285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0017 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  261  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  65.6 
 
 		 129 aa  169  9e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0016  hypothetical protein  66.67 
 
 		 127 aa  154  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.204452  unclonable  0.000000883308 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  56.8 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  58.06 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  57.5 
 
 		 129 aa  140  8e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  45.76 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  47.37 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  44.44 
 
 		 127 aa  97.8  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  43.1 
 
 		 134 aa  97.1  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  47.86 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  46.67 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  40.17 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  45 
 
 		 119 aa  94.7  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  44.35 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  44.25 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  45.83 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  45.83 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  42.5 
 
 		 120 aa  92  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  42.74 
 
 		 127 aa  91.3  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  41.88 
 
 		 160 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  40.68 
 
 		 115 aa  90.9  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  42.98 
 
 		 167 aa  90.5  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  42.86 
 
 		 123 aa  90.1  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  45.76 
 
 		 116 aa  90.1  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  40.8 
 
 		 122 aa  90.1  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  38.33 
 
 		 119 aa  88.2  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  41.94 
 
 		 123 aa  87.8  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  43.3 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  42.37 
 
 		 153 aa  86.7  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  41.03 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  44.86 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  39.5 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  44.44 
 
 		 118 aa  84  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  42.37 
 
 		 119 aa  84  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  41.18 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  47.47 
 
 		 186 aa  84  7e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  41.18 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  42 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  42.11 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  41.18 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  40.98 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  43.62 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  43.59 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  38.33 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  45.63 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  42.37 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  40.68 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  39.66 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  44.79 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  46 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  41.67 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  36.89 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  39.45 
 
 		 118 aa  80.1  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  36.29 
 
 		 119 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  44.68 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3413  protein of unknown function UPF0102  39.47 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  41.84 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  41.35 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  43.14 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  40.68 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  41.03 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  45.83 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  43.88 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  45.83 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  40.62 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  43.75 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  41.41 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  36.51 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  36.36 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  37.9 
 
 		 121 aa  76.6  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  36.97 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  38.1 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  44.9 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  39.67 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  41.51 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  37.25 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  38.54 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  37.62 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  43.69 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  36.29 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  38.79 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  39.36 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  35.24 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  35.24 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2464  hypothetical protein  34.45 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  37.3 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  37.89 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5237  protein of unknown function UPF0102  38 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0351  hypothetical protein  39.6 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0502533  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  35.25 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  37 
 
 		 128 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  36.21 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  35 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  35.25 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  39.09 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2148  hypothetical protein  39.5 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3675  protein of unknown function UPF0102  38.58 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  41.12 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>