More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2139 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  100 
 
 
374 aa  743    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4524  curculin domain-containing protein  39.73 
 
 
226 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.465524  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1547  curculin domain-containing protein  41 
 
 
298 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000198605  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1091  curculin-like (mannose-binding) lectin  41 
 
 
298 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000304641  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1571  curculin domain-containing protein  41 
 
 
298 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00304753  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  42.11 
 
 
788 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0777  peptidase S53 propeptide  39.36 
 
 
777 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2237  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  39.39 
 
 
516 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120186  hitchhiker  0.00817186 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1092  curculin-like (mannose-binding) lectin  35.69 
 
 
270 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000112862  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1572  curculin domain-containing protein  35.69 
 
 
270 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136518  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1548  curculin domain-containing protein  35.69 
 
 
270 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000000088677  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  46.34 
 
 
327 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  49.04 
 
 
350 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  48.15 
 
 
306 aa  106  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  54.74 
 
 
380 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.07 
 
 
329 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  49.17 
 
 
475 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  48.04 
 
 
366 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  48.96 
 
 
345 aa  98.6  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  44.54 
 
 
495 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.04 
 
 
176 aa  97.4  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.97 
 
 
332 aa  97.1  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  44.74 
 
 
331 aa  96.7  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  52.81 
 
 
236 aa  95.9  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  48.57 
 
 
398 aa  96.3  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  43.08 
 
 
333 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  45.19 
 
 
373 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
333 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  43.75 
 
 
392 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  53.76 
 
 
319 aa  93.2  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  46.94 
 
 
180 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  52.22 
 
 
446 aa  92.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  48.04 
 
 
349 aa  92.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  44.23 
 
 
348 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  45.37 
 
 
222 aa  92  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  45.79 
 
 
453 aa  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  44.55 
 
 
367 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  45.45 
 
 
340 aa  90.5  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  45.54 
 
 
452 aa  90.5  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  44.04 
 
 
502 aa  90.1  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  46.73 
 
 
347 aa  90.1  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  45.05 
 
 
491 aa  90.1  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  41.07 
 
 
368 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  42 
 
 
337 aa  89.4  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44.68 
 
 
438 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  46.94 
 
 
375 aa  88.2  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  44.55 
 
 
417 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  46.96 
 
 
160 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  45.13 
 
 
281 aa  87  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  41.35 
 
 
340 aa  87.4  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  45.69 
 
 
343 aa  87  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0388  NLP/P60 protein  44 
 
 
480 aa  86.7  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  36.97 
 
 
337 aa  86.7  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  47.06 
 
 
235 aa  86.3  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  38.24 
 
 
208 aa  86.3  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  44.88 
 
 
463 aa  85.5  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  41.74 
 
 
348 aa  85.9  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  39.42 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  40.5 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  38 
 
 
347 aa  85.5  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  41.18 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  42.99 
 
 
366 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  41.12 
 
 
315 aa  84  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  41.41 
 
 
150 aa  84  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  44.44 
 
 
400 aa  84  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  37.06 
 
 
388 aa  84  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  48.48 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  39.23 
 
 
372 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  39.23 
 
 
372 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  38.89 
 
 
394 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  45 
 
 
116 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  42.72 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  38.32 
 
 
432 aa  82.8  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  42.2 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.16 
 
 
390 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  39.23 
 
 
372 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.93 
 
 
280 aa  82.4  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  43.69 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2700  NLP/P60 protein  41.76 
 
 
188 aa  81.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000637216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.22 
 
 
393 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  43.69 
 
 
199 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  42.06 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  42.73 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06710  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  50 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  42.72 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4552  putative curculin-like lectin  30.69 
 
 
852 aa  80.5  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.602066  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.67 
 
 
531 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  47.62 
 
 
350 aa  80.5  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  47.47 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  44.76 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  37.19 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  43.43 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  34.86 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  42.72 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.43 
 
 
556 aa  79.7  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  38.79 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8441  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
422 aa  79.7  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  44.44 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  44.55 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>