More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3637 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3637  transport system permease protein  100 
 
 
340 aa  661    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  normal  0.0127485 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2826  transport system permease protein  69.61 
 
 
347 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3523  transport system permease protein  69.81 
 
 
341 aa  384  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19090  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  66.12 
 
 
355 aa  368  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0971068 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3060  transport system permease protein  66.23 
 
 
392 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.209365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4295  transport system permease protein  59.21 
 
 
347 aa  360  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2318  transport system permease protein  60.18 
 
 
347 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3332  transport system permease protein  65.54 
 
 
346 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.3708 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3415  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  66.56 
 
 
334 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.533085  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2086  transport system permease protein  50.15 
 
 
332 aa  281  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.180942  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2581  transport system permease protein  52.1 
 
 
351 aa  277  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.474869  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  46.6 
 
 
334 aa  255  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  43.03 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1326  transport system permease protein  46 
 
 
358 aa  248  9e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0395439  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3730  transport system permease protein  43.12 
 
 
350 aa  246  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  46.49 
 
 
347 aa  244  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3467  transport system permease protein  44.88 
 
 
341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743348  hitchhiker  0.00246309 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  44.93 
 
 
351 aa  242  6e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1241  transport system permease protein  46.08 
 
 
353 aa  241  9e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00596239  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5336  transport system permease protein  42.41 
 
 
347 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  43.31 
 
 
350 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  42.04 
 
 
344 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  40.92 
 
 
340 aa  238  9e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  40.92 
 
 
334 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0851  transport system permease protein  40.58 
 
 
351 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  40.62 
 
 
340 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  40.62 
 
 
340 aa  236  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  40.92 
 
 
334 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  40.62 
 
 
334 aa  236  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1497  transport system permease protein  43.12 
 
 
348 aa  236  6e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0836152  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37320  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  48.74 
 
 
374 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  45.76 
 
 
322 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  45.76 
 
 
322 aa  232  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3734  transport system permease protein  48.2 
 
 
363 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3934  transport system permease protein  47.42 
 
 
352 aa  229  6e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0684  iron compound ABC transporter, permease protein  40.62 
 
 
334 aa  229  7e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  40.31 
 
 
334 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2438  transport system permease protein  45.99 
 
 
363 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0644  transport system permease protein  40.97 
 
 
342 aa  227  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0530  transport system permease protein  40.62 
 
 
334 aa  226  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00110825  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  40.31 
 
 
334 aa  227  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0338  ABC-type Fe3+-siderophore transport system inner membrane subunit  48.54 
 
 
366 aa  225  9e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  41.91 
 
 
333 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4083  transport system permease protein  41.49 
 
 
335 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00175195  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  41.64 
 
 
340 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4040  transport system permease protein  39.26 
 
 
344 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0425  transport system permease protein  41.41 
 
 
335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.639871 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2423  transport system permease protein  43.35 
 
 
347 aa  220  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0291277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2689  transport system permease protein  46.23 
 
 
332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0405482  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4289  transport system permease protein  47.48 
 
 
354 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993131  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  40.51 
 
 
329 aa  215  8e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  41.88 
 
 
336 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0356  transport system permease protein  44.16 
 
 
353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3070  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.07 
 
 
341 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.251798 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2553  transport system permease protein  46.43 
 
 
366 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0828136  normal  0.763173 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3758  transport system permease protein  45.51 
 
 
364 aa  210  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2742  transport system permease protein  46.08 
 
 
366 aa  209  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00162968  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  39.94 
 
 
329 aa  209  6e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2206  transport system permease protein  44.66 
 
 
344 aa  209  8e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0665344  hitchhiker  0.000185763 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36340  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  41.8 
 
 
368 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7290  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  40.91 
 
 
342 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22080  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  44.37 
 
 
335 aa  207  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.158837 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5748  transport system permease protein  39.8 
 
 
337 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1122  iron-enterobactin transporter membrane protein  41.5 
 
 
338 aa  206  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.122202  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  37.01 
 
 
351 aa  205  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  37.01 
 
 
351 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5055  transport system permease protein  40.72 
 
 
333 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  37.01 
 
 
351 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  35.96 
 
 
351 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  36.75 
 
 
351 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  35.96 
 
 
351 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3424  iron-enterobactin transporter membrane protein  37.73 
 
 
357 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.320644  normal  0.302372 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  36.45 
 
 
351 aa  203  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  36.58 
 
 
350 aa  203  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  36.45 
 
 
351 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  37.43 
 
 
343 aa  202  6e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0414  transport system permease protein  43.75 
 
 
335 aa  200  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3528  transport system permease protein  41.42 
 
 
336 aa  200  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0903182  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00557  iron-enterobactin transporter subunit  42.16 
 
 
334 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00546  hypothetical protein  42.16 
 
 
334 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06480  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  45 
 
 
346 aa  199  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368243  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  42.16 
 
 
334 aa  199  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3054  iron-enterobactin transporter membrane protein  42.16 
 
 
334 aa  199  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  42.16 
 
 
334 aa  199  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  39.56 
 
 
332 aa  199  6e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3138  transport system permease protein  44.32 
 
 
332 aa  199  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00514347  normal  0.079989 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3036  transport system permease protein  42.16 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0675  iron-enterobactin transporter membrane protein  41.83 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0641  iron-enterobactin transporter membrane protein  41.83 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0492  iron-enterobactin transporter membrane protein  41.83 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3151  transport system permease protein  41.35 
 
 
354 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00069111  hitchhiker  0.00000000474317 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1623  transport system permease protein  42.28 
 
 
354 aa  196  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2492  transport system permease protein  39.46 
 
 
340 aa  195  8.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.3582 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0645  iron-enterobactin transporter membrane protein  40.73 
 
 
335 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.997729  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2013  transport system permease protein  40.07 
 
 
343 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0139655  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0704  iron-enterobactin transporter membrane protein  43.54 
 
 
335 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.525621  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2748  transport system permease protein  40.67 
 
 
335 aa  192  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0750  iron-enterobactin transporter membrane protein  43.54 
 
 
335 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0631  iron-enterobactin transporter membrane protein  43.54 
 
 
335 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0688  iron-enterobactin transporter membrane protein  43.54 
 
 
335 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.690213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>