More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2512 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2512  transport system permease protein  100 
 
 
326 aa  594  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2065  transport system permease protein  51.55 
 
 
332 aa  260  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5678  transport system permease protein  56.23 
 
 
342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6079  transport system permease protein  54.42 
 
 
348 aa  248  8e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4384  transport system permease protein  57.43 
 
 
331 aa  247  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.122979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3805  transport system permease protein  55.1 
 
 
348 aa  245  6e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1384  transport system permease protein  55.89 
 
 
329 aa  242  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.135151 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8244  transport system permease protein  54.76 
 
 
348 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3152  transport system permease protein  54.42 
 
 
346 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1002  transport system permease protein  51.92 
 
 
333 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292434  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2927  transport system permease protein  55.17 
 
 
346 aa  239  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0258  transport system permease protein  55.95 
 
 
334 aa  232  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.737096  normal  0.065439 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0510  transport system permease protein  52.58 
 
 
333 aa  229  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.531169 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3048  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  46.76 
 
 
358 aa  227  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0630  transport system permease protein  48.96 
 
 
341 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.317375  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0490  transport system permease protein  56.57 
 
 
333 aa  222  7e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176737  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0794  transport system permease protein  51.07 
 
 
341 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2404  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  55.56 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.716678  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1345  iron compound ABC transporter, permease protein  55.74 
 
 
333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1304  iron compound ABC transporter, permease protein  55.74 
 
 
349 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2924  transport system permease protein  49.16 
 
 
336 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0561377  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1067  transport system permease protein  55.22 
 
 
329 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.467913 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1828  transport system permease protein  53.75 
 
 
333 aa  219  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0732  transport system permease protein  46.58 
 
 
341 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2739  transport system permease protein  49.46 
 
 
327 aa  209  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246804  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4254  transport system permease protein  51.43 
 
 
329 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.325099 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1341  transport system permease protein  49.83 
 
 
335 aa  203  4e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal  0.253719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3694  transport system permease protein  41.89 
 
 
325 aa  200  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0085  transport system permease protein  48.62 
 
 
349 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813583  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3730  transport system permease protein  48.46 
 
 
341 aa  199  7e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  46.39 
 
 
356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  46.64 
 
 
358 aa  196  7e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  42.33 
 
 
370 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  38.08 
 
 
350 aa  189  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  46.5 
 
 
347 aa  189  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  42.04 
 
 
371 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  45.04 
 
 
354 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  45.71 
 
 
452 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1214  transport system permease protein  40.78 
 
 
342 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  41.06 
 
 
366 aa  186  6e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  49.29 
 
 
340 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  39.46 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0463  hemin permease  43.66 
 
 
351 aa  184  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3089  transport system permease protein  51.47 
 
 
328 aa  178  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  42.66 
 
 
356 aa  176  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  35.59 
 
 
337 aa  176  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  41.45 
 
 
367 aa  176  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  40.14 
 
 
338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2735  ABC transporter membrane spanning protein (hemin)  45.69 
 
 
361 aa  173  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1188  transport system permease protein  51.48 
 
 
320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  43.06 
 
 
345 aa  172  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  39.16 
 
 
318 aa  172  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  40.27 
 
 
355 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  41.81 
 
 
345 aa  172  6.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  45.04 
 
 
354 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  38.62 
 
 
346 aa  170  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  38.41 
 
 
355 aa  170  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  42 
 
 
370 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3915  transport system permease protein  42.66 
 
 
360 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.045675  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  39.22 
 
 
345 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  38.81 
 
 
330 aa  169  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  35.47 
 
 
330 aa  168  9e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  39.65 
 
 
361 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  39.78 
 
 
334 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  39.1 
 
 
330 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2493  corrinoid ABC transporter permease  41.32 
 
 
373 aa  168  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  38.54 
 
 
342 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  39.86 
 
 
334 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  35.35 
 
 
330 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  39.86 
 
 
334 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  38.89 
 
 
342 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  39.86 
 
 
334 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  36.21 
 
 
315 aa  167  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3206  transport system permease protein  40.36 
 
 
345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.949015  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  39.16 
 
 
363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1443  transport system permease protein  44.3 
 
 
365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0618013  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  38.57 
 
 
368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  38.81 
 
 
363 aa  166  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  36.05 
 
 
333 aa  166  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3257  iron ABC transporter, permease protein, putative  39.86 
 
 
336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0747445  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  39.09 
 
 
345 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  39.09 
 
 
345 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  39.09 
 
 
342 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2123  transport system permease protein  44.25 
 
 
366 aa  166  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  39.09 
 
 
342 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  40.82 
 
 
348 aa  165  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  41.58 
 
 
347 aa  165  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3104  iron compound ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 
359 aa  165  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  38.11 
 
 
342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3095  transport system permease protein  40 
 
 
340 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838837  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7223  transport system permease protein  44.82 
 
 
351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  39.32 
 
 
338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  39.32 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1165  putative vitamin B12 transport system permease protein BtuC  36.14 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.320828  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  38.57 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  39.32 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  39.32 
 
 
338 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  31.67 
 
 
336 aa  163  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3381  transport system permease protein  39.79 
 
 
351 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  41.11 
 
 
367 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>