More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2588 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2588  alpha amylase  100 
 
 		 598 aa  1218    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0774  Alpha amylase, catalytic region  47.28 
 
 		 589 aa  546  1e-154  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02161  putative sucrose phosphorylase  44.46 
 
 		 584 aa  530  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1771  alpha amylase catalytic region  44.26 
 
 		 585 aa  523  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3210  sucrose phosphorylase  45.21 
 
 		 596 aa  522  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0418  alpha amylase, catalytic region  47.07 
 
 		 577 aa  513  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.537622  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1824  putative sucrose phosphorylase  47.41 
 
 		 587 aa  504  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.552548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2580  alpha amylase, catalytic region  46.93 
 
 		 578 aa  499  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.008896  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2566  alpha amylase, catalytic region  46.93 
 
 		 578 aa  499  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0104089  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2573  alpha amylase, catalytic region  46.93 
 
 		 578 aa  499  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000337914  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2164  alpha amylase, catalytic region  44.08 
 
 		 586 aa  497  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.659302  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2846  alpha amylase, catalytic region  43.93 
 
 		 581 aa  485  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.218279  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2600  sucrose phosphorylase  42.91 
 
 		 591 aa  475  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0506  putative sucrose phosphorylase  43.28 
 
 		 544 aa  465  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01286  predicted glucosyltransferase  41.54 
 
 		 559 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1519  alpha amylase family protein  41.54 
 
 		 559 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1813  alpha amylase family protein  41.81 
 
 		 559 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.653374 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2316  alpha amylase catalytic region  41.54 
 
 		 559 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.278573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1248  alpha amylase catalytic region  44.64 
 
 		 568 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55232  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1424  alpha amylase family protein  41.71 
 
 		 559 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2337  alpha amylase catalytic region  41.36 
 
 		 559 aa  449  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0459721  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0665  alpha amylase catalytic region  43.96 
 
 		 555 aa  448  1.0000000000000001e-124  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.694695  normal  0.614349 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3029  alpha amylase catalytic subunit  42.93 
 
 		 556 aa  443  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.172997 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1523  alpha amylase catalytic region  40.04 
 
 		 561 aa  438  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.346384  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2165  alpha amylase, catalytic region  41.59 
 
 		 565 aa  420  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08951  glycoside hydrolase family protein  33.95 
 
 		 586 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.497034  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06751  glycoside hydrolase family protein  34.99 
 
 		 578 aa  358  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.335085 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09141  glycoside hydrolase family protein  32.37 
 
 		 583 aa  358  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000264002 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08971  glycoside hydrolase family protein  34.68 
 
 		 586 aa  355  2e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.540308  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0838  alpha amylase domain-containing protein  33.81 
 
 		 586 aa  353  7e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10441  glycoside hydrolase family protein  34.44 
 
 		 589 aa  353  7e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0246  alpha amylase domain-containing protein  33.46 
 
 		 583 aa  352  8.999999999999999e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2243  alpha amylase domain-containing protein  35.98 
 
 		 575 aa  329  1.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2606  alpha amylase domain-containing protein  37.57 
 
 		 575 aa  327  5e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.281377 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3361  alpha amylase catalytic region  31.06 
 
 		 491 aa  187  7e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0232  sucrose phosphorylase  29.45 
 
 		 493 aa  182  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1331  sucrose phosphorylase  29.08 
 
 		 508 aa  177  4e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00201506  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1779  glycosidase  27.01 
 
 		 489 aa  176  8e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1542  sucrose phosphorylase  29.28 
 
 		 485 aa  172  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.296567  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0066  sucrose phosphorylase  30.1 
 
 		 492 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.530318  hitchhiker  0.00316152 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3990  sucrose phosphorylase  29.56 
 
 		 493 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00149762  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0241  Sucrose phosphorylase  28.02 
 
 		 483 aa  169  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0061  sucrose phosphorylase  29.9 
 
 		 492 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0065  sucrose phosphorylase  30.36 
 
 		 492 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0384  glycosidase  28.4 
 
 		 492 aa  167  4e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00983965  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  26.28 
 
 		 649 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4288  sucrose phosphorylase  29.94 
 
 		 492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00965772  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01971  sucrose phosphorylase  29.65 
 
 		 498 aa  163  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0064  sucrose phosphorylase  29.57 
 
 		 494 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000722293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  28.87 
 
 		 643 aa  162  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  26.13 
 
 		 645 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0062  sucrose phosphorylase  29.57 
 
 		 494 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0945971  unclonable  0.0000350237 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0066  sucrose phosphorylase  29.57 
 
 		 494 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000218626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0651  sucrose phosphorylase  29 
 
 		 482 aa  161  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0824794  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  27.5 
 
 		 644 aa  155  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  28.01 
 
 		 651 aa  154  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  26.88 
 
 		 650 aa  154  7e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  26.9 
 
 		 650 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  25.2 
 
 		 646 aa  152  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  26.17 
 
 		 650 aa  152  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  25.45 
 
 		 650 aa  151  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  26.06 
 
 		 652 aa  150  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  27.7 
 
 		 638 aa  150  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  26.12 
 
 		 663 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  26.45 
 
 		 636 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  26.48 
 
 		 651 aa  144  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126302  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  26.95 
 
 		 639 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25520  glycosidase  26.76 
 
 		 642 aa  139  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.563974  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  33.45 
 
 		 1088 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  33.45 
 
 		 1088 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  26 
 
 		 672 aa  137  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 641 aa  137  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  28.21 
 
 		 638 aa  136  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  33.1 
 
 		 1088 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  32.86 
 
 		 1100 aa  136  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  23.75 
 
 		 534 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  23.95 
 
 		 551 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  25.74 
 
 		 661 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  31.58 
 
 		 1110 aa  133  7.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  30.69 
 
 		 548 aa  130  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  30.13 
 
 		 1101 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  29.93 
 
 		 1092 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  31.36 
 
 		 1088 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  30.96 
 
 		 1088 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  32.74 
 
 		 1164 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  30.6 
 
 		 1098 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  32.74 
 
 		 1164 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  30.28 
 
 		 1085 aa  128  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  32.27 
 
 		 1108 aa  128  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  30.92 
 
 		 1137 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  30.92 
 
 		 1137 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  30.92 
 
 		 1137 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  30.47 
 
 		 1115 aa  127  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  32.38 
 
 		 1160 aa  127  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  32.14 
 
 		 1131 aa  127  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  32.14 
 
 		 1131 aa  127  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  32.14 
 
 		 1131 aa  127  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  32.14 
 
 		 1131 aa  127  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  32.14 
 
 		 1131 aa  127  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  32.14 
 
 		 1131 aa  127  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>