0242  30S ribosomal protein S4  60.58 
 
 		 208 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0871  SSU ribosomal protein S4P  55.29 
 
 		 208 aa  249  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406188  hitchhiker  0.0058792 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0353  ribosomal protein S4  55.29 
 
 		 208 aa  249  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152733  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0523  ribosomal protein S4  55.29 
 
 		 208 aa  249  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645379  unclonable  0.0000000000198285 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0449  30S ribosomal protein S4  59.33 
 
 		 208 aa  248  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0010581  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0344  30S ribosomal protein S4  55.5 
 
 		 209 aa  249  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.423009  unclonable  0.0000000464518 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2305  ribosomal protein S4  55.98 
 
 		 209 aa  248  6e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00950883  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2686  30S ribosomal protein S4  55.24 
 
 		 206 aa  245  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2371  30S ribosomal protein S4  55.24 
 
 		 206 aa  245  4e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.210121  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3313  30S ribosomal protein S4  55.5 
 
 		 209 aa  244  6.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1497  ribosomal protein S4  58.17 
 
 		 208 aa  243  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1156  ribosomal protein S4  52.4 
 
 		 208 aa  238  4e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000923588  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0592  30S ribosomal protein S4  54.33 
 
 		 208 aa  238  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  54.55 
 
 		 209 aa  238  5.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0252  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.25 
 
 		 208 aa  238  5.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0980  30S ribosomal protein S4  51.67 
 
 		 209 aa  237  8e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.40186  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0222  SSU ribosomal protein S4P  58.37 
 
 		 209 aa  237  8e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  53.85 
 
 		 208 aa  234  6e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1367  30S ribosomal protein S4  51.2 
 
 		 209 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000845169  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1319  30S ribosomal protein S4  51.2 
 
 		 209 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360982  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5046  30S ribosomal protein S4  51.9 
 
 		 207 aa  232  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2348  30S ribosomal protein S4  51.67 
 
 		 206 aa  231  6e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4218  30S ribosomal protein S4  52.86 
 
 		 207 aa  231  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0344  30S ribosomal protein S4  51.9 
 
 		 207 aa  231  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311272  decreased coverage  0.0000419462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09100  30S ribosomal protein S4  53.59 
 
 		 206 aa  231  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.908313 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0500  30S ribosomal protein S4  51.9 
 
 		 207 aa  231  8.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4480  ribosomal protein S4  52.4 
 
 		 208 aa  230  9e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0861  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 206 aa  229  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0318  ribosomal protein S4  50.72 
 
 		 206 aa  229  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.665336  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3155  30S ribosomal protein S4  52.38 
 
 		 207 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3292  30S ribosomal protein S4  52.38 
 
 		 207 aa  228  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1117  30S ribosomal protein S4  52.4 
 
 		 208 aa  227  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0301  30S ribosomal protein S4  51.9 
 
 		 207 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152221  normal  0.0772792 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2814  30S ribosomal protein S4  51.43 
 
 		 207 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0136866  normal  0.264944 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3043  30S ribosomal protein S4  51.43 
 
 		 207 aa  226  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2994  30S ribosomal protein S4  51.9 
 
 		 207 aa  226  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.63256 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3472  30S ribosomal protein S4  51.9 
 
 		 207 aa  225  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1013  30S ribosomal protein S4  53.11 
 
 		 206 aa  225  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000212014  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 209 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0274  30S ribosomal protein S4  51.9 
 
 		 207 aa  224  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0146675 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3885  30S ribosomal protein S4  53.11 
 
 		 206 aa  224  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0632608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0077  ribosomal protein S4  52.38 
 
 		 207 aa  224  8e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06490  30S ribosomal protein S4  51.67 
 
 		 206 aa  224  8e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2925  30S ribosomal protein S4  50.95 
 
 		 207 aa  223  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227191 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5056  30S ribosomal protein S4  52.63 
 
 		 206 aa  223  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00247728  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3272  30S ribosomal protein S4  51.43 
 
 		 207 aa  223  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0352  30S ribosomal protein S4  51.43 
 
 		 207 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2734  30S ribosomal protein S4  51.43 
 
 		 207 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0182  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 206 aa  224  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162542  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0373  30S ribosomal protein S4  51.43 
 
 		 207 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.762852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0237  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 206 aa  223  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000435795  unclonable  0.0000101717 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3503  30S ribosomal protein S4  50.95 
 
 		 207 aa  222  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2607  30S ribosomal protein S4  50.95 
 
 		 207 aa  222  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1046  30S ribosomal protein S4  50.95 
 
 		 207 aa  223  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1949  30S ribosomal protein S4  50.95 
 
 		 207 aa  222  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3751  30S ribosomal protein S4  50.95 
 
 		 207 aa  222  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379241  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3144  30S ribosomal protein S4  50.95 
 
 		 207 aa  222  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171557  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0507  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 206 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0166592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 206 aa  223  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3721  30S ribosomal protein S4  50.95 
 
 		 207 aa  222  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.471129  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0292  30S ribosomal protein S4  50.95 
 
 		 213 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0478  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 206 aa  222  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000269214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4725  30S ribosomal protein S4  51.67 
 
 		 206 aa  222  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.766159  normal  0.270309 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3779  30S ribosomal protein S4  50.95 
 
 		 207 aa  222  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0625  30S ribosomal protein S4  50.95 
 
 		 207 aa  222  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0511  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 206 aa  222  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.595592  normal  0.0197267 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0223  30S ribosomal protein S4  51.2 
 
 		 206 aa  222  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00230473  unclonable  0.0000000000516884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>