292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5155 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  55 
 
 		 867 aa  733    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  57.45 
 
 		 868 aa  769    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  56.62 
 
 		 884 aa  813    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  58.24 
 
 		 866 aa  764    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  57.35 
 
 		 857 aa  779    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  62.93 
 
 		 877 aa  850    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  54.9 
 
 		 844 aa  670    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  100 
 
 		 855 aa  1625    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  63.21 
 
 		 877 aa  850    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  54.08 
 
 		 853 aa  585  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  43.27 
 
 		 858 aa  521  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  40.97 
 
 		 855 aa  511  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  42.59 
 
 		 846 aa  477  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  41.79 
 
 		 857 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  38.16 
 
 		 835 aa  342  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  38.16 
 
 		 835 aa  342  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  29.65 
 
 		 849 aa  253  8.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  29.77 
 
 		 850 aa  228  4e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  29.58 
 
 		 870 aa  225  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  27.47 
 
 		 858 aa  209  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  28.39 
 
 		 866 aa  205  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  41.04 
 
 		 408 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2155  protein of unknown function DUF214  40.77 
 
 		 445 aa  193  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.755011  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  31.99 
 
 		 843 aa  191  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  27.65 
 
 		 847 aa  180  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  26.88 
 
 		 847 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  25.58 
 
 		 855 aa  175  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  29.05 
 
 		 845 aa  172  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  28.83 
 
 		 839 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  25.28 
 
 		 851 aa  159  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  25.06 
 
 		 850 aa  151  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  28.55 
 
 		 848 aa  106  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  22.63 
 
 		 817 aa  105  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  25.68 
 
 		 843 aa  105  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  27.53 
 
 		 849 aa  105  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  33.23 
 
 		 842 aa  102  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  22.59 
 
 		 817 aa  102  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  27.2 
 
 		 849 aa  101  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  33.13 
 
 		 842 aa  101  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  33.23 
 
 		 842 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  29.26 
 
 		 839 aa  97.4  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  27.34 
 
 		 820 aa  97.4  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  23.97 
 
 		 852 aa  96.3  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  31.61 
 
 		 841 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  26.87 
 
 		 846 aa  95.9  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  28.02 
 
 		 837 aa  94.7  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  26.67 
 
 		 838 aa  92.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  25.99 
 
 		 847 aa  90.9  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  24.92 
 
 		 842 aa  90.1  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  27.59 
 
 		 871 aa  90.1  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  22.9 
 
 		 800 aa  90.1  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  25.9 
 
 		 819 aa  89.4  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  30.57 
 
 		 843 aa  87.8  8e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  26.56 
 
 		 841 aa  87.4  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  23.87 
 
 		 879 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  24.16 
 
 		 889 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  20.47 
 
 		 817 aa  85.5  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  25.24 
 
 		 834 aa  85.5  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  24.42 
 
 		 856 aa  84.3  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  25.11 
 
 		 855 aa  84  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  26.32 
 
 		 836 aa  82.8  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  24.11 
 
 		 836 aa  82.4  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  23.47 
 
 		 889 aa  80.9  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  26.52 
 
 		 845 aa  80.9  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  23.39 
 
 		 884 aa  80.9  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  25.28 
 
 		 861 aa  80.1  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.37 
 
 		 835 aa  77.8  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  22.14 
 
 		 878 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  22.62 
 
 		 850 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  25.06 
 
 		 821 aa  75.1  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  25.04 
 
 		 855 aa  75.1  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  22.79 
 
 		 845 aa  74.7  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  25.84 
 
 		 857 aa  74.7  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  23.52 
 
 		 887 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  25.49 
 
 		 821 aa  73.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  25.21 
 
 		 804 aa  71.6  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  27.52 
 
 		 858 aa  71.2  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  24.68 
 
 		 857 aa  70.5  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1472  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  25.37 
 
 		 414 aa  69.7  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4468  protein of unknown function DUF214  31.47 
 
 		 855 aa  69.7  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  24.11 
 
 		 825 aa  69.7  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  25.13 
 
 		 793 aa  69.7  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  32.47 
 
 		 795 aa  69.3  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  23.51 
 
 		 889 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  23.39 
 
 		 887 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  23.98 
 
 		 880 aa  67.8  0.0000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  25.63 
 
 		 825 aa  67  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  24.08 
 
 		 826 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  24.71 
 
 		 849 aa  66.6  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  26.34 
 
 		 866 aa  66.6  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  32.07 
 
 		 800 aa  65.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  26.51 
 
 		 802 aa  64.7  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  26.43 
 
 		 930 aa  63.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  25.2 
 
 		 806 aa  63.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0692  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  25.51 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.374483  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  23.96 
 
 		 836 aa  62.4  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  35.29 
 
 		 857 aa  62  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  26.65 
 
 		 819 aa  61.6  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  25.5 
 
 		 827 aa  61.6  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  34.56 
 
 		 853 aa  61.6  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>