More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2918 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 226 aa  438  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.09 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3035  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.89 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738115  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.04 
 
 		 220 aa  108  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.16 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.73 
 
 		 222 aa  104  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  31 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  31.58 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.93 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  32.87 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  32.74 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  36.27 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.78 
 
 		 242 aa  99.4  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.49 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.41 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  34.08 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.42 
 
 		 225 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.38 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 230 aa  92.4  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.07 
 
 		 225 aa  92  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.64 
 
 		 219 aa  92  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  32.57 
 
 		 224 aa  91.7  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  34.38 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0602  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.628877 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  33.85 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 214 aa  90.1  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  30.77 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 222 aa  89.4  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  28.71 
 
 		 211 aa  88.6  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  29.86 
 
 		 236 aa  88.6  7e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  32.73 
 
 		 224 aa  88.2  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  28.71 
 
 		 211 aa  88.6  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.12 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  30.69 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  29.9 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 224 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.38 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.35 
 
 		 223 aa  85.9  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.14 
 
 		 226 aa  85.5  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3511  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 233 aa  85.5  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  28.71 
 
 		 211 aa  85.5  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  28.71 
 
 		 211 aa  85.5  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2565  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 235 aa  85.5  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0695171  normal  0.0307054 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  28.71 
 
 		 211 aa  85.5  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  28.71 
 
 		 211 aa  85.5  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  28.23 
 
 		 211 aa  85.5  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 241 aa  85.1  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  27.88 
 
 		 210 aa  85.1  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 230 aa  85.1  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  27.88 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  28.23 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  28.23 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3408  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.04 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  32.65 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  28.23 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  28.23 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  28.23 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  28.23 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  28.23 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2737  cAMP-regulatory protein  27.88 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  27.75 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  36.43 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.67 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.46 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2459  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000341213 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  26.26 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.28 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0027  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3062  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.61 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  27.5 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4881  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.484233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  27.27 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3029  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.02 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  27.4 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28321  putative regulatory protein  32.55 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.270503 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4798  cyclic nucleotide-binding protein  29.19 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>