245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2275 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 		 878 aa  1827    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  30.06 
 
 		 1144 aa  393  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.52 
 
 		 971 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  29.01 
 
 		 906 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  28.4 
 
 		 962 aa  312  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.48 
 
 		 984 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.65 
 
 		 1362 aa  217  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.06 
 
 		 835 aa  196  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.1 
 
 		 842 aa  192  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7497  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.84 
 
 		 1243 aa  189  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.73 
 
 		 813 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  22.68 
 
 		 1270 aa  177  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  23.95 
 
 		 837 aa  176  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  25.77 
 
 		 839 aa  174  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  24.87 
 
 		 813 aa  173  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  24.75 
 
 		 833 aa  168  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.48 
 
 		 818 aa  164  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  24.14 
 
 		 863 aa  158  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  27.75 
 
 		 831 aa  157  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  24.64 
 
 		 864 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.3 
 
 		 817 aa  152  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  23.53 
 
 		 823 aa  148  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  24.2 
 
 		 824 aa  148  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  24.11 
 
 		 786 aa  147  9e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  24.14 
 
 		 785 aa  146  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  23.8 
 
 		 819 aa  144  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  28.31 
 
 		 860 aa  145  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  23.19 
 
 		 819 aa  142  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  27 
 
 		 875 aa  141  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  25.94 
 
 		 880 aa  142  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  23.13 
 
 		 846 aa  141  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.96 
 
 		 872 aa  140  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  28.27 
 
 		 840 aa  139  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  23.72 
 
 		 871 aa  139  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  24.55 
 
 		 819 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.52 
 
 		 845 aa  138  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  25.1 
 
 		 843 aa  137  9e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  27.35 
 
 		 793 aa  134  7.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  25.99 
 
 		 837 aa  131  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  26.83 
 
 		 897 aa  130  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  23.57 
 
 		 861 aa  130  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  26.17 
 
 		 815 aa  130  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  27.39 
 
 		 812 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06535  hypothetical protein  27.39 
 
 		 802 aa  125  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.63 
 
 		 845 aa  125  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  25.12 
 
 		 763 aa  124  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000658  beta-mannosidase  25.59 
 
 		 802 aa  123  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  25.65 
 
 		 891 aa  123  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  23.1 
 
 		 891 aa  122  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  22.8 
 
 		 824 aa  122  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  26.72 
 
 		 829 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.67 
 
 		 744 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  22.53 
 
 		 734 aa  115  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5307  Beta-mannosidase  27.46 
 
 		 799 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29300  Beta-mannosidase precursor (Mannanase)  22.46 
 
 		 847 aa  111  6e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  26.52 
 
 		 724 aa  111  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  26.14 
 
 		 739 aa  110  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  23.36 
 
 		 845 aa  104  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2713  glycoside hydrolase family protein  26.09 
 
 		 663 aa  99  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0942684  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  20.98 
 
 		 720 aa  99  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  25.63 
 
 		 815 aa  96.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1473  glycoside hydrolase family protein  24.94 
 
 		 816 aa  93.6  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01742  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  25.62 
 
 		 940 aa  92.4  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.875366  normal  0.643329 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0268  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24 
 
 		 843 aa  91.3  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.617215  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43820  Glycoside hydrolase family 2 (Mannanase, beta-galactosidase)  20.92 
 
 		 838 aa  90.1  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.893374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0169  mannosidase  27.55 
 
 		 821 aa  87.8  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  25.3 
 
 		 807 aa  85.5  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  24.49 
 
 		 824 aa  85.1  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1202  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.78 
 
 		 619 aa  84.3  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302396  normal  0.234387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.53 
 
 		 757 aa  83.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3792  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.59 
 
 		 826 aa  81.6  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.73 
 
 		 811 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  23.58 
 
 		 1049 aa  79.3  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1730  glycosy hydrolase family protein  24.68 
 
 		 600 aa  78.6  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0782233  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4121  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.48 
 
 		 826 aa  78.2  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1715  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  23.06 
 
 		 882 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0528  beta-mannosidase-related protein  24.9 
 
 		 839 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  23.65 
 
 		 889 aa  76.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.17 
 
 		 884 aa  75.5  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3078  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.98 
 
 		 609 aa  75.1  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.19 
 
 		 623 aa  74.7  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2529  Beta-mannosidase  28.42 
 
 		 882 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.869345  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0638  glycosy hydrolase family protein  25.3 
 
 		 839 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0247  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.8 
 
 		 620 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  23.99 
 
 		 919 aa  73.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0815  glycosyl hydrolase family protein  25.3 
 
 		 839 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  24.25 
 
 		 972 aa  72.4  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0039  beta-mannosidase-related protein  25.3 
 
 		 839 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  23.7 
 
 		 602 aa  72  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2885  beta-mannosidase-related protein  25.3 
 
 		 839 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2200  beta-mannosidase-related protein  25.3 
 
 		 839 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0652  glycosy hydrolase family protein  25.3 
 
 		 839 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2507  beta-mannosidase-related protein  25.3 
 
 		 839 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365324  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1074  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  27.48 
 
 		 815 aa  72  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822131  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5363  glycoside hydrolase family protein  21.55 
 
 		 853 aa  71.2  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6019  mannosidase  24.03 
 
 		 820 aa  70.5  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  24.51 
 
 		 1012 aa  70.1  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.64 
 
 		 808 aa  70.1  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.36 
 
 		 1005 aa  69.3  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.09 
 
 		 799 aa  68.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>