More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1995 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  100 
 
 		 499 aa  1037    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  47.23 
 
 		 505 aa  475  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03825  hypothetical protein  46.93 
 
 		 508 aa  440  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1874  All-trans-retinol 13,14-reductase  40.16 
 
 		 501 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2002  FAD dependent oxidoreductase  38.65 
 
 		 510 aa  375  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2665  putative phytoene dehydrogenase  27.18 
 
 		 495 aa  177  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  28.05 
 
 		 544 aa  163  8.000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 534 aa  157  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 		 547 aa  156  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0906  hypothetical protein  23.22 
 
 		 480 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396685  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  23.98 
 
 		 535 aa  145  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0436  All-trans-retinol 13,14-reductase  23.64 
 
 		 511 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.601478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4146  All-trans-retinol 13,14-reductase  21.86 
 
 		 562 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.559453  decreased coverage  0.00452261 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0425  All-trans-retinol 13,14-reductase  23.57 
 
 		 511 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  22.29 
 
 		 520 aa  99  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  26.25 
 
 		 504 aa  96.7  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  23.15 
 
 		 542 aa  94.7  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.26 
 
 		 522 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  23.99 
 
 		 502 aa  84  0.000000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  22.44 
 
 		 501 aa  83.2  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  24.32 
 
 		 505 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  24.67 
 
 		 508 aa  81.3  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  23.56 
 
 		 499 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54800  carotenoid isomerase-like protein  20.77 
 
 		 923 aa  80.5  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0759229  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0245  amine oxidase  21.3 
 
 		 491 aa  80.5  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  22.99 
 
 		 938 aa  80.5  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  24.42 
 
 		 512 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  24.42 
 
 		 512 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  23.03 
 
 		 499 aa  77.4  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  23.32 
 
 		 510 aa  77  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  52.31 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2640  amine oxidase  22.72 
 
 		 495 aa  74.7  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  23.51 
 
 		 499 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  23.58 
 
 		 507 aa  74.3  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  23 
 
 		 523 aa  73.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3281  FAD dependent oxidoreductase  22.67 
 
 		 479 aa  72.4  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463065  normal  0.0612809 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  29.21 
 
 		 484 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3286  FAD dependent oxidoreductase  22.09 
 
 		 488 aa  72.8  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17531  phytoene dehydrogenase  21.29 
 
 		 501 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  23.37 
 
 		 506 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  23.32 
 
 		 503 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  24.1 
 
 		 505 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17571  phytoene dehydrogenase and related protein  22.16 
 
 		 501 aa  70.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.274386  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  20.83 
 
 		 740 aa  70.5  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  20.29 
 
 		 496 aa  70.1  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  25.29 
 
 		 509 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  23.28 
 
 		 516 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  21.8 
 
 		 489 aa  68.2  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  25.6 
 
 		 509 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  23.14 
 
 		 509 aa  67  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1834  FAD dependent oxidoreductase  21.15 
 
 		 504 aa  67  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0259899 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  47.69 
 
 		 476 aa  66.6  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  23.23 
 
 		 503 aa  66.6  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17731  phytoene dehydrogenase  21.29 
 
 		 501 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  22.78 
 
 		 506 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  21.47 
 
 		 517 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  22.12 
 
 		 522 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1708  hypothetical protein  21.54 
 
 		 509 aa  65.1  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.718334  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  23.09 
 
 		 518 aa  64.3  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  22.47 
 
 		 497 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16851  phytoene dehydrogenase and related protein  21.9 
 
 		 503 aa  63.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  22.61 
 
 		 509 aa  63.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  22.22 
 
 		 511 aa  63.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  22.48 
 
 		 506 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1658  UDP-galactopyranose mutase  20.34 
 
 		 501 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2059  hypothetical protein  20.34 
 
 		 509 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0409241  normal  0.0351139 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  21.77 
 
 		 509 aa  61.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  36.36 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  36.36 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  34.62 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  36.36 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  21.54 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  38.96 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  23.72 
 
 		 525 aa  60.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  30.87 
 
 		 520 aa  60.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4129  FAD dependent oxidoreductase  20.49 
 
 		 504 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.60213 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  22.29 
 
 		 520 aa  60.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  36.36 
 
 		 436 aa  60.1  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  36.36 
 
 		 436 aa  60.1  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  22.49 
 
 		 497 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  21.97 
 
 		 518 aa  60.1  0.00000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  36.36 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  23.93 
 
 		 504 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  22.59 
 
 		 491 aa  60.1  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  23.4 
 
 		 510 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  23.91 
 
 		 507 aa  59.7  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  35.06 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  33.73 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  23.05 
 
 		 555 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0386  phytoene dehydrogenase related enzyme  21.68 
 
 		 500 aa  57.8  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  21.56 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  31.69 
 
 		 520 aa  57.4  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  21.79 
 
 		 503 aa  57.4  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  24.93 
 
 		 529 aa  57  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  21.01 
 
 		 556 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  21.93 
 
 		 501 aa  57  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  23.55 
 
 		 494 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1329  FAD dependent oxidoreductase  20.75 
 
 		 501 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914458  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  22.16 
 
 		 497 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0939  amine oxidase  19.5 
 
 		 496 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>