More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3089 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3089  transport system permease protein  100 
 
 		 328 aa  601  1.0000000000000001e-171  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1002  transport system permease protein  48.21 
 
 		 333 aa  215  7e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2927  transport system permease protein  50.91 
 
 		 346 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3152  transport system permease protein  50.55 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2512  transport system permease protein  51.1 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3048  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  42.86 
 
 		 358 aa  197  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2924  transport system permease protein  47.5 
 
 		 336 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0561377  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2065  transport system permease protein  46.67 
 
 		 332 aa  195  9e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6079  transport system permease protein  48.06 
 
 		 348 aa  193  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3805  transport system permease protein  50 
 
 		 348 aa  192  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4384  transport system permease protein  49.1 
 
 		 331 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.122979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0732  transport system permease protein  43.65 
 
 		 341 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0258  transport system permease protein  50.18 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.737096  normal  0.065439 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8244  transport system permease protein  46.71 
 
 		 348 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0794  transport system permease protein  45.85 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2739  transport system permease protein  44.29 
 
 		 327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246804  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0630  transport system permease protein  42.81 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.317375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5678  transport system permease protein  48.21 
 
 		 342 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1384  transport system permease protein  46.23 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.135151 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0490  transport system permease protein  46.88 
 
 		 333 aa  173  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176737  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2404  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  46.56 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.716678  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  39.45 
 
 		 362 aa  170  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1067  transport system permease protein  46.56 
 
 		 329 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.467913 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  37.1 
 
 		 369 aa  169  7e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4254  transport system permease protein  45.14 
 
 		 329 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.325099 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3730  transport system permease protein  43.4 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  34.15 
 
 		 340 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  36.39 
 
 		 350 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  38.51 
 
 		 352 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  35.83 
 
 		 344 aa  163  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1341  transport system permease protein  44.2 
 
 		 335 aa  162  7e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal  0.253719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  40.06 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1711  transport system permease protein  39.31 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  33.54 
 
 		 333 aa  160  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  40.14 
 
 		 347 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0510  transport system permease protein  44.29 
 
 		 333 aa  159  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531169 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  42.11 
 
 		 347 aa  159  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  40.85 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  38.64 
 
 		 350 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1345  iron compound ABC transporter, permease protein  44.77 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1304  iron compound ABC transporter, permease protein  44.77 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  40.21 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  39.68 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  42.95 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  41.01 
 
 		 355 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1828  transport system permease protein  45.83 
 
 		 333 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3915  transport system permease protein  37.14 
 
 		 332 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  31.6 
 
 		 336 aa  156  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1214  transport system permease protein  37.25 
 
 		 342 aa  155  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0085  transport system permease protein  44.44 
 
 		 349 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2222  transport system permease protein  32.5 
 
 		 346 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.205591  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  39.93 
 
 		 370 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  36.36 
 
 		 368 aa  153  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  33.45 
 
 		 343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  34.02 
 
 		 367 aa  152  8e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  35.36 
 
 		 350 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  41.49 
 
 		 367 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  33.22 
 
 		 346 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  38.65 
 
 		 358 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  37.73 
 
 		 452 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  36.54 
 
 		 319 aa  151  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  40.49 
 
 		 347 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  38.27 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  35.99 
 
 		 361 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  37.58 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3257  iron ABC transporter, permease protein, putative  36.5 
 
 		 336 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0747445  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  39.93 
 
 		 371 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5101  transport system permease protein  37.23 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00326561  normal  0.03131 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  40.21 
 
 		 351 aa  150  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06009  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  39.64 
 
 		 323 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  38.52 
 
 		 343 aa  149  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  34.25 
 
 		 345 aa  149  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3206  transport system permease protein  38.58 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.949015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  33.67 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  35.92 
 
 		 344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1468  vtamin B12-transporter permease  40.07 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2005  vtamin B12-transporter permease  40.07 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.509358 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1833  vtamin B12-transporter permease  40.07 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.342268  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3095  transport system permease protein  35.6 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838837  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  35.47 
 
 		 353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  36.78 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1435  vtamin B12-transporter permease  40.07 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0354813 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2981  transport system permease protein  37.37 
 
 		 353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.861253  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1451  vtamin B12-transporter permease  40.07 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  38.89 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  33.9 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  33.9 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  39.05 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  32.62 
 
 		 360 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  33.9 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5389  transport system permease protein  36.23 
 
 		 346 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0238432  normal  0.284357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4784  transport system permease protein  39.36 
 
 		 353 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  40.36 
 
 		 325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  33.9 
 
 		 342 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  38.46 
 
 		 333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  35.67 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0463  hemin permease  36.77 
 
 		 351 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  33.9 
 
 		 342 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  33.9 
 
 		 342 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  38.02 
 
 		 322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>