More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1659 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  100 
 
 		 408 aa  819    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  51.23 
 
 		 417 aa  373  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  50.38 
 
 		 438 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0846  type II secretion system protein E  55.24 
 
 		 418 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55890  putative type II secretion system protein  52.28 
 
 		 421 aa  362  8e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4869  putative type II secretion system protein  52.73 
 
 		 421 aa  358  8e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  50.54 
 
 		 472 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  49.47 
 
 		 453 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4393  type II secretion system protein E  52.36 
 
 		 418 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  49.33 
 
 		 440 aa  348  8e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  48.79 
 
 		 444 aa  348  1e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4853  type II/IV secretion system protein, putative  51.85 
 
 		 418 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  47.48 
 
 		 449 aa  347  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  48.25 
 
 		 438 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  47.98 
 
 		 454 aa  346  5e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  53.29 
 
 		 455 aa  345  6e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  49.2 
 
 		 452 aa  345  6e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  48.95 
 
 		 449 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  46.7 
 
 		 440 aa  344  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  48.93 
 
 		 450 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  52.59 
 
 		 432 aa  342  5.999999999999999e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  47.44 
 
 		 455 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  47.71 
 
 		 447 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  45.43 
 
 		 467 aa  341  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  46.82 
 
 		 445 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  46.63 
 
 		 451 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  45.13 
 
 		 449 aa  340  2.9999999999999998e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  46.63 
 
 		 451 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  46.9 
 
 		 446 aa  340  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  46.61 
 
 		 438 aa  339  4e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  47.71 
 
 		 447 aa  339  5e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  47.35 
 
 		 454 aa  338  7e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  54.08 
 
 		 462 aa  338  9e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  52.05 
 
 		 624 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  46.76 
 
 		 460 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  46.63 
 
 		 450 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  46.9 
 
 		 450 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  46.9 
 
 		 450 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  46.9 
 
 		 450 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  46.22 
 
 		 462 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  45.67 
 
 		 459 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  45.69 
 
 		 454 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  45.45 
 
 		 456 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  44.86 
 
 		 451 aa  336  5e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  47.17 
 
 		 469 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  53.94 
 
 		 474 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  47.17 
 
 		 469 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  47.03 
 
 		 449 aa  335  9e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  47.86 
 
 		 469 aa  335  9e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  46.63 
 
 		 447 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0646  type II secretion system protein E  52.33 
 
 		 423 aa  334  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  49.57 
 
 		 458 aa  335  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  46.63 
 
 		 447 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  53 
 
 		 441 aa  335  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  46.63 
 
 		 447 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  49.84 
 
 		 463 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  45.7 
 
 		 408 aa  333  5e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  48.6 
 
 		 467 aa  332  6e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  52.4 
 
 		 442 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  48.32 
 
 		 466 aa  332  1e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  47.49 
 
 		 455 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  47.49 
 
 		 455 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  46.49 
 
 		 464 aa  330  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  47.26 
 
 		 454 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  47.26 
 
 		 454 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  47.72 
 
 		 463 aa  330  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  48.28 
 
 		 455 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  46.9 
 
 		 455 aa  329  6e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  52.05 
 
 		 515 aa  329  6e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  48.28 
 
 		 454 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  47.33 
 
 		 437 aa  328  9e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  46.9 
 
 		 455 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  52.45 
 
 		 472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  53 
 
 		 472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  48.5 
 
 		 474 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  46.9 
 
 		 455 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  46.9 
 
 		 455 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  50.46 
 
 		 594 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  51.74 
 
 		 523 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  51.74 
 
 		 523 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  51.74 
 
 		 521 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  47.85 
 
 		 452 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  51.74 
 
 		 520 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  49.58 
 
 		 478 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  48.26 
 
 		 468 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  51.74 
 
 		 520 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  46.02 
 
 		 677 aa  327  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  51.74 
 
 		 520 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  46.48 
 
 		 482 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  44.74 
 
 		 472 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  49.69 
 
 		 634 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  45.28 
 
 		 457 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  46.2 
 
 		 467 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  47.24 
 
 		 563 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  46.48 
 
 		 490 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  43.32 
 
 		 473 aa  323  3e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0302  type II secretion system protein E  46.49 
 
 		 484 aa  322  8e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  46.34 
 
 		 428 aa  321  9.999999999999999e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  47.24 
 
 		 487 aa  321  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  44.39 
 
 		 481 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>