More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2739 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2739  transport system permease protein  100 
 
 		 327 aa  605  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246804  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1002  transport system permease protein  52.63 
 
 		 333 aa  249  4e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2065  transport system permease protein  48.57 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2924  transport system permease protein  47.85 
 
 		 336 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0561377  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6079  transport system permease protein  53.02 
 
 		 348 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3805  transport system permease protein  54.09 
 
 		 348 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0258  transport system permease protein  53.57 
 
 		 334 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.737096  normal  0.065439 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8244  transport system permease protein  51.99 
 
 		 348 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5678  transport system permease protein  52.71 
 
 		 342 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3048  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  43.73 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1384  transport system permease protein  53.6 
 
 		 329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.135151 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1067  transport system permease protein  55.04 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.467913 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2404  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  55.04 
 
 		 329 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.716678  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0630  transport system permease protein  47.39 
 
 		 341 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.317375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3152  transport system permease protein  50.53 
 
 		 346 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2927  transport system permease protein  50.89 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4254  transport system permease protein  47.84 
 
 		 329 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.325099 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0732  transport system permease protein  46.32 
 
 		 341 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_004310  BR1345  iron compound ABC transporter, permease protein  53.21 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0794  transport system permease protein  47.9 
 
 		 341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1304  iron compound ABC transporter, permease protein  53.21 
 
 		 349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4384  transport system permease protein  48.75 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.122979 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1828  transport system permease protein  49.09 
 
 		 333 aa  199  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0490  transport system permease protein  51.71 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176737  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1341  transport system permease protein  48.79 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal  0.253719 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2512  transport system permease protein  49.46 
 
 		 326 aa  192  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3730  transport system permease protein  44.34 
 
 		 341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0510  transport system permease protein  46.23 
 
 		 333 aa  188  9e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531169 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0085  transport system permease protein  48.06 
 
 		 349 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  42.76 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  41.72 
 
 		 370 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  43.43 
 
 		 344 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  33.84 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  42.71 
 
 		 356 aa  162  6e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  37.33 
 
 		 366 aa  162  8.000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  41.74 
 
 		 350 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  40.62 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0463  hemin permease  37.68 
 
 		 351 aa  160  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  42.51 
 
 		 354 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1188  transport system permease protein  47.97 
 
 		 320 aa  159  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3694  transport system permease protein  42.14 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  37.71 
 
 		 334 aa  156  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  37.71 
 
 		 334 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  37.71 
 
 		 334 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  38.36 
 
 		 367 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  39.8 
 
 		 371 aa  156  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  41.61 
 
 		 358 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  39.04 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  34.42 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1214  transport system permease protein  35.59 
 
 		 342 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  37.01 
 
 		 346 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  37.01 
 
 		 346 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  37.2 
 
 		 355 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  38.32 
 
 		 352 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  41.96 
 
 		 351 aa  152  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3089  transport system permease protein  44.37 
 
 		 328 aa  152  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0785  transport system permease protein  37.67 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3637  transport system permease protein  39.43 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  normal  0.0127485 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  36.08 
 
 		 361 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  33.65 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  36.3 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  32.63 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0851  transport system permease protein  37.39 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  36.83 
 
 		 372 aa  149  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  34.44 
 
 		 368 aa  149  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2616  vtamin B12-transporter permease  35.74 
 
 		 335 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.788864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1720  vtamin B12-transporter permease  35.74 
 
 		 335 aa  149  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1828  vtamin B12-transporter permease  35.74 
 
 		 335 aa  149  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  37.21 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4295  transport system permease protein  41.99 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  40.14 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  36.77 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  41.03 
 
 		 370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  37.34 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 		 356 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3104  iron compound ABC transporter, permease protein  40.64 
 
 		 359 aa  147  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  35.16 
 
 		 369 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  37.34 
 
 		 347 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1711  transport system permease protein  38.73 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  41.89 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2423  transport system permease protein  41.61 
 
 		 347 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0291277 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  36.68 
 
 		 343 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  37.66 
 
 		 347 aa  146  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  39.07 
 
 		 353 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  40.14 
 
 		 338 aa  146  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003687  vitamin B12 ABC transporter permease component BtuC  36.57 
 
 		 337 aa  145  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  38.68 
 
 		 351 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4040  transport system permease protein  37.72 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  36.33 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  35.25 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  34.77 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3467  transport system permease protein  39.38 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743348  hitchhiker  0.00246309 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  39.04 
 
 		 343 aa  143  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  39.73 
 
 		 338 aa  143  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0961  transport system permease protein  38.11 
 
 		 343 aa  142  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1695  transport system permease protein  34.98 
 
 		 349 aa  143  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0857998  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1497  transport system permease protein  37.27 
 
 		 348 aa  142  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0836152  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  34.9 
 
 		 363 aa  142  7e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  37.81 
 
 		 367 aa  142  8e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  37.16 
 
 		 341 aa  142  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>