108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0854 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0854  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 149 aa  308  1e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000058861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  34.75 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1449  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 152 aa  60.1  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17980  hypothetical protein  34.48 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  25 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0789  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.232655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0773  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  30.43 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  26.72 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3747  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 181 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0512718  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2243  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 334 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  29.63 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1287  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 168 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4468  transcriptional regulator, TrmB  29.63 
 
 		 206 aa  47.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160154  normal  0.0294539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  34.18 
 
 		 168 aa  47.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_003296  RS02203  transcription regulator transcription regulator protein  25.17 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0469  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 193 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 175 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 321 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  27.12 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 191 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 177 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1494  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.386446  hitchhiker  0.00719492 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03706  transcription regulator protein  22.46 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344298  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 325 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  23.08 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 155 aa  43.5  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  29.21 
 
 		 141 aa  43.5  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 209 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  25.47 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  23.08 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  20.29 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  22.58 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  25.22 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  25.22 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  25.22 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  25.44 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  27.42 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 149 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  20.74 
 
 		 139 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 157 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 156 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 		 146 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  25.45 
 
 		 151 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2923  MarR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  22.63 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3865  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115918  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  20.47 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  24.78 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4961  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 		 192 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0717313  normal  0.154952 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2782  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 		 192 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00307717  normal  0.0921189 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  27.71 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  20.71 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>