More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1002 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1002  transport system permease protein  100 
 
 		 333 aa  621  1e-177  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0258  transport system permease protein  69.76 
 
 		 334 aa  378  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.737096  normal  0.065439 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3048  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  54.66 
 
 		 358 aa  288  8e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2065  transport system permease protein  52.55 
 
 		 332 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2924  transport system permease protein  56.17 
 
 		 336 aa  272  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0561377  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0630  transport system permease protein  52.92 
 
 		 341 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.317375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0732  transport system permease protein  54.05 
 
 		 341 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0794  transport system permease protein  54.87 
 
 		 341 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6079  transport system permease protein  54.64 
 
 		 348 aa  257  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2739  transport system permease protein  52.63 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246804  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0490  transport system permease protein  58.17 
 
 		 333 aa  245  9e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176737  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3805  transport system permease protein  53.95 
 
 		 348 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1384  transport system permease protein  55.05 
 
 		 329 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.135151 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8244  transport system permease protein  53.61 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3730  transport system permease protein  55.84 
 
 		 341 aa  240  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2927  transport system permease protein  52.32 
 
 		 346 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4384  transport system permease protein  52.32 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.122979 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4254  transport system permease protein  54.87 
 
 		 329 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.325099 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3152  transport system permease protein  52.63 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1341  transport system permease protein  49.04 
 
 		 335 aa  233  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal  0.253719 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5678  transport system permease protein  52.45 
 
 		 342 aa  233  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1067  transport system permease protein  54.13 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.467913 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1828  transport system permease protein  54.49 
 
 		 333 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2404  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  54.13 
 
 		 329 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.716678  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1345  iron compound ABC transporter, permease protein  56.21 
 
 		 333 aa  228  9e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1304  iron compound ABC transporter, permease protein  56.21 
 
 		 349 aa  228  9e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0085  transport system permease protein  50.81 
 
 		 349 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2512  transport system permease protein  51.04 
 
 		 326 aa  218  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0510  transport system permease protein  50.53 
 
 		 333 aa  208  9e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531169 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  43.42 
 
 		 345 aa  182  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3089  transport system permease protein  48.21 
 
 		 328 aa  179  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1214  transport system permease protein  40 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0463  hemin permease  41.3 
 
 		 351 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  37.72 
 
 		 350 aa  170  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1188  transport system permease protein  49.82 
 
 		 320 aa  166  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3694  transport system permease protein  40.35 
 
 		 325 aa  166  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  36.54 
 
 		 350 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  38.73 
 
 		 334 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1075  putative iron transporter, membrane component  37.63 
 
 		 347 aa  162  8.000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803098  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  33.13 
 
 		 336 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  38.93 
 
 		 352 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  38.33 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  37.85 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  38.51 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1165  putative vitamin B12 transport system permease protein BtuC  33.53 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.320828  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  34.93 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6328  transport system permease protein  40.74 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  38.44 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1431  transport system permease protein  36.55 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  37.43 
 
 		 338 aa  156  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0785  transport system permease protein  35.61 
 
 		 340 aa  156  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  36.72 
 
 		 366 aa  155  7e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  37.72 
 
 		 361 aa  155  8e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  38.19 
 
 		 370 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  37.54 
 
 		 351 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0650  hemin transport system permease protein HmuU  32.29 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150325  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4223  transport system permease protein  38.93 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  39.01 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  34.65 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  34.64 
 
 		 343 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  37.06 
 
 		 345 aa  153  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  35.71 
 
 		 345 aa  153  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  38.17 
 
 		 350 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  32.83 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  35.84 
 
 		 368 aa  153  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  35.8 
 
 		 369 aa  152  5e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  35.69 
 
 		 333 aa  153  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1361  transport system permease protein  38.97 
 
 		 357 aa  152  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  32.52 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  32.52 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003687  vitamin B12 ABC transporter permease component BtuC  36.78 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0961  transport system permease protein  39.58 
 
 		 343 aa  151  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2321  transport system permease protein  39.46 
 
 		 346 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  35.94 
 
 		 351 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4784  transport system permease protein  38.59 
 
 		 353 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  32.52 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  32.52 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  32.52 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  32.52 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3189  iron compound ABC transporter, permease  35.94 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260495  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  32.52 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  32.52 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3206  transport system permease protein  35.92 
 
 		 345 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.949015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  37.9 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3486  iron compound ABC transporter, permease protein  35.02 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1928  transport system permease protein  38.6 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755913 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  38.3 
 
 		 354 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  37.72 
 
 		 363 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  37.74 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  36.82 
 
 		 355 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  37.77 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  33.23 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3246  iron compound ABC transporter, permease  34.7 
 
 		 338 aa  150  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3276  iron compound ABC transporter permease  35.02 
 
 		 338 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0883377  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3533  iron compound ABC transporter permease protein  35.02 
 
 		 338 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  35.33 
 
 		 355 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1711  transport system permease protein  39.49 
 
 		 335 aa  149  8e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3257  iron ABC transporter, permease protein, putative  37.1 
 
 		 336 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0747445  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  36.86 
 
 		 356 aa  149  9e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  34.9 
 
 		 363 aa  149  9e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>