More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_3048 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_3048  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  100 
 
 		 358 aa  669    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3730  transport system permease protein  85.63 
 
 		 341 aa  471  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0630  transport system permease protein  76.7 
 
 		 341 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.317375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0732  transport system permease protein  79.06 
 
 		 341 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0794  transport system permease protein  79.55 
 
 		 341 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0085  transport system permease protein  76.72 
 
 		 349 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2924  transport system permease protein  71.96 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0561377  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4254  transport system permease protein  75 
 
 		 329 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.325099 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1002  transport system permease protein  55.63 
 
 		 333 aa  291  8e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2065  transport system permease protein  55.63 
 
 		 332 aa  287  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0258  transport system permease protein  55.7 
 
 		 334 aa  262  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.737096  normal  0.065439 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1384  transport system permease protein  56.35 
 
 		 329 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.135151 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4384  transport system permease protein  53.97 
 
 		 331 aa  246  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.122979 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1067  transport system permease protein  56.29 
 
 		 329 aa  243  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.467913 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2404  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  55.96 
 
 		 329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.716678  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6079  transport system permease protein  51.8 
 
 		 348 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1828  transport system permease protein  53.97 
 
 		 333 aa  239  6.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0490  transport system permease protein  53.75 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176737  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1345  iron compound ABC transporter, permease protein  53.4 
 
 		 333 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1304  iron compound ABC transporter, permease protein  53.4 
 
 		 349 aa  231  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3152  transport system permease protein  46.28 
 
 		 346 aa  226  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3805  transport system permease protein  51.44 
 
 		 348 aa  227  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2927  transport system permease protein  49.64 
 
 		 346 aa  226  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8244  transport system permease protein  48.2 
 
 		 348 aa  225  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0510  transport system permease protein  50.53 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531169 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2739  transport system permease protein  46.32 
 
 		 327 aa  209  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246804  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5678  transport system permease protein  45.19 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2512  transport system permease protein  46.76 
 
 		 326 aa  206  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0463  hemin permease  45.16 
 
 		 351 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1341  transport system permease protein  42.55 
 
 		 335 aa  192  8e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal  0.253719 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1214  transport system permease protein  44.71 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  38.24 
 
 		 372 aa  187  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  34.12 
 
 		 336 aa  186  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  39.23 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  37.46 
 
 		 350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  41.1 
 
 		 370 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  37.14 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  36.23 
 
 		 338 aa  180  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  36.23 
 
 		 338 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  36.23 
 
 		 338 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  36.53 
 
 		 338 aa  179  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  35.93 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  36.23 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  36.23 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  36.23 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  36.23 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  36.19 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  38.29 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  39.43 
 
 		 368 aa  176  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  40.18 
 
 		 345 aa  176  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  41.88 
 
 		 354 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  39.62 
 
 		 351 aa  173  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  38.77 
 
 		 345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  36.23 
 
 		 338 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  39.22 
 
 		 330 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  32.84 
 
 		 337 aa  172  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  35.41 
 
 		 347 aa  172  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  38.76 
 
 		 345 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  37.39 
 
 		 356 aa  169  7e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  37.46 
 
 		 350 aa  169  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  35.63 
 
 		 338 aa  169  8e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3694  transport system permease protein  39.51 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  41.64 
 
 		 338 aa  169  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  40.68 
 
 		 358 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1711  transport system permease protein  40.79 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  34.38 
 
 		 331 aa  166  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  38.56 
 
 		 351 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  39.86 
 
 		 362 aa  166  6.9999999999999995e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  32.95 
 
 		 367 aa  166  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  39.19 
 
 		 383 aa  166  8e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  38.08 
 
 		 362 aa  165  9e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  36.08 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  35.11 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4152  transport system permease protein  42.15 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  37.38 
 
 		 357 aa  164  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  36.56 
 
 		 343 aa  164  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  36.61 
 
 		 368 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  38.25 
 
 		 334 aa  162  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3089  transport system permease protein  43.61 
 
 		 328 aa  162  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  37.13 
 
 		 355 aa  162  9e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  40.17 
 
 		 354 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  41.51 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1431  transport system permease protein  36.84 
 
 		 312 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3843  transport system permease protein  41.4 
 
 		 349 aa  161  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  35.45 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  37.72 
 
 		 350 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1985  transport system permease protein  36.14 
 
 		 348 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181756  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  34.97 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0785  transport system permease protein  34.43 
 
 		 340 aa  159  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 		 352 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  36.84 
 
 		 315 aa  159  7e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1165  putative vitamin B12 transport system permease protein BtuC  34.3 
 
 		 328 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.320828  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  33.52 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  36.28 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0179  transport system permease protein  36.86 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  36.87 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  37.07 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  37.07 
 
 		 336 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3674  hemin ABC transporter, permease protein  38.94 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  33.75 
 
 		 352 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>