More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0452 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0420  DNA polymerase III PolC  39.11 
 
 		 1442 aa  875    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  100 
 
 		 1433 aa  2963    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf732  DNA polymerase III PolC  38.81 
 
 		 1438 aa  873    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  49.18 
 
 		 1436 aa  1296    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  48.34 
 
 		 970 aa  726    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  55.81 
 
 		 1426 aa  1524    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  46.77 
 
 		 1468 aa  1146    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  48.25 
 
 		 1388 aa  1129    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  54.03 
 
 		 1433 aa  1340    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  54.11 
 
 		 1433 aa  1344    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  53.95 
 
 		 1433 aa  1340    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  46.58 
 
 		 1465 aa  1080    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  54.03 
 
 		 1433 aa  1343    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  42.82 
 
 		 1493 aa  975    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  52.66 
 
 		 1440 aa  1410    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  54.11 
 
 		 1433 aa  1344    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  59.53 
 
 		 1407 aa  1571    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  50.94 
 
 		 1444 aa  1337    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  44.44 
 
 		 1390 aa  1080    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  54.11 
 
 		 1433 aa  1344    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  50.86 
 
 		 1438 aa  1295    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  54.11 
 
 		 1433 aa  1344    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  53.87 
 
 		 1433 aa  1338    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  47.6 
 
 		 1421 aa  1205    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  43.35 
 
 		 1365 aa  1101    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0339  DNA polymerase III, alpha subunit  43.03 
 
 		 1479 aa  1026    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1045  DNA polymerase III, alpha subunit  59.52 
 
 		 1214 aa  1079    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186954  unclonable  0.0000000541415 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  51.34 
 
 		 1447 aa  1444    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  47.14 
 
 		 1362 aa  1097    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  57.89 
 
 		 1397 aa  1479    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  66.69 
 
 		 1442 aa  2010    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  48.29 
 
 		 1367 aa  1160    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  49.71 
 
 		 1435 aa  1368    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  59.43 
 
 		 1402 aa  1483    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1439  DNA polymerase III, alpha subunit  55.41 
 
 		 1210 aa  1011    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.476857  normal  0.05643 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  48.54 
 
 		 1367 aa  1163    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  57.64 
 
 		 1449 aa  1613    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  57.79 
 
 		 1449 aa  1616    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  50.86 
 
 		 1438 aa  1295    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  47.74 
 
 		 1443 aa  1214    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  53.65 
 
 		 1527 aa  1372    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0895  DNA-directed DNA polymerase  56.34 
 
 		 1212 aa  1041    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210067  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  46.67 
 
 		 1635 aa  1150    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  44.88 
 
 		 1437 aa  1090    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  43.9 
 
 		 1432 aa  1218    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  44.64 
 
 		 1437 aa  1142    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  45.63 
 
 		 1464 aa  1149    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  53.45 
 
 		 1433 aa  1340    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  53.7 
 
 		 1433 aa  1336    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3856  DNA polymerase III, alpha subunit  62.21 
 
 		 483 aa  619  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307747  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1808  DNA-directed DNA polymerase  39.73 
 
 		 989 aa  611  1e-173  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0349481  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  24.43 
 
 		 1127 aa  185  6e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1148 aa  184  1e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  25.46 
 
 		 1165 aa  171  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  24.29 
 
 		 1156 aa  167  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1265  DNA polymerase III, alpha subunit  23.54 
 
 		 1176 aa  166  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  24.18 
 
 		 1155 aa  165  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  24.18 
 
 		 1180 aa  165  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  24.35 
 
 		 1145 aa  163  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  25.08 
 
 		 1165 aa  162  4e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  24.12 
 
 		 1157 aa  160  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  24.03 
 
 		 1181 aa  159  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  23.18 
 
 		 1240 aa  159  5.0000000000000005e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  23.14 
 
 		 1130 aa  159  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  22.92 
 
 		 1170 aa  158  7e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4709  DNA polymerase III, alpha subunit  23.45 
 
 		 1214 aa  158  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204837  normal  0.0609725 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  22.17 
 
 		 1184 aa  157  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  22.81 
 
 		 1132 aa  155  4e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.65 
 
 		 595 aa  155  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  42.86 
 
 		 584 aa  154  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  42.22 
 
 		 584 aa  154  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1917  DNA polymerase III, alpha subunit  26.4 
 
 		 1607 aa  154  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0425764  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  24.08 
 
 		 1149 aa  152  4e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  41.12 
 
 		 590 aa  152  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  22.43 
 
 		 1170 aa  150  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  23.32 
 
 		 1139 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.1 
 
 		 584 aa  151  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.88 
 
 		 921 aa  150  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1233  DNA polymerase III, alpha subunit  24 
 
 		 1160 aa  150  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  45.66 
 
 		 560 aa  149  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  23.61 
 
 		 1151 aa  149  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  23.35 
 
 		 1155 aa  149  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  23.48 
 
 		 1156 aa  149  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  44.44 
 
 		 570 aa  149  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  23.14 
 
 		 1225 aa  148  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  23.52 
 
 		 1148 aa  147  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  44.38 
 
 		 574 aa  147  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.92 
 
 		 605 aa  147  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  36.6 
 
 		 616 aa  146  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  21.7 
 
 		 1510 aa  146  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  40 
 
 		 715 aa  145  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  23.32 
 
 		 1173 aa  144  9e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  45.05 
 
 		 613 aa  144  9e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  41.26 
 
 		 315 aa  144  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  41.26 
 
 		 315 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2412  DNA polymerase III subunit alpha  23.47 
 
 		 1159 aa  143  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.06 
 
 		 595 aa  143  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  23.48 
 
 		 1186 aa  142  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  22 
 
 		 1164 aa  143  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  40.78 
 
 		 315 aa  142  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>