280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4231 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4231  Amidohydrolase 3  100 
 
 		 626 aa  1308    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1737  Amidohydrolase 3  38.71 
 
 		 618 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.493619  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2102  amidohydrolase 3  36.79 
 
 		 928 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  33.39 
 
 		 584 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  32.26 
 
 		 575 aa  270  7e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  32.1 
 
 		 575 aa  268  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  33.97 
 
 		 583 aa  253  8.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  30.68 
 
 		 601 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  27.84 
 
 		 537 aa  159  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  27.66 
 
 		 581 aa  156  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  27.15 
 
 		 625 aa  153  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  26.2 
 
 		 536 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  26.2 
 
 		 536 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  26.2 
 
 		 536 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  26.6 
 
 		 552 aa  147  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  28.33 
 
 		 554 aa  140  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  26.34 
 
 		 542 aa  139  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  26.8 
 
 		 563 aa  139  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  26.47 
 
 		 545 aa  136  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  27.22 
 
 		 554 aa  136  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  26.92 
 
 		 538 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  26.1 
 
 		 555 aa  131  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  26.25 
 
 		 586 aa  132  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  24.81 
 
 		 587 aa  130  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  25.53 
 
 		 547 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  24.73 
 
 		 547 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  24.91 
 
 		 555 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  26.56 
 
 		 547 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  26.47 
 
 		 533 aa  128  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  26.35 
 
 		 557 aa  127  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  24.83 
 
 		 592 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1877  amidohydrolase 3  29.7 
 
 		 736 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.393763  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  24.22 
 
 		 585 aa  124  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  26.14 
 
 		 604 aa  124  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1989  amidohydrolase 3  28.75 
 
 		 737 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.829249  normal  0.529399 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  24.91 
 
 		 540 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  25.44 
 
 		 564 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  25.48 
 
 		 581 aa  118  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  26.79 
 
 		 601 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  25.04 
 
 		 569 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  24.7 
 
 		 544 aa  114  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  26.56 
 
 		 565 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  27.01 
 
 		 548 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  25.25 
 
 		 556 aa  111  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  25.04 
 
 		 553 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  25.99 
 
 		 548 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  23.06 
 
 		 590 aa  109  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  26.44 
 
 		 539 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  23.05 
 
 		 539 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  23.62 
 
 		 539 aa  107  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  25.38 
 
 		 552 aa  103  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  25.94 
 
 		 546 aa  103  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  25.58 
 
 		 585 aa  103  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  23.59 
 
 		 540 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  23.8 
 
 		 543 aa  103  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  24.83 
 
 		 522 aa  103  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  25.17 
 
 		 560 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  23.86 
 
 		 564 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  23.34 
 
 		 650 aa  102  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  25.57 
 
 		 620 aa  101  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  25.29 
 
 		 537 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  25.29 
 
 		 557 aa  100  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  24.5 
 
 		 543 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  23.8 
 
 		 550 aa  99.4  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  24.37 
 
 		 541 aa  99.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  24.35 
 
 		 545 aa  98.6  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  23.86 
 
 		 543 aa  98.6  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  31.82 
 
 		 525 aa  98.6  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  25.8 
 
 		 576 aa  97.8  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  31.3 
 
 		 580 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  23.53 
 
 		 560 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  24.27 
 
 		 553 aa  96.3  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  31.3 
 
 		 580 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  24.4 
 
 		 589 aa  94.7  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  23.02 
 
 		 563 aa  94.7  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2885  amidohydrolase 3  30.37 
 
 		 569 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00571861  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  23.99 
 
 		 549 aa  92.4  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3889  Amidohydrolase 3  24.36 
 
 		 624 aa  92.8  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  25.14 
 
 		 556 aa  92.8  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  24.22 
 
 		 560 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  24.43 
 
 		 527 aa  91.3  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  25.24 
 
 		 505 aa  90.9  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  23.93 
 
 		 606 aa  90.9  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  24.1 
 
 		 574 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  23.68 
 
 		 522 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  22.94 
 
 		 522 aa  90.9  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  23.34 
 
 		 541 aa  90.1  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0099  hypothetical protein  23.14 
 
 		 577 aa  90.1  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.119429  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  24.54 
 
 		 576 aa  89  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  23.19 
 
 		 522 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3625  amidohydrolase 3  27.65 
 
 		 556 aa  87.8  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  23.64 
 
 		 550 aa  87.4  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  24.6 
 
 		 520 aa  87  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  23.15 
 
 		 619 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  23.49 
 
 		 539 aa  86.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  25.23 
 
 		 544 aa  85.5  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  22.63 
 
 		 648 aa  85.9  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  21.9 
 
 		 520 aa  85.9  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3750  Amidohydrolase 3  24.56 
 
 		 505 aa  85.1  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  22.77 
 
 		 522 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>